Application and development of a TaqMan real-time PCR for detecting infectious spleen and kidney necrosis virus in Siniperca chuatsi

2017 ◽  
Vol 107 ◽  
pp. 98-105 ◽  
Author(s):  
Qiang Lin ◽  
Xiaozhe Fu ◽  
Lihui Liu ◽  
Hongru Liang ◽  
Huizhi Guo ◽  
...  
Keyword(s):  
Real Time ◽  
Real Time Pcr ◽  
Necrosis Virus ◽  
Siniperca Chuatsi

Development of a sensitive and quantitative diagnostic assay for fish nervous necrosis virus based on two-target real-time PCR

2005 ◽  
Vol 110 (3-4) ◽  
pp. 167-179 ◽  
Author(s):  
L DALLAVALLE ◽  
V TOFFOLO ◽  
M LAMPRECHT ◽  
C MALTESE ◽  
G BOVO ◽  
...  
Keyword(s):  
Real Time ◽  
Real Time Pcr ◽  
Nervous Necrosis Virus ◽  
Diagnostic Assay ◽  
Necrosis Virus

scholarly journals Identification of the major capsid protein of erythrocytic necrosis virus (ENV) and development of quantitative real-time PCR assays for quantification of ENV DNA

2016 ◽  
Vol 28 (4) ◽  
pp. 382-391 ◽  
Author(s):  
Maureen K. Purcell ◽  
Schuyler Pearman-Gillman ◽  
Rachel L. Thompson ◽  
Jacob L. Gregg ◽  
Lucas M. Hart ◽  
...  
Keyword(s):  
Real Time ◽  
Capsid Protein ◽  
Real Time Pcr ◽  
Major Capsid Protein ◽  
Quantitative Real Time Pcr ◽  
Necrosis Virus ◽  
Pcr Assays

scholarly journals Universal reverse-transcriptase real-time PCR for infectious hematopoietic necrosis virus (IHNV)

2013 ◽  
Vol 106 (2) ◽  
pp. 103-115 ◽  
Author(s):  
MK Purcell ◽  
RL Thompson ◽  
KA Garver ◽  
LM Hawley ◽  
WN Batts ◽  
...  
Keyword(s):  
Reverse Transcriptase ◽  
Real Time ◽  
Real Time Pcr ◽  
Infectious Hematopoietic Necrosis Virus ◽  
Necrosis Virus ◽  
Infectious Hematopoietic Necrosis

scholarly journals Development of Real-Time Polymerase Chain Reaction Assay with TaqMan Probe for the Quantitative Detection of Infectious Hypodermal and Hematopoietic Necrosis Virus from Shrimp

2006 ◽  
Vol 89 (1) ◽  
pp. 240-244 ◽  
Author(s):  
Zhi-Qin Yue ◽  
Hong Liu ◽  
Wei-Ji Wang ◽  
Zhi-Wen Lei ◽  
Cheng-Zhu Liang ◽  
...  
Keyword(s):  
Polymerase Chain Reaction ◽  
Real Time ◽  
Real Time Pcr ◽  
Taqman Probe ◽  
Quantitative Detection ◽  
Necrosis Virus ◽  
Chain Reaction ◽  
Pcr Assay ◽  
The Real ◽  
Polymerase Chain

Abstract An assay was developed for the detection of infectious hypodermal and hematopoietic necrosis virus (IHHNV) based on real-time quantitative polymerase chain reaction (PCR). A pair of primers and a TaqMan probe were designed that are specific for the recognition of a conservative region in the IHHNV genome. The IHHNV real-time PCR assay had a detection limit of 9 DNA copies,with a dynamic range of detection between 9 106 and 9 DNA copies. The primer pairs and probe were specific to IHHNV and did not cross-reactwith shrimp genomic DNAor other shrimp viruses such as White Spot Syndrome Virus (WSSV), Monodon Baculovirus (MBV), and hepatopancreatic parvovirus (HPV). This assay has a broad application for basic and clinical investigations. For clinical samples, the real-time PCR assay detected all the positive samples screened by conventional PCR, which indicated the sensitivity of the real-time assay. The IHHNV real-time PCR assay with high sensitivity, specificity, wide range of detection ability, and simplicity is particularly useful for screening large numbers of specimens and measuring viral loads to monitor the broodstock.

scholarly journals Επιδημιολογική μελέτη του ιού Noda σε αλιεύματα, δίθυρα και ιχθείς και μελέτη της παθογένειας του ιού στο λαβράκι σε σχέση με τον εντοπισμό της πύλης εισόδου του ιού στον οργανισμό και τον τρόπο εξάπλωσής του στους ιστούς του ψαριού

2017 ◽  
Author(s):  
Ειρήνη Λάμπου
Keyword(s):  
Real Time ◽  
Real Time Pcr ◽  
Dicentrarchus Labrax ◽  
Nervous Necrosis Virus ◽  
Necrosis Virus ◽  
Viral Encephalopathy And Retinopathy

Η ιογενής εγκεφαλοπάθεια και αμφιβληστροειδοπάθεια (Viral Encephalopathy and Retinopathy, VER) είναι μία νευροπαθολογική νόσος των ψαριών που έχει θεωρηθεί ως η πιο σοβαρή ιογενής απειλή στην εκτροφή ειδών θαλασσινού νερού στην περιοχή της Μεσογείου. Αιτιολογικός παράγοντας της νόσου είναι ένας RNA-ιός, που ανήκει στο γένος Betanodavirus της οικογένειας Nodaviridae (Carstens et al., 2000). Σκοπός της παρούσας διατριβής ήταν η μελέτη στοιχείων επιδημιολογίας των Betanoda-ιών σε άγρια και εκτρεφόμενα είδη ψαριών και δίθυρων που απαντώνται στα ελληνικά θαλάσσια ύδατα και η διερεύνηση πτυχών της παθογένειας του ιού σε ένα εξαιρετικά ευαίσθητο είδος, το ευρωπαϊκό λαβράκι, Dicentrarchus labrax. Για το σκοπό αυτό διενεργήθηκαν πειραματισμοί που περιγράφονται σε δύο κεφάλαια. Στο πρώτο κεφάλαιο παρατίθενται αναλυτικά οι δειγματοληψίες που πραγματοποιήθηκαν για τον εντοπισμό του ιού σε άγριους και εκτρεφόμενους πληθυσμούς και το πρωτόκολλο της δοκιμής real-time PCR που χρησιμοποιήθηκε για την ανίχνευση γενώματος Betanoda-ιών. Τα αποτελέσματα φανέρωσαν ότι μεγάλο εύρος ειδών τελεόστεων ιχθύων και δίθυρων αποτελούν ξενιστές Betanoda-ιών και συγκεκριμένα στελεχών που στην πλειοψηφία τους κατατάσσονται στον γενότυπο RGNNV. Ο ιός εντοπίστηκε σε 10 είδη για πρώτη φορά διεθνώς, ενώ ιδιαίτερο ενδιαφέρον παρουσιάζει η ανίχνευση ενός RGNNV/SJNNV ανασυνδυασμού σε σαφρίδι. H φυλογενετική ανάλυση των αλληλουχιών τμήματος του γονιδίου της πολυμεράσης (pol) και της καψιδιακής πρωτεΐνης (cp) του ιού στα θετικά δείγματα, κατέδειξε ότι η γενετική παραλλακτικότητα μεταξύ των απομονώσεων ήταν μικρή, ακόμα και μεταξύ άγριων και εκτρεφόμενων πληθυσμών διαφορετικών περιοχών αλίευσης. Το γεγονός αυτό αποτελεί ισχυρή ένδειξη ότι πολλά είδη άγριων ψαριών αποτελούν δεξαμενή του ιού RGNNV, από όπου ο ιός μπορεί να μεταδοθεί στα ευαίσθητα, ελεύθερα ή εκτρεφόμενα, είδη. Στο δεύτερο κεφάλαιο αξιολογήθηκε η λοιμογόνος ικανότητα και διασπορά του ιού Red-spotted Grouper Nervous Necrosis Virus (RGNNV) στον οργανισμό, μετά από ενοφθαλμισμό του ιού στον οφθαλμό, τα βράγχια, την πλευρική γραμμή και τον οισοφάγο ιχθυδίων ευρωπαϊκού λαβρακιού, Dicentrarchus labrax. Η εκδήλωση θνησιμότητας και κλινικής συμπτωματολογίας τυπικής ιογενούς εγκεφαλοπάθειας και αμφιβληστροειδοπάθειας σε συνδυασμό με την παρατήρηση κενοτoπιώδους εκφύλισης στον εγκέφαλο και τον αμφιβληστροειδή και την ανίχνευση του ιικού γενώματος σε ιστούς λαβρακιών από όλες τις πειραματικές ομάδες, υποδηλώνουν ότι ο ιός RGNNV εισέρχεται στον οργανισμό μέσω πολλών διαφορετικών οδών. Παρόλο που ο αρχικός εντοπισμός και το μοτίβο διασποράς του στους ιστούς διέφερε μεταξύ των πειραματικών ομάδων, η εξάπλωση του ιού RGNNV στον εγκέφαλο και τον οφθαλμό φαίνεται ότι επιτυγχάνεται νευρογενώς. Ιαιμία εκδηλώθηκε μόνο μετά την εγκατάσταση της μόλυνσης στον εγκέφαλο και ενώ ο ιός είχε ήδη ανιχνευθεί σε νευρικούς ιστούς.

Feldvalidierung einer real-time PCR zum Nachweis von Mycoplasma hyopneumoniae in Nasentupfermaterial von lebenden Schweinen

2005 ◽  
Vol 147 (9) ◽  
pp. 373-379 ◽  
Author(s):  
F. Zeeh ◽  
P. Kuhnert ◽  
R. Miserez ◽  
M. G. Doherr ◽  
W. Zimmermann
Keyword(s):  
Real Time ◽  
Real Time Pcr ◽  
Mycoplasma Hyopneumoniae
Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document