Produksi Pigmen dan Identifikasi Kapang Penghasilnya Menggunakan Pendekatan DNA Barcoding

Kapang endofit laut diketahui sebagai sumber berbagai senyawa bioaktif yang berguna bagi kesehatan. Penelitian yang telah dilakukan sebelumnya membuktikan bahwa kapang endofit isolat RS3 asal tanaman pesisir <em>Hydnophytum formicarum</em> asal Sorong menghasilkan pigmen hitam dengan potensi sebagai fotoprotektor namun pada penelitian tersebut tidak memiliki data mengenai produksi pigmen serta identifikasi kapang penghasilnya. Penelitian ini bertujuan untuk menentukan produksi pigmen hitam asal kapang RS3 dan identifikasi kapang RS3 melalui pendekatan DNA barcoding. Kapang RS3 dikultivasi selama 30 hari menggunakan sistem statis dan sistem shaking. DNA barcoding pada identifikasi kapang<br />RS3 menggunakan primer universal ITS1 dan ITS4 untuk mengamplifikasi wilayah <em>internal transcribed space</em>r (ITS) yang menjadi conserve region pada kingdom fungi. Hasil penelitian menunjukkan bahwa kapang RS3 yang dikultivasi menggunakan sistem shaking mulai memproduksi pigmen pada hari-6 dan mencapai produksi tertinggi pada hari ke-18 (2,42±0,03 mg/L) sedangkan pada kultivasi sistem statis rendemen pigmen terbesar dihasilkan pada hari ke-30 (2,88±0,21 mg/L). Berdasarkan hasil analsis ITS rDNA diketahui bahwa kapang endofit RS3 memiliki 99% kemiripan dengan Annulohypoxylon stygium. Kapang ini telah didaftarkan di GeneBank denga nomer akses MG605083.1.<br /><br />

ISOLATION OF FLAVONOID 3’5’HYDROXILASE GENE FROM SNAKEWEED (Stachytarpheta indica auct. non. (L.) Vahl)

Stachytarpheta is one of Indonesian medicinal plants which have a wide species diversity. The bioactive component in snakeweed herb including naringenin, flavonol, and flavon are mainly derivate from phenyl propanoid (flavonoid). The gene encodes F3’5’Hydroxilation (F3’5H) involved in the biosynthesis of flavonoid product, by means of catalysis hydroxylation on the C atom #3 and #5 of benzene ring. Recently, has not yet meet publication about F3’5’H from snakeweed herb. The aim of this study was to isolate F3’5H gene from Stachytarpheta indica, using primers which were designed from conserve region of Petunia hybrida F3’5’H gene; HF1 and HF2 alleles. Forward primer is 5'-TGATGCTGCTAAAGCATTCT-3' and reverse primer is 5’GTGCACGCAGGTGACATATG-3’. The amplified fragments were un-specific non-consensus sequences, suggested that two homolog gene locus were isolated. Sequence analysis showed that both share two different domains; conserve-upstream and homolog-downstream domains. It is suggested that Stachytarpheta indica may possesses different alleles for F3’5’H, i.e. HF1 and HF2, as of Petunia hybrida. Keywords: F3’5’H gene, Stachytarpheta indica, snakeweed