scholarly journals Investigations of the Energy Transfer in the Phycobilisome Antenna of Arthrospira platensis Using Femtosecond Spectroscopy

2020 ◽  
Vol 10 (11) ◽  
pp. 4045
Author(s):  
Alexandra Fălămaș ◽  
Sebastian A. Porav ◽  
Valer Tosa

Understanding the energy transfer in phycobilisomes extracted from cyanobacteria can be used for building biomimetic hybrid systems for optimized solar energy collection and photocurrent amplification. In this paper, we applied time-resolved absorption and fluorescence spectroscopy to investigate the ultrafast dynamics in a hemidiscoidal phycobilisome obtained from Arthrospira platensis. We obtained the steady-state and time-resolved optical properties and identified the possible pathways of the excitation energy transfer in the phycobilisome and its components, phycocyanin and allophycocyanin. The transient absorption data were studied using global analysis and revealed the existence of ultrafast kinetics down to 850 fs in the phycobilisome. The fluorescence lifetimes in the nanosecond time-scale assigned to the final emitters in each sample were obtained from the time-correlated single photon counting fluorescence experiments.

2018 ◽  
Author(s):  
Κωνσταντίνος Σεϊντής

Ένα μεγάλο μέρος των διαδικασιών που συμβαίνουν στη φύση βασίζονται σε αντιδράσεις επαγόμενες από το φως σε μοριακό επίπεδο. Μία τέτοια φυσική διαδικασία είναι η όραση, η οποία οφείλεται στον μηχανισμό ισομερισμού cis - trans του χρωμοφόρου retinal, ο οποίος πραγματοποιείται σε μερικά εκατοντάδες femtoseconds (10-15 seconds) από την απορρόφηση του φωτός. Μία δεύτερη, σημαντική φυσική διαδικασία για τη διαιώνιση της ζωής αποτελεί η φωτοσύνθεση στα φυτά. Η διαδικασία αυτή ξεκινά από τις βασικές δομικές μονάδες των φυτών και των βακτηρίων (RC - LHI και LH2), οι οποίες αποτελούνται από ένα μεγάλο αριθμό χρωμοφόρων μορίων που διατάσσονται διαδοχικά, σχηματίζοντας μεγάλες κυκλικές υπερδομές. Το φως απορροφάται αρχικά από μερικά χρωμοφόρα της υπερδομής (κυρίως μόρια χλωροφύλλης) και εν συνεχεία η ενέργεια που απορροφήθηκε διαμοιράζεται προς τα υπόλοιπα μέσω μηχανισμών σύμφωνης (coherent energy transfer) και ασύμφωνης (incoherent energy transfer) μεταφοράς. Η διάταξη των χρωμοφόρων της δομής αποτελεί το μονοπάτι που οδηγεί την ενέργεια στα κέντρα πραγματοποίησης των αντιδράσεων της φωτοδιάσπασης, που εκκινούν μέσω μηχανισμών διαχωρισμού των φορέων (Charge Separation - CS). Ο μηχανισμός του διαμοιρασμού της ενέργειας μεταξύ των χρωμοφόρων πραγματοποιείται και εδώ στην υπερταχέα κλίμακα των εκατοντάδων femtoseconds μέχρι τα λίγα picoseconds. Οι μηχανισμοί που διέπουν τις παραπάνω φυσικές διαδικασίες είναι αρκετά σύνθετοι και ο ακριβής τρόπος λειτουργίας τους προς το παρόν δεν έχει αποκρυπτογραφηθεί.Από τα ανωτέρω γίνεται αντιληπτό ότι προκειμένου να κατανοηθούν οι διεργασίες που λαμβάνουν χώρα στα συστήματα αυτά πρέπει πρώτον, να κατασκευαστούν δομές που να προσομοιώνουν αυτές τις διεργασίες και δεύτερον, να χρησιμοποιηθούν και να αναπτυχθούν περαιτέρω τεχνικές υψηλής χρονικής ανάλυσης με διακριτική ικανότητα ίδιας ή μικρότερης τάξης με τη χρονική κλίμακα πραγματοποίησης των φαινομένων. Στην παρούσα διδακτορική διατριβή πραγματοποιήθηκε η μελέτη πρωτότυπων συστημάτων, αποτελούμενων από ένα πλήθος ομοίων ή διαφορετικών χρωμοφόρων. Τα συστήματα αυτά ονομάζονται πολυχρωμοφορικά ή υπερμοριακά (multichromophoric ή supramolecular systems) και το πεδίο έρευνας είναι γνωστό ως τεχνική φωτοσύνθεση (artificial photosynthesis). Η μελέτη περιελάμβανε τόσο μηχανισμούς μεταφοράς ενέργειας, όσο και φορέων, όπως συμβαίνει στη διαδικασία της φωτοσύνθεσης. Για το σκοπό αυτό, χρησιμοποιήθηκαν οι τεχνικές χρονικής ανάλυσης φθορισμού Fluorescence Upconversion (FU) και Time Correlated Single Photon Counting (TCSPC) και της φωτοεπαγόμενης απορρόφησης Transient Absorption (TA). Επίσης, μέσω θεωρητικών υπολογισμών επιχειρήθηκε η πρόβλεψη της χρονικής κλίμακας εμφάνισης των φαινομένων μεταφοράς ενέργειας, που προέκυψε από τις πειραματικές μετρήσεις.Η διδακτορική εργασία δομείται ως εξής: αρχικά, στο Κεφάλαιο 2 παρουσιάζεται η βασική θεωρία της μη γραμμικής οπτικής, που είναι απαραίτητη για να κατανοηθούν οι τεχνικές χρονικής ανάλυσης που χρησιμοποιήθηκαν. Ακολούθως, στο Κεφάλαιο 3 δίνονται όλες οι βασικές αρχές της φωτοφυσικής και οι θεωρίες της μεταφοράς ενέργειας. Τέλος, το θεωρητικό μέρος ολοκληρώνεται με το Κεφάλαιο 4, όπου περιγράφονται αναλυτικά οι τεχνικές χρονικής ανάλυσης που αναφέρθηκαν νωρίτερα.Όσον αφορά το πειραματικό μέρος και τα αποτελέσματα που προέκυψαν από τη μελέτη των μοριακών συστημάτων, χωρίστηκε σε τρία κεφάλαια. Στο Κεφάλαιο 5 παρουσιάζονται δύο μοριακά διμερή Pyrene - Bodipy, τα οποία διαφέρουν στο είδος του αποδέκτη - Bodipy, με εισαγωγή μίας μικρής δομικής αλλαγής μεταξύ των δύο. Τα δύο διμερή παρουσιάζουν υπερταχέα μεταφορά ενέργειας από τον δότη - Pyrene προς τον αποδέκτη - Bodipy στην ίδια χρονική κλίμακα (~0.5 ps). Ωστόσο, εξαιτίας της μικρής δομικής διαφοροποίησης του ενός Bodipy, το ένα διμερές εμφανίζει μηχανισμό διαχωρισμού φορέων σε πολικό διαλύτη (acetonitrile), το οποίο εξηγήθηκε θεωρητικά μέσω της εξίσωσης Weller.Στο Κεφάλαιο 6 η μελέτη συνεχίζεται με δύο πολυχρωμοφορικά συστήματα, τα οποία εμφανίζουν πιο σύνθετους μηχανισμούς από τα προηγούμενα διμερή. Τα συστήματα αυτά αποτελούνται από έναν δότη δενδομερούς και αποδέκτες Bodipys. Το πρώτο δενδρομερές (Α1) είναι μικρότερο και έχει τρεις αποδέκτες, ενώ το δεύτερο έχει έξι (Α2). Η ενέργεια για τα δύο συστήματα μεταφέρεται και εδώ στην υπερταχέα χρονική κλίμακα (0.2 - 0.3 ps) από τον πυρήνα δενδρομερούς προς τα περιφεριακά χρωμοφόρα Bodipys. Επίσης, το Α1 εμφανίζει μεταφορά φορέων σε πολικό περιβάλλον (benzonitrile), ενώ στο Α2 αυτό συμβαίνει τόσο σε πολικό, όσο και σε απολικό (toluene) περιβάλλον. Μάλιστα για το Α2 η μεταφορά φορέων (ηλεκτρονίων) συμβαίνει σε ανταγωνιστική χρονική κλίμακα με τη μεταφορά ενέργειας και στους δύο διαλύτες, εμποδίζοντας την αποδοτικότητά της. Ενδιαφέρον εύρημα αποτελεί ο μεγάλος χρόνος επανασύνδεσης των φορέων (Charge Recombination), δηλαδή ο μεγάλος χρόνος ζωής της στάθμης CS (Long - Lived Charge Separation) για το μεγαλύτερο από τα δύο συστήματα (Α2). Ο μεγάλος χρόνος για το CS είναι επιθυμητός, όπως συμβαίνει και στη διαδικασία της φωτοσύνθεσης, ώστε να μπορούν να εκκινήσουν συγκεκριμένες χημικές διεργασίες. Τέλος, στο Κεφάλαιο 7, που αποτελεί το επίκεντρο της παρούσας διδακτορικής διατριβής, παρουσιάζονται νέα, πρωτότυπα πολυχρωμοφορικά συστήματα, των οποίων τα χρωμοφόρα, σε αντίθεση με αυτά του Κεφαλαίου 6, δεν αλληλεπιδρούν ενδομοριακά. Τα χρωμοφόρα αυτά συγκρατούνται μεταξύ τους μέσω πλατίνας (Pt) και εμφανίζουν αναλλοίωτες οπτικές ιδιότητες, συγκρινόμενα με την ελεύθερη μορφή τους σε διάλυμα. Έτσι, ο χρόνος ζωής και η κβαντική απόδοση των υπερμοριακών συστημάτων παραμένει ίδια με των μονομερών χρωμοφόρων. Επίσης, εκτός από την διατήρηση των παραπάνω χαρακτηριστικών, τα χρωμοφόρα των συγκεκριμένων υπερδομών αυτοοργανώνονται (self - assemble) σε διάλυμα, δημιουργώντας δομές υψηλής συμμετρίας, όπως ρόμβου, τετραγώνου και εξαγώνου. Μέσω της τεχνικής φθορισμού χρονικής ανάλυσης στα fs - ps, υπό συνθήκες μαγικής γωνίας και ανισοτροπίας, διαπιστώθηκε ο χρόνος μεταφοράς της ενέργειας για κάθε υπερδομή. Γνωρίζοντας ότι οι υπερδομές αυτές δεν παρουσιάζουν ενδομοριακές αλληλεπιδράσεις μεταξύ των χρωμοφόρων τους, οι πειραματικές τιμές συγκρίθηκαν με εκείνες που προέκυψαν από τη θεωρία του Förster (ασθενής αλληλεπίδραση). Σε κάποιες περιπτώσεις η ταύτιση ήταν εξαιρετική, ενώ σε άλλες δόθηκε η δυνατότητα κατανόησης δομικών διαταραχών που προκαλούν μικρές αποκλίσεις, οι οποίες είναι ανιχνεύσιμες μόνο με μετρήσεις χρονικής ανάλυσης της ανισοτροπίας φθορισμού. Οι υπερδομές που μελετήθηκαν προσομοιώνουν τις βασικές δομικές μονάδες της φωτοσύνθεσης, καταφέρνοντας να διαμοιράσουν την αρχικά απορροφούμενη ενέργεια προς όλα τα χρωμοφόρα που τις αποτελούν χωρίς απώλειες. Με αυτό τον τρόπο, λειτουργούν ως αποθήκες συλλογής φωτός, δημιουργώντας προοπτικές για ένα πλήθος εφαρμογών, όπως φωτοβολταϊκές διατάξεις, κρυστάλλους για lasers κ.α.


2021 ◽  
Author(s):  
Shahrea Mahbub ◽  
Sukanya Saha ◽  
Ramakrishna Guda ◽  
Joseph Furgal

<div> <div> <div> <p>Organic electronic materials have advantages over inorganics in terms of versatility, cost and processability. Recent advancements in organic materials for light emitting diodes (OLED), field effect transistors (OFET), and photovoltaics have engendered extensive innovation potential on this field. In this research, we focus on synthesizing SQ (silsesquioxane) based oligomers cross- linked by di-bromo-aromatic linkers and explore how the cross-linker and oligomer length influence their photophysical properties. Bis-tri-alkoxy silyl (linker) model compounds were synthesized to compare non-cage photophysical properties with the oligomers. Several techniques such as UV/Vis, fluorescence, FTIR, thermal gravimetric analysis (TGA) have been used to characterize the systems. Time-resolved fluorescence and femtosecond transient absorption spectroscopy are used to understand the excited state dynamics of these materials. Studies are carried out to understand the differences between monomers and oligomers and potential energy transfer and charge transfer between the cages and cross-linking chromophores. Transient absorption showed lower energy absorption from the excited states, suggesting short range communication between moieties. Single photon counting studies have shown distinct lifetime differences between most linkers and cages showing possible excitation energy transfer through these materials. Transient absorption anisotropy measurements have shown signatures for excitation energy transfer between linker chromophores for oligomeric compounds. The silsesquioxane (SQ) backbone of the oligomers gives substantial thermal stability as well as solution processability, giving better flexibility for achieving energy transfer between linking chromophores. </p> </div> </div> </div>


2021 ◽  
Author(s):  
Shahrea Mahbub ◽  
Sukanya Saha ◽  
Ramakrishna Guda ◽  
Joseph Furgal

<div> <div> <div> <p>Organic electronic materials have advantages over inorganics in terms of versatility, cost and processability. Recent advancements in organic materials for light emitting diodes (OLED), field effect transistors (OFET), and photovoltaics have engendered extensive innovation potential on this field. In this research, we focus on synthesizing SQ (silsesquioxane) based oligomers cross- linked by di-bromo-aromatic linkers and explore how the cross-linker and oligomer length influence their photophysical properties. Bis-tri-alkoxy silyl (linker) model compounds were synthesized to compare non-cage photophysical properties with the oligomers. Several techniques such as UV/Vis, fluorescence, FTIR, thermal gravimetric analysis (TGA) have been used to characterize the systems. Time-resolved fluorescence and femtosecond transient absorption spectroscopy are used to understand the excited state dynamics of these materials. Studies are carried out to understand the differences between monomers and oligomers and potential energy transfer and charge transfer between the cages and cross-linking chromophores. Transient absorption showed lower energy absorption from the excited states, suggesting short range communication between moieties. Single photon counting studies have shown distinct lifetime differences between most linkers and cages showing possible excitation energy transfer through these materials. Transient absorption anisotropy measurements have shown signatures for excitation energy transfer between linker chromophores for oligomeric compounds. The silsesquioxane (SQ) backbone of the oligomers gives substantial thermal stability as well as solution processability, giving better flexibility for achieving energy transfer between linking chromophores. </p> </div> </div> </div>


Author(s):  
Mike Bruce ◽  
Rama R. Goruganthu ◽  
Shawn McBride ◽  
David Bethke ◽  
J.M. Chin

Abstract For time resolved hot carrier emission from the backside, an alternate approach is demonstrated termed single point PICA. The single point approach records time resolved emission from an individual transistor using time-correlated-single-photon counting and an avalanche photo-diode. The avalanche photo-diode has a much higher quantum efficiency than micro-channel plate photo-multiplier tube based imaging cameras typically used in earlier approaches. The basic system is described and demonstrated from the backside on a ring oscillator circuit.


2016 ◽  
Vol 16 (10) ◽  
pp. 3827-3833 ◽  
Author(s):  
Davide Tamborini ◽  
Mauro Buttafava ◽  
Alessandro Ruggeri ◽  
Franco Zappa

2020 ◽  
Vol 3 (1) ◽  
Author(s):  
Fusamichi Akita ◽  
Ryo Nagao ◽  
Koji Kato ◽  
Yoshiki Nakajima ◽  
Makio Yokono ◽  
...  

AbstractIron-stress induced protein A (IsiA) is a chlorophyll-binding membrane-spanning protein in photosynthetic prokaryote cyanobacteria, and is associated with photosystem I (PSI) trimer cores, but its structural and functional significance in light harvesting remains unclear. Here we report a 2.7-Å resolution cryo-electron microscopic structure of a supercomplex between PSI core trimer and IsiA from a thermophilic cyanobacterium Thermosynechococcus vulcanus. The structure showed that 18 IsiA subunits form a closed ring surrounding a PSI trimer core. Detailed arrangement of pigments within the supercomplex, as well as molecular interactions between PSI and IsiA and among IsiAs, were resolved. Time-resolved fluorescence spectra of the PSI–IsiA supercomplex showed clear excitation-energy transfer from IsiA to PSI, strongly indicating that IsiA functions as an energy donor, but not an energy quencher, in the supercomplex. These structural and spectroscopic findings provide important insights into the excitation-energy-transfer and subunit assembly mechanisms in the PSI–IsiA supercomplex.


2006 ◽  
Vol 421 (1-3) ◽  
pp. 205-209 ◽  
Author(s):  
D. Anestopoulos ◽  
M. Fakis ◽  
P. Persephonis ◽  
V. Giannetas ◽  
J. Mikroyannidis

Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document