Distributed Processing of Large BioMedical 3D Images

Author(s):  
Konstantinos Liakos ◽  
Albert Burger ◽  
Richard Baldock
Author(s):  
John C. Russ

Three-dimensional (3D) images consisting of arrays of voxels can now be routinely obtained from several different types of microscopes. These include both the transmission and emission modes of the confocal scanning laser microscope (but not its most common reflection mode), the secondary ion mass spectrometer, and computed tomography using electrons, X-rays or other signals. Compared to the traditional use of serial sectioning (which includes sequential polishing of hard materials), these newer techniques eliminate difficulties of alignment of slices, and maintain uniform resolution in the depth direction. However, the resolution in the z-direction may be different from that within each image plane, which makes the voxels non-cubic and creates some difficulties for subsequent analysis.


2009 ◽  
Vol 5 (2) ◽  
pp. 10 ◽  
Author(s):  
Jose Luis Zamorano ◽  

3D echocardiography (3DE) will gain increasing acceptance as a routine clinical tool as the technology evolves due to advances in technology and computer processing power. Images obtained from 3DE provide more accurate assessment of complex cardiac anatomy and sophisticated functional mechanisms compared with conventional 2D echocardiography (2DE), and are comparable to those achieved with magnetic resonance imaging. Many of the limitations associated with the early iterations of 3DE prevented their widespread clinical application. However, recent significant improvements in transducer and post-processing software technologies have addressed many of these issues. Furthermore, the most recent advances in the ability to image the entire heart in realtime and fully automated quantification have poised 3DE to become more ubiquitous in clinical routine. Realtime 3DE (RT3DE) systems offer further improvements in the diagnostic and treatment planning capabilities of cardiac ultrasound. Innovations such as the ability to acquire non-stitched, realtime, full-volume 3D images of the heart in a single heart cycle promise to overcome some of the current limitations of current RT3DE systems, which acquire images over four to seven cardiac cycles, with the need for gating and the potential for stitch artefacts.


2010 ◽  
Vol 69 (18) ◽  
pp. 1653-1660
Author(s):  
Rasim Magamed ogly Alguliev ◽  
B. S. Agaev ◽  
T. Kh. Fataliev ◽  
T. S. Aliev

2020 ◽  
Vol 2020 (2) ◽  
pp. 100-1-100-6
Author(s):  
Takuya Omura ◽  
Hayato Watanabe ◽  
Naoto Okaichi ◽  
Hisayuki Sasaki ◽  
Masahiro Kawakita

We enhanced the resolution characteristics of a threedimensional (3D) image using time-division multiplexing methods in a full-parallax multi-view 3D display. A time-division light-ray shifting (TDLS) method is proposed that uses two polarization gratings (PGs). As PG changes the diffraction direction of light rays according to the polarization state of the incident light, this method can shift light rays approximately 7 mm in a diagonal direction by switching the polarization state of incident light and adjusting the distance between the PGs. We verified the effect on the characteristics of 3D images based on the extent of the shift. As a result, the resolution of a 3D image with depth is improved by shifting half a pitch of a multi-view image using the TDLS method, and the resolution of the image displayed near the screen is improved by shifting half a pixel of each viewpoint image with a wobbling method. These methods can easily enhance 3D characteristics with a small number of projectors.


Author(s):  
O. Dmytriieva ◽  
◽  
D. Nikulin

Роботу присвячено питанням розподіленої обробки транзакцій при проведенні аналізу великих обсягів даних з метою пошуку асоціативних правил. На основі відомих алгоритмів глибинного аналізу даних для пошуку частих предметних наборів AIS та Apriori було визначено можливі варіанти паралелізації, які позбавлені необхідності ітераційного сканування бази даних та великого споживання пам'яті. Досліджено можливість перенесення обчислень на різні платформи, які підтримують паралельну обробку даних. В якості обчислювальних платформ було обрано MapReduce – потужну базу для обробки великих, розподілених наборів даних на кластері Hadoop, а також програмний інструмент для обробки надзвичайно великої кількості даних Apache Spark. Проведено порівняльний аналіз швидкодії розглянутих методів, отримано рекомендації щодо ефективного використання паралельних обчислювальних платформ, запропоновано модифікації алгоритмів пошуку асоціативних правил. В якості основних завдань, реалізованих в роботі, слід визначити дослідження сучасних засобів розподіленої обробки структурованих і не структурованих даних, розгортання тестового кластера в хмарному сервісі, розробку скриптів для автоматизації розгортання кластера, проведення модифікацій розподілених алгоритмів з метою адаптації під необхідні фреймворки розподілених обчислень, отримання показників швидкодії обробки даних в послідовному і розподіленому режимах з застосуванням Hadoop MapReduce. та Apache Spark, проведення порівняльного аналізу результатів тестових вимірів швидкодії, отримання та обґрунтування залежності між кількістю оброблюваних даних, і часом, витраченим на обробку, оптимізацію розподілених алгоритмів пошуку асоціативних правил при обробці великих обсягів транзакційних даних, отримання показників швидкодії розподіленої обробки існуючими програмними засобами. Ключові слова: розподілена обробка, транзакційні дані, асоціативні правила, обчислюваний кластер, Hadoop, MapReduce, Apache Spark


Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document