scholarly journals Exploring methodological challenges in network meta-analysis models and developing methodology for outlier detection

2020 ◽  
Author(s):  
Μαρία Πετροπούλου

Οι συστηματικές ανασκοπήσεις και μετα-αναλύσεις έχουν καθιερωθεί ως αναπόσπαστο κομμάτι της έρευνας για τη σχετική αποτελεσματικότητα μεταξύ παρεμβάσεων. Σήμερα, η λήψη αποφάσεων και η ιεράρχηση μεταξύ ανταγωνιστικών παρεμβάσεων σε πολλούς τομείς, βασίζονται στην ανάπτυξη του μετα-ανάλυσης δικτύων (ΜΑΔ). Ο ολοένα αυξανόμενος αριθμός διαφορετικών εκπαιδευτικών και ψυχολογικών παρεμβάσεων στο εκπαιδευτικό σύστημα οδηγεί στην ανάγκη σύγκρισης τους με στόχο την εύρεση της καταλληλότερης παρέμβασης. Η μετα-ανάλυση δικτύων συνθέτει τόσο άμεσες όσο και έμμεσες πληροφορίες έτσι ώστε να παρέχει πιο ισχυρά αποτελέσματα και εκτιμήσεις με αυξημένη ακρίβεια σε σχέση με τις εκτιμήσεις ανά ζεύγη. Η ΜΑΔ έχει γίνει ένα δημοφιλές στατιστικό εργαλείο στη σύνθεση στοιχείων. Βάσει μιας συλλογής δεδομένων με δημοσιευμένες ΜΑΔ από την αρχή έως τις 14 Απριλίου 2015, η τάση δείχνει τον αυξανόμενο αριθμό δημοσιευμένων της ΜΑΔ και της εφαρμογής ολοένα και καταλληλότερων μεθοδολογιών. Επιπλέον, η επισκόπηση των χαρακτηριστικών των δημοσιευμένων ΜΑΔ είναι μια χρήσιμη πηγή πληροφόρησης γιαερευνητές που στοχεύουν να αναβαθμίσουν την υπάρχουσα γνώση σχετικά με την αξιολόγηση των μεθόδων ΜΑΔ. Αυτή η συλλογή από 456 δημοσιευμένων ΜΑΔ υποδεικνύει ότι πολλές ΜΑΔ παρέχουν σημαντικούς μεθοδολογικούς περιορισμούς, αλλά η εκτεταμένη χρήση των κατάλληλων μεθοδολογιών και της πληρότητας των εκθέσεων (όπως η περιγραφή των χρησιμοποιούμενων στατιστικών μεθόδων) έχει βελτιωθεί με την πάροδο των ετών. Για παράδειγμα, ένας αυξανόμενος αριθμός ΜΑΔ χρησιμοποίησε κατάλληλες μεθόδους για να ελέγξει την αξιοπιστία της υπόθεσης της συνέπειας και τα τελευταία χρόνια γύρω στο 90% των άρθρων ανέφερε σαφώς αν χρησιμοποιήθηκε το μοντέλο τυχαίων ή σταθερών επιδράσεων. Παρόλο που η βιβλιογραφική μελέτη έδειξε βελτιωμένη στατιστική μεθοδολογία, εξακολουθούν να υπάρχουν μεθοδολογικές πτυχές στα μοντέλα μετα-αναλύσεων δικτύων που χρειάζονται ακόμα περαιτέρω ανάπτυξη. Ένα κοινό πρόβλημα στη σύνθεση των μελετών είναι η ύπαρξη ακραίων και / ή επηρεάζουσων μελετών. Παρόλο που οι ακραίες και οι επηρεάζουσες μελέτες ενδέχεται να οδηγήσουν σε μεροληπτικά αποτελέσματα, ελάχιστη ερευνητική δουλειά έχει πραγματοποιηθεί για τη διερεύνηση τέτοιων μελετών στη ΜΑΔ. Για το λόγο αυτό, η παρούσα διδακτορική διατριβή επικεντρώνεται στην ανάπτυξη μεθοδολογίας για τη διερεύνηση ακραίων και επηρεάζουσων μελετών. Η ετερογένεια και η ασυνέπεια μπορούν να θεωρηθούν ως διαφορές στους τροποποιητές του αποτελέσματος σε ένα δίκτυο παρεμβάσεων. Μια πιθανή πηγή ετερογένειας και ασυνέπειας αποτελεί η ύπαρξη ακραίων ήεπηρεάζουσων μελετών. Ως ακραία ορίζεται η μελέτη που απέχει πολύ από τα υπόλοιπα δεδομένα και δεν προβλέπεται ικανοποιητικά από το μοντέλο που έχουμε υποθέσει, ενώ ως επηρεάζουσα η μελέτη που επηρεάζει τις παραμέτρους του μοντέλου, δηλαδή τις εκτιμήσεις του δικτύου και την ετερογένεια. Αρκετές μεθοδολογίες για την εύρεση ακραίων και επηρεάζουσων μελετών έχουν αναπτυχθεί στη μετα-ανάλυση δύο παρεμβάσεων, μεθοδολογίες που θεωρούν την είσοδο ή έξοδο μελετών, μεθοδολογίες που στηρίζονται στη συνάρτηση πιθανοφάνειας ή μεθοδολογίες που βασίζονται στη λήψη εναλλακτικών κατανομών για ετερογένεια. Στη παρούσα διδακτορική διατριβή παρουσιάζονται πολλά απλά μέτρα εύρεσης ακραίων και επηρεάζουσων μελετών. Μέτρα θεωρώντας τη διαγραφή μελέτης για την εύρεση ακραίων και επηρεάζουσων μελετών επεκτάθηκαν στο μοντέλο ΜΑΔ. Ο προς τα εμπρός αλγόριθμος αναζήτησης αναπτύχθηκε πρόσφατα στη μετα-παλινδρόμηση. Οαλγόριθμος βασίζεται στη σταδιακή προσθήκη των μελετών, ξεκινά με ένα υποσύνολο μελετών που θεωρείται απαλλαγμένο από ακραίες μελέτες και προσθέτει σταδιακά τις μελέτες μέχρι να εισέλθουν όλες οι μελέτες. Οι έντονες αλλαγές των μέτρων παρακολούθησης κατά τη διάρκεια της αναζήτησης αποτελεί ένδειξη για πιθανές ακραίες ή / και επηρεάζουσες μελέτες. Στην διδακτορική διατριβή, η μεθοδολογία με τον προς τα εμπρός αλγόριθμο αναζήτησης για τη διερεύνηση ακραίων ή/και επηρεάζουσων μελετών αναπτύχθηκε στο μοντέλο ΜΑΔ από το μοντέλο της μετα-παλινδρόμησης. Επιπλέον, επέκτεινα ένα νέο μοντέλο τυχαίων επιδράσεων με τη μετατόπιση της διακύμανσης, λαμβάνοντας υπόψη τις ακραίες μελέτες από το μοντέλο της απλής μετα-ανάλυσης δύο παρεμβάσεων στο μοντέλο της ΜΑΔ. Το πλεονέκτημα του μοντέλου τυχαίων επιδράσεων με τη μετατόπιση της διακύμανσης είναι ότι προσφέρει την ικανότητα μείωσης του βάρους των ακραίων μελετών και συνεπώς μπορεί να χρησιμοποιηθεί ως ανάλυση ευαισθησίας. Τα διάφορα μέτρα και οι δύο προτεινόμενες μεθοδολογίες στη ΜΑΔ για διερεύνηση των ακραίων και επηρεάζουσων μελετών, με τον προς τα εμπρός αλγόριθμο αναζήτησης και το μοντέλο τυχαίων επιδράσεων με μετατόπιση της διακύμανσης, εφαρμόστηκαν σε δημοσιευμένα δίκτυα μετα-αναλύσεων και σε προσομοιωμένα δεδομένα. Τα αποτελέσματα από τι εφαρμογές υποδεικνύουν την εύρεση ακραίων και επηρεάζουσων μελετών στα δεδομένα. Οι προτεινόμενες μεθοδολογίες αποτελούν καλά υποσχόμενα εργαλεία για τον εντοπισμό ακραίων και επηρεάζουσων μελετών και την εύρεση πηγών δημιουργίας υψηλής ετερογένειας και / ή ασυνέπειας. Για την υλοποίηση των διάφορων μέτρων εύρεσης ακραίωνκαι επηρεάζουσων μελετών αλλά και των δύο προτεινόμενων μεθοδολογιών σε ένα ευέλικτο και φιλικό προς το χρήστη λογισμικό, αναπτύχθηκε το στατιστικό πακέτο NMAoutlier στην R που περιγράφεται στη παρούσα διδακτορική διατριβή παρέχοντας λεπτομέρειες και οδηγίες για τον τρόπο χρήσης του πακέτου μέσω της εφαρμογής του σε πραγματικά δεδομένα.

2020 ◽  
Author(s):  
Taban Baghfalaki ◽  
Pierre‐Emmanuel Sugier ◽  
Therese Truong ◽  
Anthony N. Pettitt ◽  
Kerrie Mengersen ◽  
...  

Rheumatology ◽  
2021 ◽  
Vol 60 (Supplement_1) ◽  
Author(s):  
Luke Furtado O'Mahony ◽  
Arnav Srivastava ◽  
Puja Mehta ◽  
Coziana Ciurtin

Abstract Background/Aims  The aetiology of primary chronic pain syndromes (CPS) is highly disputed. One theory suggests that pain is due to a pro-inflammatory cytokine milieu leading to nociceptive activation. We performed a systematic review and meta-analysis aiming to assess differences in cytokines levels in CPS patients versus healthy controls (HC). Methods  Human studies published in English from PubMed, MEDLINE/Scopus and Cochrane databases were searched from inception up to January 2020. We included full text cross-sectional or longitudinal studies with cytokine measurements in CPS patients and HC. We excluded studies with underlying organic pathology. Quality assessment was completed using a modified version of the Newcastle-Ottawa Scale. Random-effects meta-analysis models were used to report pooled effects and 95% CIs. Study registered with PROSPERO (CRD42020193774). Results  Initial search yielded 324 papers, 36 studies (3229 participants) eligible for systematic review and 26 studies (2048 participants) suitable for metaanalysis. There were reproducible findings supporting trends of cytokine levels comparing CPS patients with HC. Eotaxin (chemokine) however was consistently raised in CPS. Meta-analysis showed significantly increased tumour necrosis factor (TNF) (SMD=0.39, p = 0.0009, %95I=0.16-0.63, p < 0.001; I2=70%, Q2 p < 0.001), interleukin (IL)-6 (SMD=0.15, 8 (SMD=0.26, p = 0.01, 95%CI =0.05-0.47; I2=61%, Q2 p = 0.005) and IL-10 (SMD=0.61; %95 = 0.34-0.89, p < 0.001; I2 = 10%, Q2 p = 0.34) in CPS compared to HC. Conclusion  We found significant differences in peripheral blood cytokine profiles of CPS patients compared to HC. However, the distinctive profile associated with CPS includes both pro-inflammatory (TNF-α, IL-6, IL-8), and anti-inflammatory cytokines (IL-10) in pooled analysis, as well as chemokine (eotaxin) signatures. Disclosure  L. Furtado O'Mahony: None. A. Srivastava: None. P. Mehta: None. C. Ciurtin: None.


Author(s):  
Ashleigh Kysar-Moon ◽  
Matthew Vasquez ◽  
Tierra Luppen

Abstract Research shows that most people experience at least one traumatic event in their lifetimes, and between 6% and 8% of those with a history of trauma will develop posttraumatic stress disorder (PTSD) and/or related mental health conditions. Women face a greater threat of trauma exposure and have a higher risk of PTSD and depression than men. Trauma-Sensitive Yoga (TSY), a body-based adjunctive therapy, has shown potential in several studies as an effective method for reducing PTSD and depression symptoms. However, existing research and systematic reviews vary widely in their methodological rigor and comparison samples. Thus, in this systematic review we examined the effectiveness of TSY among women with a history of trauma and depression who had participated in randomized control trials with clear control and experimental groups. Findings in fixed- and mixed-effects meta-analysis models suggest marginally significant to no effects of TSY on PTSD and depression outcomes. Our systematic review highlights critical questions and significant gaps in the existing literature about the rationale and best practices of TSY intervention duration.


Biometrics ◽  
2017 ◽  
Vol 74 (2) ◽  
pp. 548-556 ◽  
Author(s):  
Dan Jackson ◽  
Sylwia Bujkiewicz ◽  
Martin Law ◽  
Richard D. Riley ◽  
Ian R. White

2017 ◽  
Vol 27 (10) ◽  
pp. 2885-2905 ◽  
Author(s):  
Richard D Riley ◽  
Joie Ensor ◽  
Dan Jackson ◽  
Danielle L Burke

Many meta-analysis models contain multiple parameters, for example due to multiple outcomes, multiple treatments or multiple regression coefficients. In particular, meta-regression models may contain multiple study-level covariates, and one-stage individual participant data meta-analysis models may contain multiple patient-level covariates and interactions. Here, we propose how to derive percentage study weights for such situations, in order to reveal the (otherwise hidden) contribution of each study toward the parameter estimates of interest. We assume that studies are independent, and utilise a decomposition of Fisher’s information matrix to decompose the total variance matrix of parameter estimates into study-specific contributions, from which percentage weights are derived. This approach generalises how percentage weights are calculated in a traditional, single parameter meta-analysis model. Application is made to one- and two-stage individual participant data meta-analyses, meta-regression and network (multivariate) meta-analysis of multiple treatments. These reveal percentage study weights toward clinically important estimates, such as summary treatment effects and treatment-covariate interactions, and are especially useful when some studies are potential outliers or at high risk of bias. We also derive percentage study weights toward methodologically interesting measures, such as the magnitude of ecological bias (difference between within-study and across-study associations) and the amount of inconsistency (difference between direct and indirect evidence in a network meta-analysis).


2010 ◽  
Vol 58 (3) ◽  
pp. 257-278 ◽  
Author(s):  
Ashley Anker ◽  
Amber Marie Reinhart ◽  
Thomas Hugh Feeley

Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document