median networks
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2019 ◽  
Author(s):  
◽  
Marisol Elisabet Schwab

En este trabajo de tesis se analizó la variación en linajes maternos (ADN mitocondrial) y paternos (región no recombinante del cromosoma Y) en muestras poblacionales de las ciudades capitales de las provincias de Santiago del Estero y Tucumán. El objetivo principal fue ampliar el conocimiento existente sobre la diversidad filética, el origen continental y la estructuración geográfica de los linajes paternos y maternos en poblaciones cosmopolitas actuales del Argentina. Además, la estrategia de muestreo estuvo orientada a indagar si el nivel socio-económico promedio de las subpoblaciones tenía algún impacto sobre las frecuencias de origen continental remoto, por lo que se tomaron muestras en centros de salud/laboratorios públicos y privados. Al igual que en el resto del noreste y centro-oeste del país, las poblaciones estudiadas presentaron una alta incidencia de linajes maternos nativo-americanos con frecuencias de entre 65 y 91%, y una mayor preponderancia de linajes paternos alóctonos con frecuencias de entre 90 y 98%. Los linajes maternos, además, mostraron estructuración socio-económica, con un aumento del componente nativo en los centros de salud públicos respecto de los privados, siendo la diferencia mucho más marcada en Tucumán (27%) que en Santiago del Estero (10%). El patrón de frecuencias de haplogrupos de linajes paternos alóctonos fue, como ya se ha descripto para otras ciudades argentinas, similar al de poblaciones de Europa Occidental, con la notable excepción de la muestra del laboratorio privado de San Miguel de Tucumán, en la que es posible detectar el efecto de una mayor contribución relativa de origen árabe. Se obtuvieron 83 secuencias de la región control completa del ADNmt de cada localidad, y se analizaron 14 polimorfismos diagnóstico de sub-haplogrupos de la región codificante en linajes A2, B2 y C1d en un total de 14 poblaciones del noroeste y centro-oeste de Argentina. El análisis de 1393 secuencias en conjunto con los polimorfismos de la región codificante permitió definir clados monofiléticos de alta resolución. Se construyeron median networks para todos los haplogrupos, y se exploraron los patrones de distribución geográfica de los clados de mayor relevancia. Quedó en evidencia la alta frecuencia y notable diversificación interna del sub- haplogrupo C1d1b, de probable origen local. El análisis de barreras genéticas indicó que Santiago del Estero y San Miguel de Tucumán comparten un espacio de menor diferenciación genética con las localidades riojanas y sanjuaninas.


Author(s):  
Andreas Bertsch ◽  
Gerhard K. H. Przemeck ◽  
Martin Hrabé de Angelis

Ein Alignment von 168 Sequenzen mitochondrialer DNA von Bombus cryptarum liefert 29 Haplotypen. Ein Median-Network zeigt fünf klar abgrenzbare Cluster, die Haplogruppen (HG) A-E, die durch diagnostische Positionen definiert werden. Vier dieser HG lassen sich bekannten Taxa zuordnen HG-A = B. cryptarum cryptarum, HG-B = B. cryptarum florilegus, HG-D = B. cryptarum albocinctus, und HG-E = B. cryptarum moderatus. Die Haplogruppe C entspricht einem neuen Taxon B. cryptarum pallidocinctus im Rang einer Unterart. Diese neue Unterart wird beschrieben. Die Verbreitung der Eurasiatischen Taxa wird untersucht und die Folgerungen aus Median-Network und geographischer Verbreitung für die mögliche Phylogenie werden diskutiert.StichwörterHymenoptera, Apidae, Bombus, mitochondrial DNA, new subspecies, geographic distributionNomenklatorische Handlungencryptarum pallidocinctus Bertsch et al., 2014 (Bombus), subspec. n.


2014 ◽  
Vol 55 (2) ◽  
pp. 115-120 ◽  
Author(s):  
Bettina Zimmermann ◽  
Alexander W. Röck ◽  
Arne Dür ◽  
Walther Parson

2011 ◽  
Vol 159 (15) ◽  
pp. 1608-1616 ◽  
Author(s):  
Konrad Schwarz ◽  
Arne Dür
Keyword(s):  

2009 ◽  
Vol 99 (6) ◽  
pp. 583-591 ◽  
Author(s):  
J.H. Calvo ◽  
C. Calvete ◽  
A. Martinez-Royo ◽  
R. Estrada ◽  
M.A. Miranda ◽  
...  

AbstractCulicoides imicola is the main vector for bluetongue (BT) and African horse sickness (AHS) viruses in the Mediterranean basin and in southern Europe. In this study, we analysed partial mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I (COI) gene to characterize and confirm population expansion of Culicoides imicola across Spain. The data were analysed at two hierarchical levels to test the relationship between C. imicola haplotypes in Spain (n=215 from 58 different locations) and worldwide (n=277). We found nineteen different haplotypes within the Spanish population, including 11 new haplotypes. No matrilineal subdivision was found within the Spanish population, while western and eastern Mediterranean C. imicola populations were very structured. These findings were further supported by median networks and mismatch haplotype distributions. Median networks demonstrated that the haplotypes we observed in the western Mediterranean region were closely related with one another, creating a clear star-like phylogeny separated only by a single mutation from eastern haplotypes. The two, genetically distinct, sources of C. imicola in the Mediterranean basin, thus, were confirmed. This type of star-like population structure centred around the most frequent haplotype is best explained by rapid expansion. Furthermore, the proposed northern expansion was also supported by the statistically negative Tajima's D and Fu's Fs values, as well as predicted mismatch distributions of sudden and spatially expanding populations. Our results thus indicated that C. imicola population expansion was a rapid and recent phenomenon.


2001 ◽  
Vol 19 (2) ◽  
pp. 302-310 ◽  
Author(s):  
Katharina T Huber ◽  
Vincent Moulton ◽  
Peter Lockhart ◽  
Andreas Dress
Keyword(s):  

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