scholarly journals Serotypes and antimicrobial resistance patterns of Salmonella enterica subsp. enterica in pork and related fresh-vegetable servings among pork outlets in Kampala, Uganda

Author(s):  
Dickson Ndoboli ◽  
Kristina Roesel ◽  
Martin Heilmann ◽  
Thomas Alter ◽  
Peter-Henning Clausen ◽  
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L’objectif de l’étude était de caractériser les sérotypes et les profils phénotypiques de résistance aux antibiotiques, et de typer les plasmides de 55 isolats de Salmonella enterica subsp. enterica isolés dans différentes matrices provenant de 77 points de vente de porc à Kampala, en Ouganda. Sept différents serovars ont été identifiés : Enteritidis (60,0 %), Offa (10,9 %), Gallinarum (7,3 %), Arechavaleta (monophasique) (7,3 %), Zanzibar (7,3 %), Kampala (5,4 %), et Saintpaul (1,8 %). La majorité des isolats provenaient de porc cru (40,0 %) mais on en trouvait aussi dans des mouches (27,3 %), des légumes frais (18,2 %), de l’eau (12,7 %) et du porc grillé (1,8 %). Tous les isolats sauf un (98 %) ont montré une résistance à au moins un antibiotique parmi les 22 testés. Le plus haut niveau de résistance a été observé avec la céfazoline (95 %) et le céfotaxime (93 %), un niveau intermédiaire a été observé avec la ciprofloxacine (58 %), le chloramphénicol (58 %) et l’amoxicilline/acide clavulanique (56 %). La majorité des isolats étaient sensibles à la lévofloxacine (75 %), au sulfaméthoxazole-triméthoprime (80 %) et à l’ofloxacine (96 %). La caractérisation des souches par le typage des réplicons, une technique basée sur la PCR, a détecté les réplicons FIA, FIB, FIC, HI1, HI2, I1-1ᵞ, L/M, N, P, W, T, A/C, K, B/O, X, Y, F et FIIA. Six groupes de réplicons (FIA, W, FIC, FIB, P, and Y) ont été identifiés dans 53 des 55 isolats (96,4 %), et plus d’un groupe a été trouvé dans 42 isolats différents. Alors que le nombre moyen de groupes de réplicons par souche était bas (2,6), le taux de résistance phénotypique est resté élevé, ce qui implique que certaines souches semblent encoder des résistances sur les chromosomes ou sur les plasmides non détectés, respectivement. Les sources de résistance aux antibiotiques ainsi que les causes potentielles liées aux systèmes d’élevage et à la médecine humaine doivent être identifiées pour protéger la santé publique en Ouganda.

2021 ◽  
Vol 9 (5) ◽  
pp. 952
Author(s):  
Nure Alam Siddiky ◽  
Md Samun Sarker ◽  
Md. Shahidur Rahman Khan ◽  
Ruhena Begum ◽  
Md. Ehsanul Kabir ◽  
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Virulent and multi drug resistant (MDR) Salmonellaenterica is a foremost cause of foodborne diseases and had serious public health concern globally. The present study was undertaken to identify the pathogenicity and antimicrobial resistance (AMR) profiles of Salmonellaenterica serovars recovered from chicken at wet markets in Dhaka, Bangladesh. A total of 870 cecal contents of broiler, sonali, and native chickens were collected from 29 wet markets. The overall prevalence of S. Typhimurium, S. Enteritidis, and untyped Salmonella spp., were found to be 3.67%, 0.57%, and 1.95% respectively. All isolates were screened by polymerase chain reaction (PCR) for eight virulence genes, namely invA, agfA, IpfA, hilA, sivH, sefA, sopE, and spvC. S. Enteritidis isolates carried all virulence genes whilst S. Typhimurium isolates carried six virulence genes except sefA and spvC. A diverse phenotypic and genotypic AMR pattern was found. Harmonic descending trends of resistance patterns were observed among the broiler, sonali, and native chickens. Interestingly, virulent and MDR Salmonella enterica serovars were found in native chicken, although antimicrobials were not used in their production cycle. The research findings anticipate that virulent and MDR Salmonella enterica are roaming in the wet markets which can easily anchor to the vendor, consumers, and in the food chain.


Antibiotics ◽  
2020 ◽  
Vol 9 (10) ◽  
pp. 660
Author(s):  
Xuebin Xu ◽  
Silpak Biswas ◽  
Guimin Gu ◽  
Mohammed Elbediwi ◽  
Yan Li ◽  
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Salmonella spp. are recognized as important foodborne pathogens globally. Salmonella enterica serovar Rissen is one of the important Salmonella serovars linked with swine products in numerous countries and can transmit to humans by food chain contamination. Worldwide emerging S. Rissen is considered as one of the most common pathogens to cause human salmonellosis. The objective of this study was to determine the antimicrobial resistance properties and patterns of Salmonella Rissen isolates obtained from humans, animals, animal-derived food products, and the environment in China. Between 2016 and 2019, a total of 311 S. Rissen isolates from different provinces or province-level cities in China were included here. Bacterial isolates were characterized by serotyping and antimicrobial susceptibility testing. Minimum inhibitory concentration (MIC) values of 14 clinically relevant antimicrobials were obtained by broth microdilution method. S. Rissen isolates from humans were found dominant (67%; 208/311). S. Rissen isolates obtained from human patients were mostly found with diarrhea. Other S. Rissen isolates were acquired from food (22%; 69/311), animals (8%; 25/311), and the environment (3%; 9/311). Most of the isolates were resistant to tetracycline, trimethoprim-sulfamethoxazole, chloramphenicol, streptomycin, sulfisoxazole, and ampicillin. The S. Rissen isolates showed susceptibility against ceftriaxone, ceftiofur, gentamicin, nalidixic acid, ciprofloxacin, and azithromycin. In total, 92% of the S. Rissen isolates were multidrug-resistant and ASSuT (27%), ACT (25%), ACSSuT (22%), ACSSuTAmc (11%), and ACSSuTFox (7%) patterns were among the most prevalent antibiotic resistance patterns found in this study. The widespread dissemination of antimicrobial resistance could have emerged from misuse of antimicrobial agents in animal husbandry in China. These findings could be useful for rational antimicrobial usage against Salmonella Rissen infections.


Food Control ◽  
2021 ◽  
Vol 121 ◽  
pp. 107590
Author(s):  
Federica Giacometti ◽  
Annalisa Pezzi ◽  
Giorgio Galletti ◽  
Marco Tamba ◽  
Giuseppe Merialdi ◽  
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2010 ◽  
Vol 4 (12) ◽  
pp. 804-809 ◽  
Author(s):  
Farida Ohmani ◽  
Khadija Khedid ◽  
Saad Britel ◽  
Aicha Qasmaoui ◽  
Reda Charof ◽  
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Introduction: Salmonella enterica is recognised worldwide as one of the major agents of human gastrointestinal infections. The aim of the present work is to ascertain the antimicrobial susceptibilities of 150 Salmonella enterica serovar Enteritidis isolates from humans in Morocco during the period from 2000 to 2008. Methodology: Antimicrobial resistance determination was performed by disk diffusion method using seven antibiotics. The minimal inhibitory concentration (MIC) of ciprofloxacin was determined for nalidixic acid-resistant (NAR) isolates using E-test strips. Results: Sixty-one (42%) isolates were resistant to at least one class of antimicrobial agent. The largest numbers of resistant isolates were observed for nalidixic acid with 53 isolates (36%) followed by ampicillin with 7 isolates (5%), tetracycline with 6 isolates (4%), and trimethoprim/sulfamethoxazole with 2 isolates (1%).The resistant isolates were grouped in seven different resistance patterns of which two isolates were resistant to three antibiotics. Among the 53 (36%) NAR isolates, 37 (76%) had a reduced susceptibility to ciprofloxacin. Conclusion: Resistance rates of Salmonella enterica serovar Enteritidis from Morocco are generally low but the resistance to nalidixic acid is worryingly common. Continual surveillance of antibiotic resistance is of primary importance.


2019 ◽  
Vol 14 (2) ◽  
pp. 14-21
Author(s):  
Abdoulaye Makanera ◽  
S Sidibe ◽  
A Camara ◽  
LB Camara ◽  
M Conde ◽  
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Introduction : Les infections à Pseudomonas constituent un réel problème de santé publique mondiale.L'objectif de cette étude était de déterminer les espèces de Pseudomonas isolées de diverses secrétionsbiologiques ainsi que leur sensibilité aux antibiotiques. Matériel et méthodes : Il s'agit d'une étuderétrospective réalisée à l'Hôpital de l'Amitié Sino-Guinéenne de Juin 2014 à Juin 2018. Les cultures ont étéfaites sur milieux gélosés. L'identification bactérienne, les antibiogrammes et la détermination desconcentrations minimales inhibitrices (CMI) ont été faites à l'automate Vitek2 Compact 15. Résultats :Soixante-quinze souches de Pseudomonas ont été identifiées : Pseudomonas aeruginosa (44), de Pseudomonasluteola (15), Pseudomonas fluorescens (13), Pseudomonas mendocina (1), Pseudomonas oryzihabitans (1) etPseudomonas putida (1). L'âge moyen des patients était de 49,12±23,48 ans [18 jours-90 ans]. Le sexe-ratio(M/F) = 0,875. La majorité des souches étaient sensibles à l'imipénème (93,33%), l'amikacine (88,00%), lagentamicine (72,00%), la tobramycine (70,66%), piperacilline/tazobactam (70,66%), la ceftazidime (60,00%),céfotaxime (54,66%), à l'ofloxacine (57,33%) et la ciprofloxacine (58,66%). En revanche, ces souches étaientrésistantes à l'ampicilline (89,33%), triméthoprime/sulfaméthoxazole (89,33%), l'acide nalidixique (85,33%), lacéfalotine (77,33%), la ticarcilline (68,00%), la cefoxitine (64,00%), et la nitrofurantoine (57,33%). Des cas demulti-résistance aux antibiotiques ont été observés avec CMI élevées. Particulièrement, une souche dePseudomonas aeruginosa désignée N°64 était multi-résistante à tous les d'antibiotiques testés. Conclusion : Sixespèces de Pseudomonas ont été identifiées avec des phénotypes de multi-résistance aux antibiotiqueshabituellement utilisés en Guinée.


Author(s):  
Rosine Manishimwe ◽  
Martin Buhire ◽  
Alexie Uyisunze ◽  
Jean Bosco Turikumwenayo ◽  
Michael Tukei

La résistance aux antibiotiques est devenue une préoccupa­tion de santé publique mondiale car un grand nombre de bactéries résistantes émergent continuellement. Les animaux ont été signalés comme l’une des sources de bactéries résistantes aux antibiotiques qui peuvent être transférées aux humains. Afin d’enrichir les données sur la résistance aux antibiotiques chez les animaux au Rwanda, une étude transversale a été menée dans la province de l’Est et dans la ville de Kigali pour isoler Escherichia coli présent dans des élevages de volailles en plein air et dans des élevages commerciaux. Des échan­tillons de matières fécales ont été prélevés dans 294 fermes avicoles et des souches d’E. coli ont été isolées et identifiées. Au total, 241 isolats d’E. coli ont été soumis à un test de sen­sibilité aux antibiotiques en utilisant cinq antibiotiques (gen­tamicine, streptomycine, rifampicine, doxycycline et érythro­mycine). L’utilisation d’antibiotiques chez les volailles était faible dans les élevages de volaille en plein air (30,9 %) com­parativement aux élevages de poules pondeuses et de pou­lets de chair (100 %). Parmi les 151 éleveurs qui ont déclaré utiliser des antibiotiques chez les volailles, près de la moitié (49,7 %) ont toujours utilisé des antibiotiques sur ordonnance vétérinaire. Sur les 241 isolats d’E. coli, 43,2 % présentaient une résistance multiple à quatre des cinq antibiotiques testés. Presque tous les isolats (98,8 %) étaient résistants à l’érythro­mycine, 78,8 % étaient résistants à la streptomycine, 77,6 % étaient résistants à la doxycycline, 69,3 % étaient résistants à la rifampicine et quelques-uns seulement étaient résistants à la gentamicine (3,7 %). Aucune différence significative statis­tiquement n’a été observée en ce qui concerne la résistance des isolats aux antibiotiques selon le type de système d’éle­vage. Toutefois, la résistance des isolats à la doxycycline a été significativement plus élevée dans les fermes où l’utilisa­tion d’antibiotiques a été signalée (84 %) que dans les fermes où l’utilisation d’antibiotiques n’a pas été signalée (70 %). La résistance aux antibiotiques d’E. coli observée montre l’exis­tence d’une source potentielle de résistance qui peut être transférée aux bactéries pathogènes et avoir un impact sur les humains et les animaux.


Author(s):  
Eric Cardinale ◽  
Jacques-Albert Dromigny ◽  
F. Tall ◽  
Mamadou Ndiaye ◽  
M. Konté ◽  
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La résistance de Campylobacter aux antibiotiques constitue aujourd’hui un problème émergent de santé publique dans les pays industrialisés, mais, en revanche, peu d’informations sont disponibles sur le sujet dans les pays en développement. Pour évaluer la sensibilité des souches de Campylobacter au Sénégal, des prélèvements de peau ont été réalisés sur 250 carcasses de poulet entre janvier 2001 et octobre 2002. Parmi les 204 souches de Campylobacter isolées, deux espèces ont été identifiées : C. jejuni (59 p. 100) et C. coli (41 p. 100). La sensibilité in vitro à cinq antibiotiques (amoxicilline, amoxicilline et acide clavulanique, erythromycine, acide nalidixique et ciprofloxacine) a été déterminée par la méthode du E-test. L’étude des concentrations minimales inhibitrices (CMI) a montré que 34 p. 100 des isolats étaient résistants à la ciprofloxacine avec un haut niveau de résistance (CMI ≥ 32 mg/l) dans 25 p. 100 des deux espèces. Une résistance croisée entre l’acide nalidixique et la ciprofloxacine a été constatée dans 96 p. 100 des souches résistantes aux quinolones. Le niveau de résistance à l’amoxicilline a été statistiquement plus important pour C. coli que pour C. jejuni (20,2 p. 100 contre 10,8 p. 100) mais toutes les souches ont été sensibles à l’association amoxicilline-acide clavulanique. Les deux espèces ont présenté une faible résistance à l’érythromycine. Un phénotype de multirésistance à trois des antibiotiques testés a été identifié dans 9,8 p. 100 des souches : 15,5 p. 100 pour C. coli et 5,8 p. 100 pour C. jejuni. Aucune souche ne s’est avérée résistante à quatre antibiotiques ou plus. Des études complémentaires apparaissent nécessaires pour évaluer la résistance aux antibiotiques des Campylobacter isolés chez l’homme et chez l’animal afin de contrôler l’émergence de nouvelles souches multirésistantes au Sénégal.


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