scholarly journals Дослідження впливу складу захисного середовища на збереження життєздатності ліофілізованих бактерій L. lactis та L. plantarum, виділених із традиційної карпатської бринзи

2017 ◽  
Vol 19 (75) ◽  
pp. 29-34
Author(s):  
O.I. Tsisaryk ◽  
I.M. Slyvka ◽  
L.Ia. Musiy
Keyword(s):  
Rapd Pcr ◽  
Pcr Rflp

Вивчено вплив складу захисних середовищ на збереження життєздатності та технологічні властивості ліофілізованих бактерій штамів L. lactis та L. plantarum. Для досліджень обрано білково-вуглеводне та сахарозо-желатозне середовища. Об’єктами досліджень були чисті культури молочнокислих бактерій (МКБ): L. lactis SB 16, L. lactis SB 44, L. plantarum SB 5, L. plantarum SB 7, L. plantarum SB 17, виділені на попередніх етапах роботи із традиційної бринзи, виготовленої у непромислових умовах Карпатського регіону України. Культури бактерій ідентифіковано із використанням класичних мікробіологічних і сучасних молекулярно-генетичних методів (RAPD-PCR, RFLP-PCR, секвенування гену 16S рРНК). Чисельність мезо- і термофільних лактобактерій визначали шляхом посіву на середовище MRS. Молокозсідальну активність монокультур визначали за зміною кислотності молока. Процес сублімаційного сушіння біомаси, змішаної із відповідною кількістю захисного середовища, здійснювали із використанням сублімаційної сушарки «Alpha 1,2 LD Plus». За визначеною експериментальним шляхом кількістю загиблих під час сушіння клітин встановлювали Рівень Збереження Життєздатності (РЗЖ) різних видів і штамів. Встановлено, що за своїми кріопротекторними властивостями кращим для сушіння клітин досліджених монокультур є сахарозо-желатозне середовище, яке забезпечує високий РЗЖ, особливо для L. lactis SB 16 (кількість загиблих під час сушіння клітин становила 9,2%) та L. plantarum SB 17 (кількість загиблих під час сушіння клітин становила 9,9%). Проведено порівняльне дослідження РЗЖ різних видів МКБ за різних умов зберігання. Встановлено, що усі штами молочнокислих бактерій, за винятком штаму L. lactis SB 16, протягом зберігання у знежиреному молоці за температури (+6) °С через місяць втрачають від 4 до 15% життєздатних клітин. Термін зберігання штамів L. lactis та L. plantarum у сухій культурі становить 6 міс.

Molecular typing of Staphylococcus aureus based on PCR-RFLP of coa gene and RAPD analysis

2011 ◽  
Vol 14 (2) ◽  
pp. 285-286 ◽  
Author(s):  
J. Karakulska ◽  
A. Pobucewicz ◽  
P. Nawrotek ◽  
M. Muszyńska ◽  
A. Furowicz ◽  
...  
Keyword(s):  
Staphylococcus Aureus ◽  
Species Identification ◽  
Genetic Relationship ◽  
Molecular Typing ◽  
Rapd Analysis ◽  
Milk Samples ◽  
Rapd Pcr ◽  
Pcr Rflp ◽  
Mastitic Milk ◽  
Coa Gene

Molecular typing ofStaphylococcus aureusbased on PCR-RFLP ofcoagene and RAPD analysisThe aim of this study was molecular identification ofS. aureusstrains isolated from mastitic milk samples and establishing the genetic relationship between strains isolated from cows belonging to the same herd. In all 43 isolated strains thegapgene (930 bp) was amplified, which enabled their affiliation to theStaphylococcusgenus to be established. PCR-RFLP withAluI endonuclease of thegapgene as well asnuc(450 bp) andcoa(1130 bp) gene amplification allowed preciseS. aureusspecies identification. One hundred percent of the genetic relationship between strains was establishedviaRAPD-PCR and coa-typing.

Discriminatory Power of RAPD,PCR-RFLP and Southern Blot Analyses of ureCD or ureA Gene Probes on Helicobacter pylori Isolates

2002 ◽  
Vol 57 (5-6) ◽  
pp. 516-521 ◽  
Author(s):  
Stella Smith ◽  
Franck Cantet ◽  
Fabrice Angelini ◽  
Armelle Marais ◽  
Francis Mégraud ◽  
...  
Keyword(s):  
Genetic Diversity ◽  
Helicobacter Pylori ◽  
Southern Blot ◽  
Blot Analysis ◽  
Southern Blot Analysis ◽  
Discriminatory Power ◽  
Gene Probes ◽  
Rapd Pcr ◽  
Pcr Rflp

The genetic diversity of 33 Nigerian Helicobacter pylori isolates were studied using RAPD, PCR-RFLP and Southern blot analysis of ureA or ureCD gene probes. RAPD was able to distinguish the following number of isolates using the primers 3880 : 5ʹ-AAGAGCCCGT-3ʹ (28), 3881 :5ʹ-AACGCGCAAC-3ʹ (33) and OPH8 :5ʹ-GAAACACCCC-3ʹ (25). Southern blot analysis using the ureCD probe was also able to distinguish the 12 isolates tested into ten different patterns. The PCR-RFLP technique distinguished all 33 isolates into six types. In conclusion, considering typeability, discriminatory power, and convenience, RAPD with the 3881 primer was considered the most useful technique.

Genetic diversity ofBradyrhizobiumstrains isolated fromArachis hypogaea

2001 ◽  
Vol 47 (2) ◽  
pp. 118-122 ◽  
Author(s):  
Lilly M Saleena ◽  
P Loganathan ◽  
Sunita Rangarajan ◽  
Sudha Nair
Keyword(s):  
Genetic Diversity ◽  
Tamil Nadu ◽  
Rapd Markers ◽  
Indigenous Population ◽  
Atmospheric Nitrogen ◽  
Ph Tolerance ◽  
Rapd Pcr ◽  
Pcr Rflp ◽  
Different Populations ◽  
High Degree

Rhizobia are used exclusively in agricultural systems for enhancing the ability of legumes to fix atmospheric nitrogen. Knowledge about the indigenous population is necessary for the selection and application of inoculant strains. In this study, we have assessed the genetic diversity of Bradyrhizobium strains isolated from the host plant, Arachis hypogaea along the coastline of Tamil Nadu. Different populations collected from varying environmental conditions were analysed for salt and pH tolerance. Genetic diversity among the strains was studied using RAPD markers and PCR-RFLP of 16S rDNA and nifD genes. The approaches used in this study yielded consistent results, which revealed a high degree of heterogeneity among strains and detection of two distinct genetic groups.Key words: rhizobia, diversity, salinity, RAPD, PCR-RFLP.

scholarly journals Diversity analysis of Bemisia tabaci biotypes: RAPD, PCR-RFLP and sequencing of the ITS1 rDNA region

2008 ◽  
Vol 31 (2) ◽  
pp. 585-590 ◽  
Author(s):  
Aline R. Rabello ◽  
Paulo R. Queiroz ◽  
Kenya C.C. Simões ◽  
Cássia O. Hiragi ◽  
Luzia H.C. Lima ◽  
...  
Keyword(s):  
Bemisia Tabaci ◽  
Diversity Analysis ◽  
Rapd Pcr ◽  
Pcr Rflp ◽  
Its1 Rdna

scholarly journals Variabilidade genética entre isolados de Colletotrichum gossypii do algodoeiro

2010 ◽  
Vol 36 (1) ◽  
pp. 40-44 ◽  
Author(s):  
Yeshwant R. Mehta ◽  
Angela Mehta
Keyword(s):  
Minas Gerais ◽  
Sao Paulo ◽  
Its Rdna ◽  
São Paulo ◽  
Mato Grosso ◽  
Rapd Pcr ◽  
Pcr Rflp ◽  
E 32

O algodoeiro é atacado por Colletotrichum gossypii (CG) e C. gossypii var. cephalosporioides (CGC). Ambos os patógenos são transmitidos pela semente e sua distinção morfológica é extremamente difícil e inconsistente. Tentativas foram feitas no presente trabalho para verificar a variabilidade genética entre CG e CGC através de RAPD-PCR, ERIC- e REP-PCR e PCR-RFLP da região ITS rDNA. Foram utilizados 53 isolados coletados de sementes e folhas de plantas de diferentes cultivares nos estados do Paraná, São Paulo, Mato Grosso, Minas Gerais, e Paraiba, entre 1999 e 2003. Baseado em testes de patogenicidade, vinte e um isolados foram classificados como CG e 32 como CGC. Os resultados obtidos por RAPD-PCR, utilizando-se oito primers, revelaram dois grupos distintos sendo que o primeiro foi formado por 94% dos isolados de sementes e o segundo por 95% dos isolados de folhas. Na análise de ERIC- e REP-PCR, resultados semelhantes a RAPD foram obtidos, sendo que o primeiro grupo foi formado por 93% dos isolados provenientes das sementes e o segundo por 78% dos isolados provenientes das folhas. Quando o produto de amplificação da região ITS rDNA foi digerido com oito enzimas de restrição, um perfil de bandas semelhante para todos os isolados foi obtido. Resultados de RAPD, ERIC- e REP-PCR demonstraram que existem diferenças genéticas entre os isolados provenientes das sementes e aqueles provenientes de parte aérea, e esses dois grupos foram claramente distintos. Estudos futuros devem ser realizados utilizando outras técnicas moleculares para a obtenção de marcadores capazes de distinguir entre isolados de CG e CGC.

Molecular authentication of Thai medicinal plant Khamin khruea by PCR-RFLP analysis

Planta Medica ◽  
2008 ◽  
Vol 74 (09) ◽  
Author(s):  
P Rojsanga ◽  
W Gritsanapan ◽  
W Leelamanit ◽  
S Sukrong
Keyword(s):  
Medicinal Plant ◽  
Rflp Analysis ◽  
Molecular Authentication ◽  
Pcr Rflp

Simple and Rapid Detection of Factor V Leiden by Allele-specific PCR Amplification

1996 ◽  
Vol 75 (05) ◽  
pp. 757-759 ◽  
Author(s):  
Rainer Blasczyk ◽  
Markus Ritter ◽  
Christian Thiede ◽  
Jenny Wehling ◽  
Günter Hintz ◽  
...  
Keyword(s):  
Direct Sequencing ◽  
Activated Protein C ◽  
Factor V Leiden ◽  
Pcr Amplification ◽  
Factor V ◽  
Specific Pcr ◽  
Pcr Rflp ◽  
Allele Specific ◽  
Specific Amplification ◽  
Allele Specific Pcr

SummaryResistance to activated protein C is the most common hereditary cause for thrombosis and significantly linked to factor V Leiden. In this study, primers were designed to identify the factor V mutation by allele-specific PCR amplification. 126 patients with thromboembolic events were analysed using this technique, PCR-RFLP and direct sequencing. The concordance between these techniques was 100%. In 27 patients a heterozygous factor VGln506 mutation was detected, whereas one patient with recurrent thromboembolism was homozygous for the point mutation. Due to its time- and cost-saving features allele-specific amplification should be considered for screening of factor VGln506.

PCR-RFLP Detection od PAI-2 Gene Variants: Prevelence in Ethnic Groups and Disease Relationship in patients Undergoing corony Angiography

1997 ◽  
Vol 77 (05) ◽  
pp. 0955-0958 ◽  
Author(s):  
Carole A Foy ◽  
Peter J Grant
Keyword(s):  
Gene Variants ◽  
Genotype Distribution ◽  
Pima Indians ◽  
Significant Difference ◽  
Pcr Rflp ◽  
History Of ◽  
Caucasian Patients ◽  
Clinical Conditions ◽  
Rflp Assay ◽  
Coronary Atheroma

SummaryPAI-2 is a fibrinolytic inhibitor produced predominantly by monocytes. Most PAI-2 is intracellular making study in clinical conditions difficult. Abnormalities in production may be associated with inflammation and fibrinolysis at sites of tissue damage such as the atherosclerotic plaque.PAI-2 gene variants have been described: variant A consists of Asn120, Asn404 and Ser413 and variant B consists of Asp120, Lys404 and Cys413. We designed a PCR-RFLP assay using primers spanning the region containing Asn/Lys404 and Ser/Cys413. Variant B contains an Mwol restriction site. We analysed 302 Pima Indians and 286 healthy Caucasian volunteers. To investigate relationships between genotype and vascular disease we analysed 333 Caucasian patients undergoing coronary angiography.Gene variant B was more common in the Pimas than in Caucasians (p <0.0001). There was no significant difference in genotype distribution between the volunteers and patients. In the patients there was no association between genotype and either a history of MI or extent of coronary atheroma.

Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document