scholarly journals Genome sequence of a divergent Colombian isolate of potato virus V (PVV) infecting Solanum phureja

2016 ◽  
Vol 60 (01) ◽  
pp. 49-54 ◽  
Author(s):  
P. GUTIÉRREZ ◽  
H. JARAMILLO MESA ◽  
M. MARÍN MONTOYA
Keyword(s):  
Genome Sequence ◽  
Potato Virus ◽  
Solanum Phureja ◽  
Colombian Isolate

Complete genome sequence of a novel potato virus S strain infecting Solanum phureja in Colombia

2013 ◽  
Vol 158 (10) ◽  
pp. 2205-2208 ◽  
Author(s):  
Pablo A. Gutiérrez ◽  
Juan Fernando Alzate ◽  
Mauricio A. Marín-Montoya
Keyword(s):  
Genome Sequence ◽  
Potato Virus ◽  
Complete Genome Sequence ◽  
Complete Genome ◽  
Solanum Phureja ◽  
Potato Virus S

scholarly journals Complete Genome Sequence of Potato Virus T from Bolivia, Obtained from a 33-Year-Old Sample

2018 ◽  
Vol 7 (18) ◽  
Author(s):  
Ian P. Adams ◽  
Jorge Abad ◽  
Cesar E. Fribourg ◽  
Neil Boonham ◽  
Roger A. C. Jones
Keyword(s):  
Genome Sequence ◽  
Potato Virus ◽  
Complete Genome Sequence ◽  
Complete Genome ◽  
Genomic Sequence ◽  
Complete Genomic Sequence ◽  
Potato Sample ◽  
Type Isolate ◽  
Andean Potato ◽  
Complete Genomic

We present the complete genomic sequence of a Potato virus T (PVT) isolate originally obtained from a Bolivian potato sample collected in 1976, and we compare it with the genome of the PVT type isolate from Peru. There is an 81% nucleotide identity between the two genomes of this Andean potato virus.

scholarly journals Detección serológica y molecular del Potato virus X (PVX) en tubérculos-semilla de papa (Solanum tuberosum L. y Solanum phureja Juz. Bukasov) en Antioquia, Colombia

2016 ◽  
Vol 18 (1) ◽  
Author(s):  
Daniela García Ruíz ◽  
Manuel Andrés Olarte Quintero ◽  
Pablo Andrés Gutiérrez Sánchez ◽  
Mauricio Alejandro Marín Montoya
Keyword(s):  
Solanum Tuberosum ◽  
Potato Virus ◽  
Solanum Tuberosum L ◽  
Potato Virus X ◽  
Solanum Phureja ◽  
Das Elisa

<p>El Potato virus (PVX) es uno de los virus más limitantes del cultivo de la papa en el mundo. Es transmitido solamente por contacto y por tubérculo-semilla. Su control se fundamenta en la siembra de tubérculos certificados por su sanidad viral y en la disponibilidad de metodologías de diagnóstico altamente sensibles. En este trabajo se evaluó la prevalencia del PVX en cuatro diferentes tejidos de tubérculos de Solanum tuberosum subsp. andigena var. Diacol-Capiro y S. phureja var. Criolla Colombia utilizando pruebas de DAS-ELISA para 128 submuestras y de RT-qPCR para 32 grupos de submuestras (4 submuestras/grupo). Los resultados de las pruebas serológicas  indicaron la presencia de PVX en el 6,25 y 50% de las submuestras analizadas para la variedad Diacol-Capiro y Criolla Colombia, respectivamente; mientras que los niveles de prevalencia del PVX utilizando la detección por RT-qPCR fueron del 93,75%, independientemente de la variedad de papa y del tejido evaluado. Los valores promedio del ciclo umbral (Ct) en las RT-qPCR fueron de 25,6 (Ct=18,02 a 34,49) y el análisis de las curvas de desnaturalización permitió identificar dos variantes del virus con valores de Tm de 79,5±1°C y 83,7±1°C. La secuenciación de los amplicones obtenidos por RT-qPCR para los controles positivos y para dos de las muestras, confirmó su naturaleza viral. Estos resultados señalan unos muy altos niveles de prevalencia de PVX en el material de siembra de papa en Antioquia y la necesidad de fortalecer los programas de certificación de semilla con pruebas de detección como RT-qPCR.</p>

scholarly journals A 33-Year-Old Plant Sample Contributes the First Complete Genomic Sequence of Potato Virus U

2018 ◽  
Vol 7 (23) ◽  
Author(s):  
Ian P. Adams ◽  
Neil Boonham ◽  
Roger A. C. Jones
Keyword(s):  
Amino Acid ◽  
Genome Sequence ◽  
Potato Virus ◽  
Genomic Sequence ◽  
Amino Acid Sequences ◽  
Plant Sample ◽  
Complete Genomic Sequence ◽  
Potato Sample ◽  
Complete Genomic

A Potato virus U isolate detected in a Peruvian potato sample collected in 1977 produced the first genome sequence of this virus. When this genome sequence was compared with those of other nepoviruses, the amino acid sequences of RNA1 and RNA2 were most similar to those of subgroup C nepoviruses.

scholarly journals Complete genome sequence of an Iranian isolate of Potato virus X from the legume plant Pisum sativum

Virus Genes ◽  
2009 ◽  
Vol 39 (1) ◽  
pp. 141-145 ◽  
Author(s):  
Neda Esfandiari ◽  
Mina Kohi-Habibi ◽  
Thomas Hohn ◽  
Mikhail M. Pooggin
Keyword(s):  
Pisum Sativum ◽  
Genome Sequence ◽  
Potato Virus ◽  
Complete Genome Sequence ◽  
Complete Genome ◽  
Potato Virus X ◽  
Iranian Isolate ◽  
Legume Plant

Complete genome sequence of a divergent strain of potato virus P isolated from Solanum tuberosum in Russia

2019 ◽  
Vol 164 (11) ◽  
pp. 2891-2894 ◽  
Author(s):  
Hironobu Yanagisawa ◽  
Yosuke Matsushita ◽  
Aleksandr Khiutti ◽  
Nina Mironenko ◽  
Yasuo Ohto ◽  
...  
Keyword(s):  
Solanum Tuberosum ◽  
Genome Sequence ◽  
Potato Virus ◽  
Complete Genome Sequence ◽  
Complete Genome ◽  
Divergent Strain

scholarly journals Potato Virus Y (PVY) y Potato Yellow Vein Virus (PYVV) en Infecciones Mixtas No Causan Síntomas Atípicos en Plantas de Papa

2016 ◽  
Vol 11 (2) ◽  
pp. 26 ◽  
Author(s):  
Jenny Paola Alfaro García ◽  
Liliana Franco-Lara
Keyword(s):  
Solanum Tuberosum ◽  
Potato Virus ◽  
Potato Virus Y ◽  
Yellow Vein ◽  
Solanum Phureja ◽  
Rt Pcr ◽  
Potato Yellow Vein Virus

Observaciones anteriores en cultivos de papa (<em>Solanum tuberosum</em> y <em>Solanum phureja</em>) mostraron síntomas llamados atípicos en este trabajo, que consistían en hojas con manchas irregulares verde oscuro sobre un fondo amarillo intenso, que sugieren la presencia de virus. Estos síntomas no correlacionan con ningún virus descrito para papa en Colombia. En plantas, existen reportes de infecciones virales con dos o más virus que llevan a interacciones como sinergismo o antagonismo. En este trabajo se evaluó la hipótesis de que los síntomas atípicos podrían ser resultado de infecciones mixtas entre PYVV (<em>Potato yellow vein virus) (Crinivirus) </em>y PVY (<em>Potato virus Y</em>) (<em>Potyirus)</em>, pues ambos virus son comunes en cultivos de papa en Colombia. Se reportan resultados de RT-PCR (reacción en cadena de la polimerasa mediada por retrotranscripción) para la detección de PYVV y PVY, y de ELISA para PVX, PVS, PVM y PRLV en 57 plantas con y sin síntomas atípicos provenientes de campo. Los resultados no apoyan la hipótesis planteada, pues de 10 plantas con síntomas atípicos evaluadas solo una estaba infectada con los dos virus.  Por otro lado, coinfecciones de PVY y PYVV se observaron en plantas sin síntomas aparentes (4 plantas de 5 evaluadas) y en plantas con síntomas característicos de PYVV (17 plantas de 37 evaluadas). Del total de 20 plantas evaluadas por ELISA, 18 presentaban infección por PVX aunque no se observaron síntomas asociados a este virus. Ocho de estas plantas, además de PVX estaban infectadas también con PVY y PYVV, pero mostraban síntomas de característicos de PYVV, lo que sugiere que PVX tampoco correlaciona con los síntomas atípicos. Se sugiere la presencia de un virus no reportado infectando el cultivo de papa en Colombia.

Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document