scholarly journals Επιδημιολογική μελέτη του ιού Noda σε αλιεύματα, δίθυρα και ιχθείς και μελέτη της παθογένειας του ιού στο λαβράκι σε σχέση με τον εντοπισμό της πύλης εισόδου του ιού στον οργανισμό και τον τρόπο εξάπλωσής του στους ιστούς του ψαριού

2017 ◽  
Author(s):  
Ειρήνη Λάμπου
Keyword(s):  
Real Time ◽  
Real Time Pcr ◽  
Dicentrarchus Labrax ◽  
Nervous Necrosis Virus ◽  
Necrosis Virus ◽  
Viral Encephalopathy And Retinopathy

Η ιογενής εγκεφαλοπάθεια και αμφιβληστροειδοπάθεια (Viral Encephalopathy and Retinopathy, VER) είναι μία νευροπαθολογική νόσος των ψαριών που έχει θεωρηθεί ως η πιο σοβαρή ιογενής απειλή στην εκτροφή ειδών θαλασσινού νερού στην περιοχή της Μεσογείου. Αιτιολογικός παράγοντας της νόσου είναι ένας RNA-ιός, που ανήκει στο γένος Betanodavirus της οικογένειας Nodaviridae (Carstens et al., 2000). Σκοπός της παρούσας διατριβής ήταν η μελέτη στοιχείων επιδημιολογίας των Betanoda-ιών σε άγρια και εκτρεφόμενα είδη ψαριών και δίθυρων που απαντώνται στα ελληνικά θαλάσσια ύδατα και η διερεύνηση πτυχών της παθογένειας του ιού σε ένα εξαιρετικά ευαίσθητο είδος, το ευρωπαϊκό λαβράκι, Dicentrarchus labrax. Για το σκοπό αυτό διενεργήθηκαν πειραματισμοί που περιγράφονται σε δύο κεφάλαια. Στο πρώτο κεφάλαιο παρατίθενται αναλυτικά οι δειγματοληψίες που πραγματοποιήθηκαν για τον εντοπισμό του ιού σε άγριους και εκτρεφόμενους πληθυσμούς και το πρωτόκολλο της δοκιμής real-time PCR που χρησιμοποιήθηκε για την ανίχνευση γενώματος Betanoda-ιών. Τα αποτελέσματα φανέρωσαν ότι μεγάλο εύρος ειδών τελεόστεων ιχθύων και δίθυρων αποτελούν ξενιστές Betanoda-ιών και συγκεκριμένα στελεχών που στην πλειοψηφία τους κατατάσσονται στον γενότυπο RGNNV. Ο ιός εντοπίστηκε σε 10 είδη για πρώτη φορά διεθνώς, ενώ ιδιαίτερο ενδιαφέρον παρουσιάζει η ανίχνευση ενός RGNNV/SJNNV ανασυνδυασμού σε σαφρίδι. H φυλογενετική ανάλυση των αλληλουχιών τμήματος του γονιδίου της πολυμεράσης (pol) και της καψιδιακής πρωτεΐνης (cp) του ιού στα θετικά δείγματα, κατέδειξε ότι η γενετική παραλλακτικότητα μεταξύ των απομονώσεων ήταν μικρή, ακόμα και μεταξύ άγριων και εκτρεφόμενων πληθυσμών διαφορετικών περιοχών αλίευσης. Το γεγονός αυτό αποτελεί ισχυρή ένδειξη ότι πολλά είδη άγριων ψαριών αποτελούν δεξαμενή του ιού RGNNV, από όπου ο ιός μπορεί να μεταδοθεί στα ευαίσθητα, ελεύθερα ή εκτρεφόμενα, είδη. Στο δεύτερο κεφάλαιο αξιολογήθηκε η λοιμογόνος ικανότητα και διασπορά του ιού Red-spotted Grouper Nervous Necrosis Virus (RGNNV) στον οργανισμό, μετά από ενοφθαλμισμό του ιού στον οφθαλμό, τα βράγχια, την πλευρική γραμμή και τον οισοφάγο ιχθυδίων ευρωπαϊκού λαβρακιού, Dicentrarchus labrax. Η εκδήλωση θνησιμότητας και κλινικής συμπτωματολογίας τυπικής ιογενούς εγκεφαλοπάθειας και αμφιβληστροειδοπάθειας σε συνδυασμό με την παρατήρηση κενοτoπιώδους εκφύλισης στον εγκέφαλο και τον αμφιβληστροειδή και την ανίχνευση του ιικού γενώματος σε ιστούς λαβρακιών από όλες τις πειραματικές ομάδες, υποδηλώνουν ότι ο ιός RGNNV εισέρχεται στον οργανισμό μέσω πολλών διαφορετικών οδών. Παρόλο που ο αρχικός εντοπισμός και το μοτίβο διασποράς του στους ιστούς διέφερε μεταξύ των πειραματικών ομάδων, η εξάπλωση του ιού RGNNV στον εγκέφαλο και τον οφθαλμό φαίνεται ότι επιτυγχάνεται νευρογενώς. Ιαιμία εκδηλώθηκε μόνο μετά την εγκατάσταση της μόλυνσης στον εγκέφαλο και ενώ ο ιός είχε ήδη ανιχνευθεί σε νευρικούς ιστούς.

Development of a sensitive and quantitative diagnostic assay for fish nervous necrosis virus based on two-target real-time PCR

2005 ◽  
Vol 110 (3-4) ◽  
pp. 167-179 ◽  
Author(s):  
L DALLAVALLE ◽  
V TOFFOLO ◽  
M LAMPRECHT ◽  
C MALTESE ◽  
G BOVO ◽  
...  
Keyword(s):  
Real Time ◽  
Real Time Pcr ◽  
Nervous Necrosis Virus ◽  
Diagnostic Assay ◽  
Necrosis Virus

scholarly journals Sea Bass Immunization to Downsize the Betanodavirus Protein Displayed in the Surface of Inactivated Repair-Less Bacteria

Vaccines ◽  
2019 ◽  
Vol 7 (3) ◽  
pp. 94
Author(s):  
Lama ◽  
Pereiro ◽  
Novoa ◽  
Coll
Keyword(s):  
Culture Media ◽  
Dicentrarchus Labrax ◽  
Sea Bass ◽  
Surface Expression ◽  
Environmental Safety ◽  
Nervous Necrosis Virus ◽  
Necrosis Virus ◽  
European Sea Bass ◽  
Viral Nervous Necrosis ◽  
Casein Hydrolysates

: This work describes immunization of European sea bass (Dicentrarchus labrax) juveniles against viral nervous necrosis virus (VNNV), a betanodavirus causing worldwide mortalities in many fish species. Protection was obtained with the so-called spinycterin vehicles consisting of irreversibly DNA-damaged DNA-repair-less Escherichia coli displaying at their surface a downsized VNNV coat antigen. In this work we have i) maximized bacterial expression levels by downsizing the coat protein of VNNV to a fragment (frgC91–220) containing most of its previously determined antigenicity, ii) developed a scalable autoinduction culture media for E.coli based in soy-bean rather than in casein hydrolysates, iii) enriched surface expression by screening different anchors from several prokaryotic sources (anchor + frgC91–220 recombinant products), iv) preserved frgC91–220 antigenicity by inactivating bacteria by irreversible DNA-damage by means of Ciprofloxacin, and v) increased safety using a repair-less E.coli strain as chassis for the spinycterins. These spinycterins protected fish against VNNV challenge with partial (Nmistic + frgC91–220) or total (YBEL + frgC91–220) levels of protection, in contrast to fish immunized with frgC91–220 spinycterins. The proposed spinycterin platform has high levels of environmental safety and cost effectiveness and required no adjuvants, thus providing potential to further develop VNNV vaccines for sustainable aquaculture.

scholarly journals Real-Time Quantitative PCR Assay for Monitoring of Nervous Necrosis Virus Infection in Grouper Aquaculture

2011 ◽  
Vol 49 (3) ◽  
pp. 1090-1096 ◽  
Author(s):  
H.-C. Kuo ◽  
T.-Y. Wang ◽  
P.-P. Chen ◽  
Y.-M. Chen ◽  
H.-C. Chuang ◽  
...  
Keyword(s):  
Virus Infection ◽  
Real Time ◽  
Quantitative Pcr ◽  
Nervous Necrosis Virus ◽  
Necrosis Virus ◽  
Pcr Assay ◽  
Real Time Quantitative Pcr ◽  
Quantitative Pcr Assay

Application and development of a TaqMan real-time PCR for detecting infectious spleen and kidney necrosis virus in Siniperca chuatsi

2017 ◽  
Vol 107 ◽  
pp. 98-105 ◽  
Author(s):  
Qiang Lin ◽  
Xiaozhe Fu ◽  
Lihui Liu ◽  
Hongru Liang ◽  
Huizhi Guo ◽  
...  
Keyword(s):  
Real Time ◽  
Real Time Pcr ◽  
Necrosis Virus ◽  
Siniperca Chuatsi

scholarly journals Identification of the major capsid protein of erythrocytic necrosis virus (ENV) and development of quantitative real-time PCR assays for quantification of ENV DNA

2016 ◽  
Vol 28 (4) ◽  
pp. 382-391 ◽  
Author(s):  
Maureen K. Purcell ◽  
Schuyler Pearman-Gillman ◽  
Rachel L. Thompson ◽  
Jacob L. Gregg ◽  
Lucas M. Hart ◽  
...  
Keyword(s):  
Real Time ◽  
Capsid Protein ◽  
Real Time Pcr ◽  
Major Capsid Protein ◽  
Quantitative Real Time Pcr ◽  
Necrosis Virus ◽  
Pcr Assays

scholarly journals Immune Response of Senegalese Sole against Betanodavirus Mutants with Modified Virulence

Pathogens ◽  
2021 ◽  
Vol 10 (11) ◽  
pp. 1388
Author(s):  
Juan Gémez-Mata ◽  
Sandra Souto ◽  
Isabel Bandín ◽  
María del Carmen Alonso ◽  
Juan José Borrego ◽  
...  
Keyword(s):  
Immune Response ◽  
Nervous Necrosis Virus ◽  
Senegalese Sole ◽  
Coding Region ◽  
Necrosis Virus ◽  
A Genome ◽  
Positive Sense ◽  
The Complement System ◽  
Reference Strains ◽  
Viral Encephalopathy And Retinopathy

Nervous necrosis virus (NNV), genus Betanodavirus, the etiological agent of the viral encephalopathy and retinopathy (VER), presents a genome with two positive-sense single-stranded RNA segments. Striped jack nervous necrosis virus (SJNNV) and red-spotted grouper nervous necrosis virus (RGNNV), together with reassortants RGNNV/SJNNV, are the betanodaviruses predominantly isolated in Southern Europe. An RGNNV/SJNNV reassortant isolated from Senegalese sole (wt160) causes high mortalities in this fish species. This virus presents differences in the sequence of the 3’ non-coding region (NCR) of both segments compared to RGNNV and SJNNV reference strains. Previously, it has been reported that the reversion of two of these differences (nucleotides 1408 and 1412) in the RNA2 3’NCR to the SJNNV-type (recombinant r1408-1412) resulted in a decrease in sole mortality. In the present study, we have applied an OpenArray® to analyse the involvement of sole immune response in the virulence of several recombinants: the r1408-1412 and two recombinants, developed in the present study, harbouring mutations at positions 3073 and 3093 of RNA1 3’NCR to revert them to RGNNV-type. According to the correlation values and to the number of expressed genes, the infection with the RNA2-mutant provoked the most different immune response compared to the immune response triggered after the infection with the rest of the viruses, and the exclusive and high upregulation of genes related to the complement system. The infection with the RNA1-mutants also provoked a decrease in mortality and their replication was delayed at least 24 h compared to the wt160 replication, which could provoke the lag observed in the immune response. Furthermore, the infection with the RNA1-mutants provoked the exclusive expression of pkr and the downregulation of il17rc.

scholarly journals Cloning of a proopiomelanocortin cDNA from the pituitary gland of the sea bass (Dicentrarchus labrax) and assessment of mRNA expression in different tissues by means of real-time PCR

2003 ◽  
Vol 176 (3) ◽  
pp. 405-414 ◽  
Author(s):  
S Varsamos ◽  
SE Wendelaar Bonga ◽  
G Flik ◽  
R Quere ◽  
T Commes
Keyword(s):  
Pituitary Gland ◽  
Real Time ◽  
Real Time Pcr ◽  
Dicentrarchus Labrax ◽  
Head Kidney ◽  
Sea Bass ◽  
Biologically Active ◽  
Active Peptides ◽  
Beta Endorphin ◽  
Different Tissues

Proopiomelanocortin (POMC) cDNA was cloned from sea bass (Dicentrarchus labrax) pituitary gland. A 743 nucleotide sequence was obtained coding for the following sequences flanked by sets of proteolytic cleavage sites: ACTH (Ser(88)-Met(127)), alpha-MSH (Ser(88)-Gly(102)), CLIP (Pro(106)-Met(127)), beta-LPH (Glu(131)-Gln(208)), gamma-LPH (Glu(131)-Ser(175)), beta-MSH (Asp(159)-Ser(175)), and beta-endorphin (Tyr(178)-Gln(208)). No region homologous to gamma-MSH/joining peptide (a tetrapod POMC feature) was found. Amino acid sequence identity was high with other teleostean species considered (tilapia: 73%) and lower with elasmobranchs (dogfish: 42%). However, the presumed biologically active peptides were highly conserved within all species considered: alpha-MSH (93-100%), ACTH (80-95%) and beta-endorphin (54-90%). Real-time PCR allowed us to quantify the expression of the POMC in different tIssues of the sea bass: pituitary gland, liver, gonad and head kidney. No significant POMC expression was found in the integument. In pituitary gland, gonads, head kidney and liver, POMC expression was respectively, 1.26x10(10), 2.67x10(5), 2.06x10(4) and 1.67x10(4) copies/ micro g mRNA.

Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document