scholarly journals Identification of Salicornia population: Anatomical characterization and RAPD fingerprinting

2011 ◽  
Vol 63 (4) ◽  
pp. 1087-1098 ◽  
Author(s):  
Dubravka Milic ◽  
Jadranka Lukovic ◽  
Mihajla Djan ◽  
Lana Zoric ◽  
Dragana Obreht ◽  
...  

Anatomical and Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) analysis of two typical populations of Salicornia europaea from Montenegro and Greece (Lesvos), one typical population of S. ramosissima from Spain and one population that belongs to the Salicornia genus from Serbia, was undertaken to develop a new strategy for identifying Salicornia plants. Anatomical variability and differentiation were examined using Principal Component Analysis (PCA) and Multivariate Discriminant Function Analysis (MDA). On the basis of the anatomical measurements, the four populations were classified into three groups: one joining the plants from Serbia and Spain, one comprising the Montenegrin group and one comprising the Lesvos group. RAPD analysis indicated that populations from Spain and Serbia were closely related to each other and the Lesvos group was quite different from all the other investigated populations. These results opened up the possibility that the specimens from Serbia belonged to S. ramosissima and not to S. europaea, as reported previously.

2018 ◽  
Vol 49 (14) ◽  
pp. 2320-2329 ◽  
Author(s):  
Heide Klumpp ◽  
Kerry L. Kinney ◽  
Runa Bhaumik ◽  
Jacklynn M. Fitzgerald

AbstractBackgroundReappraisal, an adaptive emotion regulation strategy, is associated with frontal engagement. In internalizing psychopathologies (IPs) such as anxiety and depression frontal activity is atypically reduced suggesting impaired regulation capacity. Yet, successful reappraisal is often demonstrated at the behavioral level. A data-driven approach was used to clarify brain and behavioral relationships in IPs.MethodsDuring functional magnetic resonance imaging, anxious [general anxiety disorder (n = 43), social anxiety disorder (n = 72)] and depressed (n = 47) patients reappraised negative images to reduce negative affect (‘ReappNeg’) and viewed negative images (‘LookNeg’). After each trial, the affective state was reported. A cut-point (i.e. values <0 based on ΔReappNeg-LookNeg) demarcated successful reappraisers. Neural activity for ReappNeg-LookNeg, derived from 37 regions of interest, was submitted to Principal Component Analysis (PCA) to identify unique components of reappraisal-related brain response. PCA factors, symptom severity, and self-reported habitual reappraisal were submitted to discriminant function analysis and linear regression to examine whether these data predicted successful reappraisal (yes/no) and variance in reappraisal ability.ResultsMost patients (63%) were successful reappraisers according to the behavioral criterion (values<0; ΔReappNeg-LookNeg). Discriminant function analysis was not significant for PCA factors, symptoms, or habitual reappraisal. For regression, more activation in a factor with high loadings for frontal regions predicted better reappraisal facility. Results were not significant for other variables.ConclusionsAt the individual level, more activation in a ‘frontal’ factor corresponded with better reappraisal facility. However, neither brain nor behavioral variables classified successful reappraisal (yes/no). Findings suggest individual differences in regions strongly implicated in reappraisal play a role in on-line reappraisal capability.


1984 ◽  
Vol 62 (11) ◽  
pp. 2302-2306
Author(s):  
Declan M. Troy

Holboell's redpoll (Carduelis flammea holboellii) is purported to differ from the common redpoll (C. f. flammea) by being larger, especially in having a larger bill. The distinctiveness of these two taxa was investigated by comparing skeletal dimensions of five samples collected during the breeding season; two from the range of holboellii, three from the range of nominate flammea. Scores along the first principal component, generated from the analysis of 19 skeletal measurements, were used as a measure of overall size. No difference in size of redpolls was found among the samples. Gonys length was used as a measure of bill size. This measure exhibited more interlocality variability than did overall size but could not be used to support the distinctiveness of the two taxa. Male redpolls from the holboellii sample had the largest bills; however, bills from the other location were intermediate in length. Females from both holboellii locations had intermediate length bills. An attempt to identify any measurements that could be used to segregate the two taxa was made using discriminant function analysis. No useful function could be generated. I conclude that recognition of holboellii as a taxon distinct from flammea is unwarranted.


2019 ◽  
Vol 54 (2) ◽  
pp. 187-194
Author(s):  
MM Akter ◽  
MG Azom ◽  
MS Reza Sabuz ◽  
MH Islam ◽  
MR Islam

Studies on sexual dimorphism of gongota Loach Canthophrys gongota (Local name: Pahari Gutum) was performed capturing them from the Atrai River of Dinajpur district in Bangladesh. Females had light blotches and patches with thick and rounded pectoral and pelvic fins while males having dark blotches and patches with thin and comparatively pointed paired fins. Body size, lengths of the anal fin and distances between the bases of pectoral, pelvic and caudal fins were significantly different (5.62 < F < 11.65, P ˂ 0.05) between the sexes of C. gongota. The expansion factors of mean thin-plate grids and vectors also showed that the head region of males was statistically different from females, whereas abdomen and tail of the females were considerably broader than those of the males. Both PCA (principal component analysis) and DFA (discriminant function analysis) plots showed morphologically little overlapping of landmark points which discriminated the females from the males. These findings are the first records on the sexual dimorphism of this rare species that would be baseline in a future study. Bangladesh J. Sci. Ind. Res.54(2), 187-194, 2019


2013 ◽  
Author(s):  
Όλγα Παπαδοπούλου

Το κρέας εξαιτίας της υψηλής περιεκτικότητας σε νερό και της αφθονίας σε θρεπτικάσυστατικά θεωρείται ένα από τα πιο ευαλλοίωτα τρόφιμα. Η αλλοίωση του κρέατος είναι έναοικολογικό φαινόμενο το οποίο αποδίδεται σχεδόν ολοκληρωτικά στη μικροβιακήδραστηριότητα, η οποία ποικίλει και εξαρτάται από τα είδη των μικροοργανισμών που απαντώνταισε αυτό, τα χαρακτηριστικά του κρέατος, τον τρόπο συσκευασίας και το περιβάλλον στο οποίοαποθηκεύεται. Η μικροβιακή αλλοίωση προκαλεί το σχηματισμό γλοιώδους υφής και δυσάρεστωνοσμών, κάνοντας το ανεπιθύμητο στον καταναλωτή. Είναι λοιπόν σημαντικό, να βρεθούν γρήγορακαι αξιόπιστα συστήματα ώστε να μπορεί να παρακολουθείται η ποιότητα και φρεσκάδα τουκρέατος κατά την παραγωγή και διάθεση του.Ο γενικός στόχος της παρούσας μελέτης ήταν ο προσδιορισμός της αλλοίωσης του κρέατοςμε διαφορετικές ταχείες αναλυτικές τεχνικές. Η μικροβιολογική εξέλιξη της χλωρίδας του κρέατοςπαρακολουθούνταν παράλληλα με το μεταβολικό της προφίλ. Για το σκοπό αυτόπραγματοποιήθηκαν δύο διαφορετικά πειράματα. Στο πρώτο πείραμα, που αφορούσε αλλοίωσηχοιρινού κιμά σε πέντε διαφορετικές θερμοκρασίες (0, 5, 10, 15 και 20°C) και δύο συσκευασίες(αέρας και ΜΑΡ), εφαρμόστηκαν ποικίλες ταχείες αναλυτικές τεχνικές με σκοπό να διερευνηθούνοι βιοχημικές αλλαγές κατά τη διάρκεια της αλλοίωσης του κρέατος. Στο δεύτερο πείραμα έγινεεμβολιασμός στείρου ιστού κρέατος με επιλεγμένους μικροοργανισμούς σε δύο διαφορετικέςθερμοκρασίες (4 και 10°C) και δύο συσκευασίες (αέρας και ΜΑΡ), με σκοπό τη μελέτη τωνμεταβολικών προϊόντων που παράγονται κατά τη συντήρηση του κρέατος. Οι αναλυτικές τεχνικέςπου εφαρμόστηκαν στη μελέτη αυτή, ήταν φασματοσκοπία υπερύθρου με μετασχηματισμόFourier (FTIR), ηλεκτρονική μύτη (Libra Nose), υγρή χρωματογραφία υψηλής απόδοσης (HPLC),αέρια χρωματογραφία/φασματοσκοπία μάζας με μικροεκχύλιση στερεής φάσης (HP/SPME,GC/MS) και διάφορες μοριακές τεχνικές (Rep-PCR, Sau-PCR και PFGE).Αρχικά, χρησιμοποιήθηκε η τεχνική φασματοσκοπίας υπερύθρου με μετασχηματισμόFourier (FTIR), η οποία είναι μια απλή, εύχρηστη και ταχεία μέθοδος που δε καταστρέφει τοδείγμα και μπορεί να χρησιμοποιηθεί για την ανίχνευση της ποιότητας του κρέατος. Για αυτό τολόγο, δείγματα χοιρινού κιμά αναλύθηκαν και με τα δεδομένα που συλλέχθηκαν από τα φάσματα δημιουργήθηκαν μαθηματικά μοντέλα χρησιμοποιώντας τη μέθοδο της Διακριτικής ΑνάλυσηςΜερικών Ελαχίστων Τετραγώνων (PLS-DA) ώστε να γίνει εφικτή η πρόβλεψη της ποιοτικήςκλάσης του κρέατος το οποίο ήταν ήδη χαρακτηρισμένο ως φρέσκο, σχετικά-φρέσκο ήαλλοιωμένο από την οργανοληπτική ανάλυση, ενώ για την εκτίμηση του πληθυσμού τωνδιαφόρων ομάδων μικροοργανισμών χρησιμοποιήθηκε η μέθοδος της Γραμμικής ΠαλινδρόμησηςΜερικών Ελαχίστων Τετραγώνων (PLS-R), Από τα αποτελέσματα φαίνεται πως η PLS-DA έδειξεσωστή κατηγοριοποίηση σε ποσοστό 87,7% των δειγμάτων χοιρινού κιμά που είχαν συντηρηθείαερόβια και 79,3% των δειγμάτων που είχαν συντηρηθεί σε ΜΑΡ σε σχέση με τον οργανοληπτικότους προφίλ. Αντίστοιχα, από τις τιμές που προέκυψαν από τους δείκτες επίδοσης των μοντέλωνπου αναπτύχθηκαν, φαίνεται πως υπήρξε καλός συσχετισμός μεταξύ των δεδομένων του FTIR καιτων μικροβιολογικών δεδομένων. Ο δείκτης προκατάληψης (Bf) για όλες τις μικροβιακές ομάδεςπου εξετάστηκαν ήταν κοντά στη μονάδα, αποδεικνύοντας ότι δεν υπήρξε κάποια συστηματικήαπόκλιση (υπερ ή υπο-εκτίμηση του μικροβιακού πληθυσμού) από τα μοντέλα. Επιπλέον, με βάσητις τιμές του συντελεστή ακρίβειας (Af), φαίνεται πως η μέση απόκλιση μεταξύ των εκτιμήσεωνκαι των παρατηρήσεων ήταν 7,5% και 7,9% και 6,0% και 5,9%, για την Ολική ΜεσόφιληΧλωρίδα και τις Pseudomonas spp., στην αερόβια συντήρηση και στην συντήρηση σε ΜΑΡαντίστοιχα.Στη συνέχεια χρησιμοποιήθηκε η ηλεκτρονική μύτη ως μια γρήγορη τεχνική για τηνεκτίμηση της αλλοίωσης του χοιρινού κρέατος. Τα πτητικά συστατικά χοιρινού κιμά αναλύθηκανστην ηλεκτρονική μύτη και τα δεδομένα που συλλέχθηκαν υποβλήθηκαν σε Ανάλυση ΚυρίωνΣυνιστωσών (Principal Component Analysis, PCA) και στη συνέχεια αναλύθηκαν με ΔιακριτικήΑνάλυση Παραγόντων (Discriminant Function Analysis, DFA) και Μηχανές ΔιανυσμάτωνΥποστήριξης (Support Vector Machines, SVM). Από τα αποτελέσματα προκύπτει πως υπήρξεσωστή κατηγοριοποίηση των δειγμάτων στις τρεις προκαθορισμένες κλάσεις ποιότητας μεανάλυση DFA. Η ακρίβεια πρόβλεψης για τα δείγματα που είχαν συσκευαστεί σε αέρα και σεΜΑΡ ήταν 86% και 82% αντίστοιχα. Eπίσης, το μοντέλο που αναπτύχθηκε με SVM ήταν σε θέσηνα εκτιμήσει το μικροβιακό φορτίο της κάθε μικροβιακής ομάδας ικανοποιητικά.Κατόπιν, χρησιμοποιήθηκαν 2 ακόμα ταχείες αναλυτικές τεχνικές, η HPLC για τονπροσδιορισμό των οργανικών οξέων και η GC/MS για τον προσδιορισμό των πτητικών ενώσεωνπου ανευρίσκονται στον χοιρινό κιμά κατά την συντήρησή του. Λήφθηκαν ενδιαφέρουσες πληροφορίες για την εξέλιξη της αλλοίωσης υπό διαφορετικές συνθήκες αποθήκευσης καιεντοπίστηκαν αρκετές ενώσεις οι οποίες θα μπορούσαν να χρησιμοποιηθούν ως δείκτεςαλλοίωσης. Επιπλέον, τα μοντέλα που αναπτύχθηκαν με PLS-R για την GC/MS και με SVM γιατην HPLC έδωσαν ικανοποιητικά αποτελέσματα όσον αφορά στις εκτιμήσεις των μικροβιακώνομάδων (π.χ. η τιμή του συντελεστή συσχέτισης για την ΟΜΧ στην αερόβια συσκευασία ήταν0,792 και 0,866 για την HPLC και την GC/MS αντίστοιχα). Επίσης, η ανάλυση με DFA είχεακρίβεια πρόβλεψης σε ποσοστό 97,60% για την HPLC και 76,06% για την GC/MS επί τουσυνόλου των δειγμάτων που είχαν συντηρηθεί σε ΜΑΡ αντίστοιχα. Επιπρόσθετα, η GC/MSχρησιμοποιήθηκε για να προσδιορίσει τις πτητικές ουσίες που υπάρχουν κατά την αλλοίωσηστείρου μη εμβολιασμένου και εμβολιασμένου ιστού κρέατος με επιλεγμένους αλλοιωγόνουςμικροοργανισμούς. Τα αποτελέσματα αναλύθηκαν με PLS-DA και ανάλυση της διακύμανσηςενός παράγοντα. Από τα αποτελέσματα, φάνηκαν να υπάρχουν συσχετίσεις μεταξύ των πτητικώνουσιών και των ειδικών αλλοιωγόνων μικροοργανισμών.Τέλος, εξετάστηκε η ποικιλομορφία, καθώς και η εξέλιξη του βακτηρίου Β. thermosphactaσε επίπεδο στελέχους, το οποίο απομονώθηκε από χοιρινό κιμά υπό διαφορετικές συνθήκεςσυσκευασίας (αέρας και τροποποιημένη ατμόσφαιρα) και θερμοκρασίας (0, 5, 10 και 15°C) απότο επιλεκτικό υπόστρωμα για τον Brochothrix spp. Επιλέχθηκαν 3 μοριακές τεχνικές καιπροέκυψαν διαφορετικά αποτελέσματα τα οποία αποδίδονται στο διαφορετικό βαθμό διακριτικήςικανότητας της κάθε μοριακής τεχνικής. Η διαφοροποίηση των στελεχών βασίστηκε κυρίως στηθερμοκρασία και τα αποτελέσματα έδειξαν πως όλα τα στελέχη ανήκουν στο είδος Brochothrixthermosphacta.


2000 ◽  
Vol 23 (1) ◽  
pp. 169-172 ◽  
Author(s):  
Helvécio Della Coletta Filho ◽  
Marcos Antonio Machado ◽  
M. Luiza P.N. Targon ◽  
Jorgino Pompeu Jr.

RAPD analysis of 19 Ponkan mandarin accessions was performed using 25 random primers. Of 112 amplification products selected, only 32 were polymorphic across five accessions. The absence of genetic variability among the other 14 accessions suggested that they were either clonal propagations with different local names, or that they had undetectable genetic variability, such as point mutations which cannot be detected by RAPD.


2011 ◽  
Vol 35 (6) ◽  
pp. 1172-1176 ◽  
Author(s):  
Alberto Miele ◽  
Luiz Antenor Rizzon

The purpose of this paper was to establish the sensory characteristics of wines made from old and newly introduced red grape varieties. To attain this objective, 16 Brazilian red varietal wines were evaluated by a sensory panel of enologists who assessed wines according to their aroma and flavor descriptors. A 90 mm unstructured scale was used to quantify the intensity of 26 descriptors, which were analyzed by means of the Principal Component Analysis (PCA). The PCA showed that three important components represented 74.11% of the total variation. PC 1 discriminated Tempranillo, Marselan and Ruby Cabernet wines, with Tempranillo being characterized by its equilibrium, quality, harmony, persistence and body, as well as by, fruity, spicy and oaky characters. The other two varietals were defined by vegetal, oaky and salty characteristics; PC 2 discriminated Pinot Noir, Sangiovese, Cabernet Sauvignon and Arinarnoa, where Pinot Noir was characterized by its floral flavor; PC 3 discriminated only Malbec, which had weak, floral and fruity characteristics. The other varietal wines did not show important discriminating effects.


2010 ◽  
Vol 62 (4) ◽  
pp. 1151-1162 ◽  
Author(s):  
Marina Juskovic ◽  
P. Vasiljevic ◽  
V. Randjelovic ◽  
V. Stevanovic ◽  
Branka Stevanovic

Daphne malyana Blecic (Thymeleaceae) is an endemic species of the western part of the Balkan Peninsula, distributed in the mountains, canyons and gorges of N. Montenegro, E. Bosnia and W. Serbia. The comparative morphoanatomic investigations have included four distantly separated populations of the species D. malyana, i.e. two from Serbia, from the ravines of Sokoline and Vranjak on Mt. Tara, and two from Montenegro, in the canyons of the Tara and Piva rivers. Comparative morphoanatomical studies have shown the presence of general adaptive characteristics of a specific, conservative xeromorphic type, slightly differing in each population. Principal component analysis (PCA) and canonical discriminant analysis (CDA) of 20 morphoanatomical characteristics of the leaves and stems have shown a clear distinction between the populations from the river Piva canyon (Montenegro) and those from the Sokoline ravine (Serbia), on one side, and those of Vranjak gorge (Serbia) and of the river Tara canyon (Montenegro) on the other side. It may be assumed that the mild morphological variability of the isolated populations of the Balkan endemic species D. malyana in the canyons and gorges seem to have been affected by the microclimate conditions in their habitats.


Zootaxa ◽  
2020 ◽  
Vol 4861 (3) ◽  
pp. 429-443
Author(s):  
CAROLINA PIRES ◽  
MARCELO WEKSLER ◽  
CIBELE R. BONVICINO

The region of Lagoa Santa, Minas Gerais, Brazil, is one of the most important karstic areas of the Brazilian Quaternary due to the faunistic diversity of living and extinct forms. Among them, some taxa remain poorly studied, as is the case of Calomys anoblepas Winge 1887. Despite the recent allocation of the taxon within Juliomys, its description and morphological analysis are condensed, based on comparative few specimens and on few informative characters. In this study, we investigate characters proposed to distinguish species of Juliomys, and reevaluate the taxonomic status of the fossil Juliomys anoblepas. We analyzed 80 cranio-dental morphological characters in 233 specimens represented by the four species currently recognized: J. pictipes (Osgood 1933), J. rimofrons Oliveira & Bonvicino 2002, J. ossitenuis Costa, Pavan, Leite & Fagundes 2007, and J. ximenezi Christoff, Vieira, Oliveira, Gonçalves, Valiati & Tomasi 2016. We also performed principal component analysis on eight craniodental measurements available for the J. anoblepas hypodigm. The review of morphological systems and the evaluation of the characters used in the literature revealed that there are no diagnostic characters in the anterior portion of the skull and in the molar series of Juliomys, being difficult to differentiate the fossil from the other living species. Only six qualitative characters were variable and applicable to the hypodigm of J. anoblepas. Characters are polymorphic, invariable, or the fossil is not sufficiently complete to determinate its states. The taxon could not be morphometrically differentiated from J. pictipes and J. ossitenuis. Based on the results presented herein, we consider J. anoblepas as a nomen dubium and restrict its name to the taxon’s hypodigm. 


1976 ◽  
Vol 129 (6) ◽  
pp. 598-603 ◽  
Author(s):  
C. J. Lucas ◽  
Sidney Grown ◽  
Peter Stringer ◽  
Saradha Supramaniam

SummaryThe UCLS questionnaire, in a form modified to include a measure of syllabus-boundness, and a questionnaire to measure psychiatric symptomatology (the MHQ) were administered to two groups of students, one seeking help for emotional problems, the other a control group. Groups were compared on tests, test findings were inter-correlated, and scores were related to academic success. The UCLSQ is confirmed as a reliable research instrument. Principal component analysis again indicates a separation of psychoneurotic and motivational components of study difficulty. Syllabus-boundness (‘Sylbism’) emerges as a relatively independent trait, with a significant negative relationship to work satisfaction in both groups. MHQ, scores again show a positive correlation between phobic anxiety and academic attainment for patients.


2002 ◽  
Vol 16 (3) ◽  
pp. 221-235 ◽  
Author(s):  
Toivo Aavik ◽  
Jüri Allik

The main purpose of this paper is to investigate the variety of value describing words and interrelation of value categories in the Estonian language. To accomplish this aim, a psycholexical approach was adopted, during which a set of 560 value‐related words was selected from the Estonian Orthological Dictionary and the results were compared with the Schwartz Values Survey (SVS). When principal‐component analysis was applied on the self‐ratings of a reduced list of 78 value‐related words, six factors emerged and were labelled as benevolence, self‐enhancement, broadmindedness, hedonism, conservatism, and self‐realization. However, all these themes are interrelated and load on a singular secondary dimension. The constructs measured by SVS and the value categories in Estonian were only partially interchangeable; moderate correlations imply an imperfect correspondence: each theme was related to many categories on the other questionnaire. However, a significant general structure refers to the same two‐dimensional level of higher‐order values described by Schwartz in 1992. Copyright © 2002 John Wiley & Sons, Ltd.


Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document