scholarly journals From In silico Protein Epitope Density Prediction to Testing Escherichia coli O157:H7 Vaccine Candidates in a Murine Model of Colonization

2016 ◽  
Vol 6 ◽  
Author(s):  
Daniel Tapia ◽  
Brittany N. Ross ◽  
Anjana Kalita ◽  
Mridul Kalita ◽  
Christopher L. Hatcher ◽  
...  
Keyword(s):  
Escherichia Coli ◽  
Murine Model ◽  
In Silico ◽  
Escherichia Coli O157 ◽  
Vaccine Candidates ◽  
Density Prediction ◽  
Epitope Density

scholarly journals Diseño, síntesis, caracterización y evaluación in vitro de la actividad de los péptidos antimicrobianos contra bacterias patógenas resistentes a antibióticos

2019 ◽  
Vol 43 (169) ◽  
pp. 614-627
Author(s):  
Claudia Ortiz López
Keyword(s):  
Escherichia Coli ◽  
Staphylococcus Aureus ◽  
Pseudomonas Aeruginosa ◽  
In Silico ◽  
Escherichia Coli O157

Los péptidos antimicrobianos han atraído mucha atención como nuevos agentes terapéuticos contra enfermedades infecciosas. En este estudio se hizo el diseño racional in silico de 18 péptidos catiónicos con actividad antimicrobiana contra bacterias patógenas resistentes utilizando el programa DEPRAMP desarrollado en el Grupo de Investigación en Bioquímica y Microbiología de la Universidad Industrial de Santander. Posteriormente, los péptidos diseñados se sintetizaron en fase sólida con el método de 9-fluorenilmetoxicarbonilo en medio ácido. Se obtuvieron secuencias cortas de 17 aminoácidos con un grado de pureza entre 95 y 98 %, estructura secundaria de hélice alfa, carga neta catiónica (entre +3 y +6), punto isoeléctrico entre 10,04 y 12,03 e índice de hidropatía entre -0,62 y 1,14. Todos los péptidos antimicrobianos mostraron actividad antibacteriana y bactericida in vitro frente al menos una de las cepas patógenas estudiadas: Escherichia coli O157: H7, Pseudomonas aeruginosa y Staphylococcus aureus resistente a la meticilina. Los péptidos antimicrobianos GIBIM-P5S9K y GIBIM-P5F8W registraron la mejor actividad antibacteriana, alcanzando una concentración mínima inhibitoria (CMI 99) en rangos de 0,5 a 25 μM frente a las tres cepas evaluadas, de las cuales Escherichia coli O157: H7 fue la más sensible frente al péptido antimicrobiano GIBIMP5F8W, con una CMI 99 de 0,5 μM y una concentración mínima bactericida de 10 μM, en tanto que la cepa de Pseudomonas aeruginosa fue la más resistente, con una CMI de más de 100 μM frente a más de cinco péptidos antimicrobianos. La toxicidad de los péptidos sobre los eritrocitos produjo un porcentaje de hemólisis menor al 40 % en concentraciones de 50 μM. Por su parte, en las líneas celulares de carcinoma de pulmón A549 y HepG2, el único compuesto que presentó toxicidad fue GIBIM-P5F8W, presentando un 36% de células viables en concentraciones de 100 μM del péptido en la línea celular A549.

scholarly journals In-silico design, expression, and purification of novel chimeric Escherichia coli O157:H7 OmpA fused to LTB protein in Escherichia coli

PLoS ONE ◽  
2017 ◽  
Vol 12 (3) ◽  
pp. e0173761 ◽  
Author(s):  
Aytak Novinrooz ◽  
Taghi Zahraei Salehi ◽  
Roya Firouzi ◽  
Sina Arabshahi ◽  
Abdollah Derakhshandeh
Keyword(s):  
Escherichia Coli ◽  
In Silico ◽  
Escherichia Coli O157 ◽  
Expression And Purification ◽  
In Silico Design

Escherichia coli O157 : H7 forms attaching and effacing lesions at the terminal rectum of cattle and colonization requires the LEE4 operon

Microbiology ◽  
2005 ◽  
Vol 151 (8) ◽  
pp. 2773-2781 ◽  
Author(s):  
Stuart W. Naylor ◽  
Andrew J. Roe ◽  
Pablo Nart ◽  
Kevin Spears ◽  
David. G. E. Smith ◽  
...  
Keyword(s):  
Escherichia Coli ◽  
Type Iii Secretion ◽  
Reservoir Host ◽  
Escherichia Coli O157 ◽  
Lesion Formation ◽  
Vaccine Candidates ◽  
E Coli ◽  
Type Iii ◽  
Transmission Electron ◽  
Associated Proteins

Enterohaemorrhagic Escherichia coli O157 : H7 is a human pathogen that causes no apparent disease in cattle, its primary reservoir host. Recent research has demonstrated that E. coli O157 : H7 predominately colonizes the distal few centimetres of the bovine rectum, and in this study, the LEE4 operon encoding a type III secretion system translocon and associated proteins was shown to be essential for colonization. A deletion mutant of LEE4 failed to colonize cattle, in contrast to a co-inoculated strain containing a chromosomal complement of the operon, therefore fulfilling ‘molecular’ Koch's postulates for this virulence determinant. In addition, attaching and effacing (A/E) lesions were detectable in E. coli O157 : H7 microcolonies from the terminal rectum of both naturally and experimentally colonized cattle when examined by transmission electron microscopy. This study proves that type III secretion is required for colonization of cattle by E. coli O157 : H7, and that A/E lesion formation occurs at the bovine terminal rectum within E. coli O157 : H7 microcolonies. The research confirms the value of using type III secreted proteins as vaccine candidates in cattle.

scholarly journals In silico genomic analyses reveal three distinct lineages of Escherichia coli O157:H7, one of which is associated with hyper-virulence

BMC Genomics ◽  
2009 ◽  
Vol 10 (1) ◽  
pp. 287 ◽  
Author(s):  
Chad R Laing ◽  
Cody Buchanan ◽  
Eduardo N Taboada ◽  
Yongxiang Zhang ◽  
Mohamed A Karmali ◽  
...  
Keyword(s):  
Escherichia Coli ◽  
In Silico ◽  
Escherichia Coli O157 ◽  
Genomic Analyses
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