Chromosome-Level Comprehensive Genome of Mangrove Sediment-Derived Fungus Penicillium variabile HXQ-H-1

Penicillium is an ascomycetous genus widely distributed in the natural environment and is one of the dominant fungi involved in the decomposition of mangroves, which can produce a variety of antitumor compounds and bioactive substances. However, in mangrove ecosystems there is no complete genome in this genus. In this study, we isolated a fungus strain named Penicillium variabile HXQ-H-1 from coast mangrove (Fujian Province, China). We generated a chromosome-level genome with total size of 33.32 Mb, scaffold N50 of 5.23 Mb and contig N50 of 96.74 kb. Additionally, we anchored about 95.91% assembly sequences into the longest seven scaffolds, and predicted 10,622 protein-coding genes, in which 99.66% could be annotated by eight protein databases. The secondary metabolites analysis reveals the strain has various gene clusters involving polyketide synthase (PKS), non-ribosomal peptide synthetase (NRPS) and terpene synthase that may have a largely capacity of biotechnological potential. Comparison genome analysis between Penicillium variabile and Talaromyces islandicus reveals a small difference in the total number of genes, whereas HXQ-H-1 has a higher gene number with COG functional annotation. Evolutionary relationship of Penicillum based on genome-wide data was carried out for the first time, showing the strain HXQ-H-1 is closely related to Talaromyces islandicus. This genomic resource may provide a new resource for development of novel bioactive antibiotics, drug candidates and precursors in Penicillium variabile.

Khả năng chịu acid, kháng và hấp thụ nhôm của nấm mốc phân lập từ đất trồng chè vùng Tân Cương, Thái Nguyên

Từ các mẫu đất trồng chè vùng Tân Cương, Thái Nguyên, 16 chủng nấm mốc có khả năng chịu acid và kháng nhôm đã được phân lập trên môi trường Hansen thạch đĩa (pH 3,0) chứa nhôm với nồng độ 100 mg L-1. Trong đó, hai chủng nấm mốc ký hiệu F8 và F13 có thể phát triển tốt trên môi trường Hansen thạch đĩa (pH 3,0) chứa nhôm với nồng độ lên đến 700 mg L-1. Các phân tích về đặc điểm hình thái và trình tự nucleotide của các gen 28S rDNA đã chỉ ra rằng chủng F8 thuộc loài Eupenicillium javanicum, trong khi chủng F13 thuộc loài Penicillium variabile. Các khảo sát tiếp theo đã cho thấy cả hai chủng nấm mốc F8 và F13 có thể phát triển tốt trong môi trường Hansen dịch thể chứa nhôm với nồng độ 100 mg L-1 tại các giá trị pH 2,2- 5,0 và với nồng độ 500- 2.000 mg L-1 tại pH 2,4. Sau 7 ngày nuôi cấy trên máy lắc ổn nhiệt tại 30oC, 150 vòng/phút, hiệu suất hấp thụ nhôm từ môi trường Hansen dịch thể chứa nhôm với nồng độ 2.000 mg L-1 (pH 2,4) của chủng F8 đạt 92,06% và chủng F13 đạt 86,88%. Vì vậy, hai chủng Eupenicillium javanicum F8 và Penicillium variabile F13 được cho là có tiềm năng trong cải thiện đất trồng chè bị acid hoá bằng cách giảm thiểu hàm lượng nhôm linh động trong đất, đảm bảo năng suất cũng như chất lượng của sản phẩm chè.