scholarly journals Χρήση συμπλόκων ενώσεων ως μοριακών διακοπτών και ανιχνευτών στο DNA

2014 ◽  
Author(s):  
Μιχαήλ Καπλάνης
Keyword(s):  
Ct Dna ◽  

Στην παρούσα διατριβή ουσιαστικά επιχειρείται ο σχεδιασμός και η μελέτη νέων συμπλόκων ενώσεων, που μπορούν να δράσουν ως μοριακοί ανιχνευτές στο DNA και πιθανοί χημειοθεραπευτικοί παράγοντες. Για το σκοπό αυτό συντέθηκε μια σειρά νέων συμπλόκων και χαρακτηρίστηκαν πλήρως με φασματοσκοπία IR, NMR, UV-Vis, ενώ οι φωτοφυσικές τους ιδιότητες μελετήθηκαν με φασματοσκοπία εκπομπής. Παρουσιάζεται επίσης η κρυσταλλική δομή του συμπλόκου [Re(CO)3(pq)(py)]PF6. Η αλληλεπίδρασή τους με το DNA μελετήθηκε με διάφορες τεχνικές όπως CD, ιξωδομετρία, CV, Tm, τιτλοδότηση UV-Vis και εκπομπής. Επιπλέον, μελετήθηκε η φωτο-διασπαστική τους ικανότητα και η in vitro αντικαρκινική τους δράση έναντι τριών καρκινικών σειρών ανθρώπινης προέλευσης. Επιπλέον, μελετήθηκε η δράση τους έναντι του PAF και των ενζυματικών του διεργασιών.Η αλληλεπίδραση των συμπλόκων του τύπου fac-[Re(CO)3(a-diimine)L]0/+ με CT-DNA γίνεται κυρίως μέσω συναρμογής στην αύλακα, εκτός από το - υποκατεστημένο με δύο εστερομέδες - dppz σύμπλοκο που η δέσμευση είναι παρεμβολικής φύσεως. Αν και το dppz παράγωγο αλληλεπιδρά ισχυρότερα από τα υπόλοιπα σύμπλοκα του τύπου αυτού και συμπεριφέρεται ως μοριακός διακόπτης φωτός, εντούτοις είναι δύσκολο να προκαλέσει άμεση φωτοδιάσπαση του DNA. Τα υπόλοιπα διιμινικά σύμπλοκα του Re(I) προκαλούν ικανοποιητική διάσπαση του ενός κλώνου του πλασμιδιακού pBR322 DNA. Μηχανιστικές μελέτες έδειξαν ότι τα pq σύμπλοκα διασπούν του DNA μέσω παραγωγής δραστικών ειδών οξυγόνου. Το φαινανθρολινικού τύπου σύμπλοκο προκαλεί φωτοδιάσπαση ανεξάρτητη από το οξυγόνο.Οι DNA-δεσμευτικές μελέτες του νέου τετραρηνικού πορφυρινικού συμπλόκου {H2TPyP[Re(CO)3(pq)]4}∙4PF6 έδειξαν ισχυρή αλληλεπίδραση με την αύλακα του DNA. Η μιας τάξης μεγέθους μεγαλύτερη σταθερά σύνδεσης του με το DNA, συγκριτικά με τα μονομερή σύμπλοκα οφείλεται στις ισχυρές ηλεκτροστατικές αλληλεπιδράσεις με τις φωσφορικές ομάδες του σκελετού του DNA. Το πορφυρινικό αυτό παράγωγο επιδεικνύει περισσότερο αποτελεσματική φωτοδιάσπαση του πλασμιδίου pBR322, συγκριτικά με τα παραπάνω σύμπλοκα του τύπου fac-[Re(CO)3(a-diimine)L]0/+. Η μεταλλοπορφυρίνη (TPyP)GaCl δεσμεύεται εξωτερικά μέσω στοιβάγματος στο DNA. Η χαμηλή συγγένεια δέσμευσης, δεν επηρεάζει την ικανότητα του συμπλόκου να επάγει την διάσπαση και των δύο κλώνων του πλασμιδίου, μέσω μηχανισμού που περιλαμβάνει την παραγωγή μονήρους οξυγόνου.Χρησιμοποιώντας την ΜΤΤ μέθοδο, μελετήθηκε η in vitro κυτταροτοξική δράση των συμπλόκων έναντι τριών καρκινικών σειρών ανθρώπινης προέλευσης, μαστού (MCF-7), προστάτη (PC3) και γλοιοβλάστωμα (T98G). Η σύμπλεξη του Re(I) μειώνει σημαντικά την τοξικότητα του ελεύθερου υποκαταστάτη phendione. Αντίθετα, τα pq σύμπλοκα επιδεικνύουν ισχυρή τοξικότητα, συγκριτικά με τον ελεύθερο pq υποκαταστάτη που είναι μη τοξικός. Τα αποτελέσματα των συμπλόκων του τύπου [Re(CO)3(pq)(L)]0/+ (όπου L=Cl, MeCN, py), υποδεικνύουν την κρισιμότητα του αξονικού υποκαταστάτη και του φορτίου του συμπλόκου στην κυτταροτοξικότητα τους. Η πορφυρίνη του Ga(III) έδειξε ισχυρή τοξικότητα έναντι των MCF-7 και PC3 κυττάρων και μέτρια τοξικότητα έναντι των T98G κυττάρων.Τα σύμπλοκα [Re(CO)3(phendione)Cl] και [Re(CO)3[dppz(COOEt)2]Cl], αλλά κυρίως το πρόδρομο σύμπλοκο [Re(CO)5Cl] παρουσιάζουν ισχυρή αναστολή της συσσώρευσης των αιμοπεταλίων που προκαλείται από τον PAF, σε αντίθεση με τους ελεύθερους υποκαταστάτες. Επιπλέον, τα σύμπλοκα επιδρούν στα βιοσυνθετικά ένζυμα του PAF, lyso-PAF-AT και PAF-CPT, ενώ το [Re(CO)3(phendione)Cl] αυξάνει τη δραστικότητα του καταβολικού ενζύμου LP-PLA2.

2021 ◽  
Author(s):  
Σπυρίδων Περόντσης
Keyword(s):  

Στην παρούσα διδακτορική διατριβή περιγράφεται η σύνθεση, ο δομικός χαρακτηρισμός και η μελέτη της βιολογικής δραστικότητας τριανταπέντε συμπλόκων ενώσεων του ουρανυλίου(II) και του κοβαλτίου με ligand μια σειρά από μη-στεροειδή αντιφλεγμονώδη φάρμακα παρουσία ή απουσία co-ligand ως δότες ατόμων Ν. Ο χαρακτηρισμός των συμπλόκων έγινε µε μετρήσεις µοριακής αγωγιµότητας, μαγνητικές μετρήσεις σε θερμοκρασία περιβάλλοντος, µε φασµατοσκοπία ΙR, UV-vis και (για τα σύμπλοκα του ουρανυλίου(II)) 1Η NMR και µε κρυσταλλογραφία ακτίνων–Χ.Η μελέτη της βιολογικής δράσης των συμπλόκων περιελάμβανε την αλληλεπίδρασή τους με το CT DNA, με το pBR322 πλασμιδιακό DNA, με τις αλβουμίνες του ορού BSA και HSA και τη διερεύνηση της αντιοξειδωτικής τους δράσης. Η μελέτη της αλληλεπίδρασης με το CT DNA πραγματοποιήθηκε με φασματοσκοπία UV-vis, ιξωδομετρία, ανταγωνιστική δράση με το ΕΒ και κυκλική βολταμμετρία για τα σύμπλοκα του κοβαλτίου. Η ικανότητα διάσπασης του pBR322 DNA εξετάστηκε με ηλεκτροφόρηση σε πηκτή αγαρόζης. Η αλληλεπίδραση με τις αλβουμίνες του ορού έλαβε χώρα με φασματοσκοπία φθορισμού όπου εξετάστηκε η ισχύς σύνδεσης των ενώσεων, και προσδιορίστηκε η πιθανή θέση σύνδεσης στα μόρια των αλβουμινών. Τα αποτελέσματα έδειξαν ισχυρή σύνδεση των ενώσεων στο CT DNA και στις αλβουμίνες ενώ μεταξύ των συμπλόκων της παρούσας διατριβής υπολογίστηκε και η υψηλότερη σταθερά σύνδεσης στο DNA από όλα τα σύμπλοκα Co-ΜΣΑΦ της βιβλιογραφίας. Η ικανότητα διάσπασης του υπερελικωμένου pBR322 DNA ήταν χαμηλή έως μέτρια ενώ τα σύμπλοκα της εργασίας έδειξαν εκλεκτικότητα ως προς την δέσμευση της ρίζας ABTS και αναγωγής του Η2Ο2 έναντι της ρίζας DPPH. Οι in silico μοριακές μελέτες πρόσδεσης έδειξαν εσωτερική συναρμογή των συμπλόκων στην διπλή έλικα του CT DNA και σύνδεση τους σε μια θέση στο μόριο των αλβουμινών, η οποία βρίσκεται κοντά στη θέση δέσμευσης του ibuprofen χωρίς όμως να ταυτίζονται οι θεωρητικά υπολογισμένες ενέργειες δέσμευσης με τις σταθερές σύνδεσης που υπολογίστηκαν από τα in vitro πειράματα.


2016 ◽  
Author(s):  
Βαρβάρα Μαυροειδή
Keyword(s):  
Ct Dna ◽  

Στην παρούσα διδακτορική διατριβή συνετέθησαν δύο υποκαταστάτες που φέρουν την αντικαρκινική ομάδα του 2-(4΄-αμινοφαινυλο)βενζοθειαζολίου συνδεδεμένη, μέσω ανθρακικής αλυσίδας, με την 2-αμινομεθυλοπυριδίνη. Τα ανωτέρω συμπλέχθηκαν επιτυχώς με Pd(II), Pt(II) και Cu(II) και ακολούθησε χαρακτηρισμός των υποκαταστατών και των συμπλόκων με διάφορες φασματοσκοπικές μεθόδους (IR, NMR, MS, UV-Vis και EPR). Σε συνέχεια της μελέτης, πραγματοποιήθηκε η διερεύνηση της αλληλεπίδρασης των ενώσεων με το CT-DNA, με τη χρήση του κυκλικού διχρωϊσμού (CD),φασματοσκοπίας υπεριώδους-ορατού (UV-Vis), φθορισμού, ιξωδομετρίας και μελετών θερμικής μετουσίωσης. Τα αποτελέσματα ανέδειξαν την ικανότητατων υποκαταστατών αλλά και των αντίστοιχων συμπλόκων να αλληλεπιδρούν ισχυρά με το DNA. Ο συνεργιστικός τρόπος δράσης των υπό μελέτη ενώσεων περιλαμβάνει αλληλεπίδραση μέσω δέσμευσης στις αύλακες τουDNA και μη κλασσικής παρεμβολής και, ενώ επιπροσθέτως για τα σύμπλοκα προτείνεται και ομοιοπολική αλληλεπίδραση των μετάλλων με το DNA.Τέλος, αξιολογήθηκε η in vitro βιολογική τους δράση, σε δυο ανθρώπινες καρκινικές κυτταρικές σειρές μαστού (MCF-7 και ΜDA-MB-231) και στη φυσιολογική ανθρώπινη σειρά ινοβλαστών δέρματος DSF. Τα πρoκαταρκτικά βιολογικά αποτελέσματα είναι ιδιαιτέρως ενθαρρυντικά αφού διαπιστώθηκε εκλεκτική κυτταρική πρόσληψη και αυξημένη κυτταροτοξική δράση των υπό μελέτη ενώσεων στις δοκιμαζόμενες καρκινικές κυτταρικές σειρές μαστού.


2021 ◽  
Author(s):  
Αλέξανδρος Καλαμπαλίδης
Keyword(s):  
Ct Dna ◽  

Στην παρούσα διδακτορική διατριβή, η οποία πραγματοποιήθηκε στο εργαστήριο Ανόργανης Χημείας του Τμ. Χημείας ΕΚΠΑ υπό την επίβλεψη του Επ. Καθ. Α. Ι. Φιλιππόπουλου, παρουσιάζεται η σύνθεση, ο χαρακτηρισμός και η αξιολόγηση της βιολογικής δράσης νέων επίπεδων τετραγωνικών συμπλόκων ενώσεων του ροδίου(ι) με μονοσχιδείς υποκαταστάτες (L) της κατηγορίας των θειενο[2,3-d]πυριμιδινών, με γενικό τύπο [Rh(η2,η2-1,5-cod)(L)Cl]. Σε πρώτο στάδιο πραγματοποιήθηκε η σύνθεση των υποκαταστατών με βάση τη βιβλιογραφία και με ανάλογες τροποποιήσεις, ενώ στη συνέχεια ακολούθησε ο σχεδιασμός και η σύνθεση των νέων μορίων υποκαταστατών. Σε δεύτερο στάδιο πραγματοποιήθηκε η σύνθεση, η απομόνωση και ο χαρακτηρισμός των νέων συμπλόκων ενώσεων του Rh(I) με τους παραπάνω υποκαταστάτες. Στη συνέχεια, μελετήθηκε η πιθανή αντι-θρομβωτική, αντι-αιμοπεταλιακή δράση αυτών, καθώς και των πρόδρομων ενώσεων in vitro, μέσω της ικανότητάς τους να αναστέλλουν την επαγόμενη από τον Παράγοντα Ενεργοποίησης Αιμοπεταλίων (PAF) συσσώρευση των αιμοπεταλίων σε ανθρώπινα αιμοπετάλια. Παράλληλα, μελετήθηκε η αναστολή και άλλων παραγόντων που σχετίζονται με τη φλεγμονή και τη θρόμβωση, όπως η θρομβίνη, το ADP και το κολλαγόνο. Κατόπιν πραγματοποιήθηκαν θεωρητικοί υπολογισμοί μοριακής πρόσδεσης για την μελέτη των αλληλεπιδράσεων των υπό μελέτη ενώσεων με τον υποδοχέα του PAF, PAFR. Επιπλέον, έγινε έλεγχος για την κυτταροτοξική δράση του συνόλου των ενώσεων σε δύο καρκινικές σειρές (MCF-7, U87MG). Επιπρόσθετα, εξετάστηκε η πιθανή αλληλεπίδραση της ένωσης (1) και του αντίστοιχου υποκαταστάτη με DNA θύμου αδένα μόσχου (calf thymus DNA: CT-DNA), καθώς και με πρωτεΐνες του ορού του αίματος. Πραγματοποιήθηκαν ακόμη θεωρητικοί υπολογισμοί μοριακής πρόσδεσης για τη μελέτη των αλληλεπιδράσεων των ενώσεων αυτών με DNA, καθώς και για τη μελέτη της ένωσης (1) με την πρωτεΐνη HSA. Οι νέες ενώσεις του Rh(I) παρουσίασαν ικανοποιητική δραστικότητα σε όλους τους τομείς που μελετήθηκαν, ενώ η δράση τους εμφανίζεται εμφανώς βελτιωμένη σε σχέση με τη δράση των αντίστοιχων υποκαταστατών.


2007 ◽  
Vol 72 (12) ◽  
pp. 1265-1269 ◽  
Author(s):  
Miroslava Vujcic ◽  
Srdjan Tufegdzic ◽  
Zoran Vujcic ◽  
Miroslav Gasic ◽  
Dusan Sladic

Changes in electrophoresis pattern after interaction of supercoiled plasmid pBR322 DNA with avarol was studied at a micromolar concentration of reactants under mild reaction conditions. Interactions of avarol with linear high-molecular CT-DNA at millimolar concentrations were analyzed by electrophoresis and UV spectrophotometry. It was observed that avarol is capable of quenching ethidium bromide fluorescence in DNA bands. An increase in the absorbance of DNA was detected. The results indicate the binding of avarol to DNA and/or modification of nucleotide bases.


1998 ◽  
Vol 95 ◽  
pp. 42
Author(s):  
Kirsti Savela ◽  
Terhi Kuljukka ◽  
Kimmo Peltonen ◽  
Seppo Mikkonen ◽  
Leena Rantanen
Keyword(s):  
Ct Dna ◽  

2020 ◽  
Vol 21 (14) ◽  
pp. 1528-1538
Author(s):  
Sarah Albogami ◽  
Hadeer Darwish ◽  
Hala M. Abdelmigid ◽  
Saqer Alotaibi ◽  
Ahmed Nour El-Deen ◽  
...  

Background: In Saudi Arabia, the incidence and mortality rates of breast cancer are high. Although current treatments are effective, breast cancer cells develop resistance to these treatments. Numerous studies have demonstrated that active compounds in plant extracts, such as the phenolic compound Rosmarinic Acid (RA), exert anti-cancer effects. Objective: We investigated the anticancer properties of methanolic crude extracts of seedlings and calli of Rosmarinus officinalis and Coleus hybridus, two Lamiaceae species. Methods: MCF-7 human breast cancer cells were treated with methanolic crude extracts obtained from plant calli and seedlings generated in vitro, and cell proliferation was evaluated. Transcriptional profiling of the seedling and callus tissues was also conducted. Results: The mRNA expression levels of RA genes were higher in C. hybridus seedlings than in R. officinalis seedlings, as well as in C. hybridus calli than in R. officinalis calli, except for TAT and C4H. In addition, seedling and callus extracts of both R. officinalis and C. hybridus showed anti-proliferative effects against MCF-7 cells after 24 or 48 h of treatment. Discussion: At a low concentration of 10 μg/mL, C. hybridus calli and seedling extracts showed the most significant anti-proliferative effects after 24 and 48 h of exposure (p < 0.01); controls (doxorubicin) also showed significant inhibition, but lesser than that observed with C. hybridus (p < 0.05). Results with R. officinalis callus and seedling extracts did not significantly differ from those with untreated cells. Conclusion: Methanolic extracts of R. officinalis and C. hybridus are potentially valuable options for breast cancer treatment.


2018 ◽  
Vol 18 (17) ◽  
pp. 1483-1493
Author(s):  
Ricardo Imbroisi Filho ◽  
Daniel T.G. Gonzaga ◽  
Thainá M. Demaria ◽  
João G.B. Leandro ◽  
Dora C.S. Costa ◽  
...  

Background: Cancer is a major cause of death worldwide, despite many different drugs available to treat the disease. This high mortality rate is largely due to the complexity of the disease, which results from several genetic and epigenetic changes. Therefore, researchers are constantly searching for novel drugs that can target different and multiple aspects of cancer. Experimental: After a screening, we selected one novel molecule, out of ninety-four triazole derivatives, that strongly affects the viability and proliferation of the human breast cancer cell line MCF-7, with minimal effects on non-cancer cells. The drug, named DAN94, induced a dose-dependent decrease in MCF-7 cells viability, with an IC50 of 3.2 ± 0.2 µM. Additionally, DAN94 interfered with mitochondria metabolism promoting reactive oxygen species production, triggering apoptosis and arresting the cancer cells on G1/G0 phase of cell cycle, inhibiting cell proliferation. These effects are not observed when the drug was tested in the non-cancer cell line MCF10A. Using a mouse model with xenograft tumor implants, the drug preventing tumor growth presented no toxicity for the animal and without altering biochemical markers of hepatic function. Results and Conclusion: The novel drug DAN94 is selective for cancer cells, targeting the mitochondrial metabolism, which culminates in the cancer cell death. In the end, DAN94 has been shown to be a promising drug for controlling breast cancer with minimal undesirable effects.


2020 ◽  
Vol 17 (2) ◽  
pp. 151-159
Author(s):  
Tran Nguyen Minh An ◽  
Pham Thai Phuong ◽  
Nguyen Minh Quang ◽  
Nguyen Van Son ◽  
Nguyen Van Cuong ◽  
...  

: A series of novel 1,3-thiazole derivatives (5a-i) with a modified phenothiazine moiety were synthesized and tested against cancer cell line MCF-7 for their cytotoxicity. Most of them (5a-i) were less cytotoxic or had no activity against MCF-7 cancer cell line. Material and Methods: The IC50 value of compound (4) was 33.84 μM. The compounds (5a-i) were also evaluated for antimicrobial activities, but no significant activity was observed. The antioxidant activity was conducted for target compounds (5a-i). The IC50 value of compound (5b) was 0.151mM. Results: The total amount of energy, ACE (atomic contact energy), energy of receptor (PDB: 5G5J), and ligand interaction of structure (4) were found to be 22.448 Kcal.mol-1 , -247.68, and -91.91 Kcal.mol-1, respectively. The structure (4) is well binded with the receptor because the values of binding energy, steric energy, and the number of hydrogen bondings are -91.91, 22.448 kcal.mol-1, and 2, respectively. It shows that structure (4) has good cytotoxicity with MCF-7 in vitro. Conclusion: The increasing of docking ability of structures (5a-i) with the receptor is presented in increasing order as (5f)>(5e)>(5g)>(5a)>(5b)>(5d)>(5c)>(5i)>(5h). The structure bearing substitution as thiosemicarbazone (4), nitrogen heterocyclic (5f), halogen (5e), and azide (5g) showed good cytotoxicity activity in vitro.


Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document