scholarly journals Σχεδιασμός και σύνθεση πεπτιδομιμητικών μορίων με βάση το τριμοριακό σύμπλοκο MHC-πεπτίδιο-TCR

2016 ◽  
Author(s):  
Μαίρη-Πατρίτσια Γιαννακάκη
Keyword(s):  
1H Nmr ◽  
13C Nmr ◽  
Esi Ms

Η Σκλήρυνση Κατά Πλάκας (ΣΚΠ) είναι μια ανοσολογικά ελεγχόμενη, φλεγμονώδης, απομυελινωτική ασθένεια, η οποία χαρακτηρίζεται από καταστροφή τη μυελίνης του Κεντρικού Νευρικού Συστήματος (ΚΝΣ) που οδηγεί σε σοβαρές παθολογικές καταστάσεις και παράλυση. Η κύρια αιτία της νόσου δεν έχει διευκρινιστεί, με επικρατέστερη θεωρία εμφάνισής της, εκείνη της αυτοανοσίας η οποία περιλαμβάνει το σχηματισμό του τριμοριακού συμπλόκου μεταξύ του Μείζονος Συστήματος Ιστοσυμβατότητας [MHC (HLA)], ανοσοκυρίαρχων επιτόπων των πρωτεϊνών της μυελίνης και του Υποδοχέα των Τ-κυττάρων (TCR). Στην παρούσα διατριβή, πραγματοποιήθηκε λεπτομερής χαρτογράφηση των αλληλεπιδράσεων που λαμβάνουν χώρα κατά τη δημιουργία του τριμοριακού συμπλόκου HLA- πεπτιδίου αντιγόνο-TCR, η οποία θα μπορούσε να δώσει τα απαραίτητα χαρακτηριστικά για τον ορθολογικό σχεδιασμό αναστολέων. Επίσης πραγματοποιήθηκε διαμορφωτική μελέτη του τριμοριακού συμπλόκου χρησιμοποιώντας ως πεπτίδιο-αντιγόνο τον επίτοπο ΜΒΡ83-96, καθώς έχει βρεθεί ότι αναγνωρίζεται σε μεγάλο ποσοστό από κύτταρα ασθενών με ΣΚΠ, ενώ χρησιμοποιήθηκαν οι υποδοχείς HLA και TCR από κρυσταλλογραφικά δεδομένα (pdb: 1YMM). Κύριος στόχος ήταν ο ορθολογικός σχεδιασμός πεπτιδομιμητικών μορίων τα οποία θα ενώνονται με τον υποδοχέα TCR, χωρίς να δεσμεύονται με τον HLA. Οι νέες ενώσεις σχεδιάστηκαν με σκοπό να εμποδίσουν τη δημιουργία του τριμοριακού συμπλόκου και συνεπώς να αναστείλουν τον περαιτέρω πολλαπλασιασμό και ενεργοποίηση των εγκεφαλιτογόνων Τ-κυττάρων που εμπλέκονται στη ΣΚΠ. Για τη μελέτη, έγινε σχεδιασμός του φαρμακοφόρου μοντέλου με βάση τον επίτοπο MBP83-96, πραγματοποιήθηκαν πειράματα i) μοριακής πρόσδεσης (docking), ii) προσομοιώσεις μοριακής δυναμικής (dynamics) καθώς κ iii) πειράματα κβαντικής μηχανικής/ μοριακής μηχανικής (QM/MM) για να προβλέψουμε τις πιθανές αλληλεπιδράσεις των αναλόγων με τον υποδοχέα TCR. Χρησιμοποιήθηκαν τα λογισμικά πρόγραμμα ΜΟΕ, AMBER, MOPAC και Gaussian σε λογισμικό περιβάλλον LINUX. Ακολούθησε η σύνθεση των προτεινόμενων αναλόγων, η ταυτοποίηση των οποίων έγινε με ESI-MS, 1H-NMR καθώς και 13C-NMR. Τα συντιθέμενα ανάλογα, δοκιμάστηκαν σε in vitro πειράματα με σκοπό την αξιολόγησή τους ως αναστολείς ενεργοποίησης των εγκεφαλιτογόνων Τ-κυττάρων.

scholarly journals Green Synthetic Protocol for (E)-1-Aryl-3-(2-morpholinoquinolin- 3-yl)prop-2-en-1-ones and Their Antimicrobial Activity

2019 ◽  
Vol 31 (9) ◽  
pp. 1895-1898
Author(s):  
Relangi Siva Subrahmanyam ◽  
Venkateswara Rao Anna
Keyword(s):  
Antimicrobial Activity ◽  
Spectral Data ◽  
1H Nmr ◽  
13C Nmr ◽  
Mass Spectral Data ◽  
In Vitro Antimicrobial Activity ◽  
Mass Spectral ◽  
Fungal Organisms

We report here an easy, efficient and green synthetic protocol for the (E)-1-aryl-3-(2-morpholinoquinolin-3-yl)prop-2-en-1-ones by the Claisen-Schmidt condensation of 2-morpholinoquinoline-3-carbaldehyde and different substituted acetophenones by using 1-butyl-3-methylimidazolium tetrafluoroborate (Bmim)BF4. The compounds were characterized by using 1H NMR, 13C NMR and mass spectral data and screened there in vitro antimicrobial activity against different bacterial and fungal organisms.

scholarly journals Σύνθεση και μελέτη της δομής και της βιοδραστικότητας οργανοκασσιτερικών ενώσεων με αρυλιμινο υποκατεστημένα βενζοϊκά οξέα

2015 ◽  
Author(s):  
Muvudji Cephas Mwanasaka
Keyword(s):  
Western Blot ◽  
1H Nmr ◽  
13C Nmr ◽  
Sds Page ◽  
Ft Ir

Στα πλαίσια της παρούσας διδακτορικής διατριβής πραγματοποιήθηκε μια διεπιστημονική ερευνητική εργασία, η οποία είχε ως κεντρική ιδέα τη χημεία και τη βιοδραστικότητα των οργανοκασσιτερικών ενώσεων. Για την επίτευξη της μελέτης αυτής, η ερευνητική εργασία κινήθηκε σε τρεις κεντρικούς άξονες: σχεδιασμός και σύνθεση, ανάλυση και ταυτοποίηση και, τέλος, in vitro μελέτη βιολογικών δράσεων. Αρχικά σχεδιάστηκαν και συντέθηκαν ιμίνες (βάσεις Schiff) παράγωγα του βενζοϊκού οξέος, από τη συμπύκνωση του 3- και του 4-αμινοβενζοϊκου οξέος με π-υποκατεστημένες (Η, ΝΟ2, Cl, MeO, Me2N) βενζαλδεΰδες, καθώς και από τη συμπύκνωση των π-υποκατεστημένων (Η, ΝΟ2, Cl, MeO, Me2N) ανιλίνων με π-φορμυλοβενζοϊκό οξύ. Από τις αντιδράσεις αυτές συντέθηκαν βιολογικά ενεργά αρυλιμηνο υποκατεστημένα βενζοϊκά οξέα, τα οποία χρησιμοποιήθηκαν στη συνέχεια της συνθετικής διαδικασίας ως ligands (L) για τη σύνθεση νέων τριοργανοκασσιτερικών εστέρων γενικού τύπου R3SnL με R= Μe και Ph. Η ταυτοποίηση και ο χαρακτηρισμός των νέων αυτών ligands και των συμπλόκων που συντέθηκαν πραγματοποιήθηκε με συνδυασμό αναλυτικών τεχνικών: φασματοσκοπικές τεχνικές (FT-IR, 1H-NMR, 13C-NMR, UV-vis), στοιχειακή ανάλυση και την κρυσταλλογραφία ακτίνων Χ. Επόμενο στάδιο ήταν η in vitro μελέτη βιοδραστικότητας των ενώσεων αυτών η οποία, χωρίστηκε σε δύο σκέλη. Το ένα βιολογικό σκέλος κινήθηκε σε κυτταρικό επίπεδο, όπου αξιολογήθηκε πρώτα η in vitro αποπτωτική δράση σε τέσσερεις καρκινικές κυτταρικές σειρές, ΗepG2, HeLa, K562 και N2a. Για το σκοπό αυτό χρησιμοποιήθηκε η δοκιμή ΜΤΤ (ΜΤΤ assay), η οποία εκτιμά την επίδραση στη βιωσιμότητα των κυττάρων μετά από έκθεσή τους σε διάφορες συγκεντρώσεις των ουσιών. Στη συνέχεια έγιναν νευροκυτταροτοξικές μελέτες, εκτιμώντας την ενδεχόμενη in vitro αναπτυξιακή νευροτοξικότητα. Για το σκοπό αυτό αξιολογήθηκε η επίδραση των υπό μελέτη ουσιών στη διαδικασία ανάπτυξης αξονικών προεκβολών σε υπό διαφοροποίηση Ν2a κύτταρα, μετά από έκθεση σε υποκυτταροτοξικές συγκεντρώσεις των υπό μελέτη ουσιών. Το άλλο βιολογικό σκέλος κινήθηκε σε μοριακό επίπεδο, στοχεύοντας στην εκτίμηση της επίδρασης των υπό μελέτη ουσιών σε συγκεκριμένους βιοχημικούς παράγοντες με σκοπό τη διαλεύκανση των βιοχημικών μηχανισμών δράσεών τους. Εκτιμήθηκε η δράση τους σε συγκεκριμένες πρωτεΐνες του νευροκυτταρικού σκελετού, χρησιμοποιώντας SDS-PAGE και ανοσοχημική τεχνική ανάλυσης Western blot. Επιπλέον, έγινε εκτίμηση της in vitro ανασταλτικής δράσης τους στη λιποξυγονάση, ένζυμο που είναι γνωστό για το ρόλο του στην παραγωγή ελευθέρων ριζών στη φλεγμονή. Τέλος, εκτιμήθηκε η ενδεχόμενη in vitro αντιοξειδωτική δράση τους, αξιολογώντας την ικανότητά τους στην αναστολή της επαγόμενης από το ΑΑΡΗ λιπιδικής υπεροξείδωσης, καθώς και την ικανότητα αλληλεπίδρασής τους με τη σταθερή ρίζα DPPH. Από τα αποτελέσματα που προέκυψαν προσπαθήσαμε να βγάλουμε συμπεράσματα για το κατά πόσο η δομή των καρβοξυλικών οξέων που χρησιμοποιήθηκαν ως Ligands επηρεάζει τόσο τον τρόπο συναρμογής της καρβοξυλικής ομάδας με το τριοργανοκασσιτερικό κατιόν, όσο και τη βιολογική δράση των υπό μελέτη τριοργανοκασσιτερικών εστέρων στις προαναφερόμενες μελέτες.

scholarly journals Synthesis, Characterization and Evaluation of Anti-inflammatory Activity of Novel Indoline Derivatives

2016 ◽  
Vol 12 (12) ◽  
pp. 4557-4563
Author(s):  
Dhinesh kumar Manoharan
Keyword(s):  
1H Nmr ◽  
13C Nmr ◽  
Protein Denaturation ◽  
Inflammatory Activity ◽  
Potent Inhibition ◽  
Ft Ir ◽  
Anti Inflammatory

Series of indoline derivatives were synthesized using N-(4-aminophenyl) indoline-1-carbothiamide as a precursor. The structures of synthesized compounds were confirmed by   FT-IR, 1H-NMR, 13C-NMR and LC-MS. The in vitro anti-inflammatory activity of synthesized indoline derivatives were examined by standard anti-denaturation assay. The compounds 4a (IC50 = 62.2 µg/ml) and 4b (IC50 = 60.7 µg/ml) showed potent inhibition on protein denaturation. The compounds 5a (IC50 = 97.8 µg/ml) exhibits moderate inhibition on protein denaturation

scholarly journals Secondary metabolites of three endemic Centaurea L. species

2014 ◽  
Vol 79 (11) ◽  
pp. 1355-1362 ◽  
Author(s):  
Vele Tesevic ◽  
Ivana Aljancic ◽  
Slobodan Milosavljevic ◽  
Vlatka Vajs ◽  
Iris Djordjevic ◽  
...  
Keyword(s):  
Quantitative Analysis ◽  
Nmr Spectroscopy ◽  
Secondary Metabolites ◽  
Sesquiterpene Lactone ◽  
1H Nmr ◽  
13C Nmr ◽  
1H Nmr Spectroscopy ◽  
13C Nmr Spectroscopy ◽  
Esi Ms ◽  
Aerial Parts

The aerial parts of three endemic Centaurea L. species, namely C. tomorosii Micevski, C. soskae Hayek and C. galicicae Micevski, afforded sesquiterpene lactone cnicin (1) and seven flavonoids: apigenin (2), isokaempferide (3), hispidulin (4), eupatorin (5), cirsimaritin (6), santaflavone (7) and salvigenin (8). The structures of the isolated compounds were determined by UV, 1H NMR and 13C NMR spectroscopy and HR-ESI-MS spectrometry. 1H NMR spectroscopy was used as a method for quantitative analysis of sesquiterpene lactone cnicin.

Synthesis and insecticidal activity of 6,8-dichloro-quinazoline derivatives containing a sulfide substructure

2014 ◽  
Vol 68 (7) ◽  
Author(s):  
Jian Wu ◽  
Song Bai ◽  
Min Yue ◽  
Li-Jun Luo ◽  
Qin-Cai Shi ◽  
...  
Keyword(s):  
1H Nmr ◽  
13C Nmr ◽  
Insecticidal Activity ◽  
Plutella Xylostella ◽  
Elemental Analyses ◽  
Quinazoline Derivatives ◽  
Sulfide Group

AbstractA series of 6,8-dichloro-quinazoline derivatives bearing a sulfide group was synthesized and characterized via 1H NMR, 13C NMR, IR and elemental analyses. All the compounds were tested for their insecticidal activity against Plutella xylostella in vitro. The results indicate that the synthesized compounds possess good insecticidal activity. Among these compounds, Vc, Vi, Vj, Vk and Vm displayed 75 %, 85 %, 80 %, 70 % and 63 % activities, respectively. These may prove useful as insecticidal agents.

scholarly journals Synthesis of new 3-(substituted-phenyl)-N-(2-hydroxy-2-(substituted-phenyl)ethyl)-N-methylthiophene-2-sulfonamide derivatives as antiproliferative agents

2018 ◽  
Vol 9 (1) ◽  
pp. 13-21 ◽  
Author(s):  
Chandrakant Pawar ◽  
Dattatraya Pansare ◽  
Devanand Shinde
Keyword(s):  
Cell Lines ◽  
Cancer Cell ◽  
1H Nmr ◽  
13C Nmr ◽  
Antiproliferative Activity ◽  
Positive Control ◽  
Antiproliferative Agents ◽  
Ic50 Values ◽  
Mcf 7

In the present work, we report the synthesis of a series of 3-(substituted phenyl)-N-(2-hydroxy-2-(substituted-phenyl)ethyl)-N-methylthiophene-2-sulfonamide derivatives through Suzuki and Buchwald reaction. We have optimized methodology for targets from milligram to multi-gram scale. The newly synthesized compounds were characterized by 1H NMR, 19F NMR, 13C NMR, LC-MS techniques and purity was further checked by HPLC. The compounds were evaluated for their in-vitro antiproliferative activity against MCF-7, HeLa, A-549 and Du-145 cancer cell lines by CCK-8 assay. The preliminary bioassay suggests that most of the compounds show antiproliferation with different degrees and 5-fluorouracil was used as positive control. Among these compounds 2d, 2g, 2i, 4e, 4h and 4k are most active compared to the standard. All the synthesized compounds show IC50 values from 1.82-9.52 µM in different cell lines. Amongst these, compounds 2d, 2g, 2i, 4e, 4h and 4k were most potent, with IC50 values ranging from 1.82-4.28 µM in different cell lines.

Synthesis, Characterization and Antimicrobial Evaluation of Novel Dimethyl Triazene Incorporated Phenylamino Pyrimidine Derivatives

2021 ◽  
Vol 6 (3) ◽  
pp. 211-216
Author(s):  
Vidhya V. Jadvani ◽  
Yogesh T. Naliapara
Keyword(s):  
Antimicrobial Activity ◽  
1H Nmr ◽  
13C Nmr ◽  
Pyrimidine Derivatives ◽  
In Vitro Antimicrobial Activity ◽  
Fungal Strains ◽  
Elemental Analyses ◽  
Antimicrobial Evaluation ◽  
Hydro Chloride

A series of novel (E)-4-(4-(3,3-dimethyltriaz-1-en-1-yl)phenyl)-N-phenylpyrimidin-2-amine derivatives have been synthesized from the condensation of (E)-3-(dimethylamino)-1-(4-(E)-3,3-dimethyltriaz- 1-en-1-yl)phenyl)prop-2-en-1-one with several guanidinium hydro-chloride. The newly synthesized compounds were examined for in vitro antimicrobial activity against some antibacterial and fungal strains. The synthesized compounds were characterized by 1H NMR, 13C NMR, IR, mass and elemental analyses.

scholarly journals Synthesis, Characterization and In Vitro Antibacterial Derivatives of Doxycycline

2020 ◽  
Vol 7 (4) ◽  
pp. 215-226
Author(s):  
Muhammad Rizwan Khan ◽  
Mohsin Abbas Khan ◽  
Khalil Ahmad ◽  
Asad Hamad ◽  
Muhammad Sajid-ur-Rehman ◽  
...  
Keyword(s):  
Schiff Bases ◽  
1H Nmr ◽  
13C Nmr ◽  
Broad Spectrum ◽  
Micrococcus Luteus ◽  
Condensation Reaction ◽  
Bacterial Strains ◽  
Zone Of Inhibition ◽  
Gram Negative

Objective: Nowadays antibacterial drugs resistance is major problem in the world. To overcome this problem, some novel derivates of doxycycline were synthesized by single step condensation reaction with ten different types of aromatic and aliphatic aldehydes and ketones in ethanol as solvent and acetic acid as catalyst. In these reactions, deprotonation of primary amine occurs that results in formation of imine.  Methods: All the derivatives physically characterized and confirmed by analytical techniques i.e. FTIR and 1H NMR and 13C NMR. The derived compounds have exhibited significantly more active against both gram positive as well as gram negative bacterial strains as compared to parent drug. Results: Derived Schiff bases RDC2, RDC4 and RDC10 showed zone of inhibition against Bacillus subtilis as compared to doxycycline and derived Schiff bases RDC1, RDC2, RDC5, RDC6, RDC7 and RDC8 showed more zone of inhibition against Micrococcus luteus as compared to doxycycline. Yield (75%), m.p. 180-185°C, Mol. Wt. 1063, Elemental Analysis: (Calculated) for C58H54N4O16: iC, 65.53; H, 5.12; N, 5.27; (Found): C, 65.49; H, 5.18; N, 5.37; FTIR (ν, cm‐1): 3066 (=C-H), 1665(C=N), 1585, 1490(C=C, phenyl), 3650(OH), 1692 (C=O); 1H NMR (DMSO−d6, δ, ppm), 6.02-6.03 d, 6.91-6.92 d, (=CH-); 6.88-6.89 t (=CH), 2.89-2.90 d, (-CH); 1.07-1.08 q, (-CH3), 3.38-3.39 d; 3.17-3.18 d, (CH), 1.47-1.48 t (CH), 1.48 s, (CH3), 6.96-6.97d, 7.577-7.588 d, (-CH=) 15.21 s (OH); 4.62 s (OH); 1.46-1.47 s (OH); 13C NMR (DMSO−d6, δ, ppm). Conclusion: Doxycycline is among broad-spectrum tetracycline. The Schiff bases derived from doxycycline show significantly highly active against gram negative bacteria as compared to doxycycline. In future further study on these derived compounds will help in market new derivative of doxycycline, which will have more broad-spectrum activity than doxycycline.

scholarly journals Synthesis, characterization and anthelmintic activity evaluation of pyrimidine derivatives bearing carboxamide and sulphonamide moieties

2018 ◽  
Vol 83 (4) ◽  
pp. 401-409 ◽  
Author(s):  
David Ugwu ◽  
Uchechukwu Okoro ◽  
Narendra Mishra
Keyword(s):  
Amino Acids ◽  
Boric Acid ◽  
1H Nmr ◽  
13C Nmr ◽  
Benzoyl Chloride ◽  
Anthelmintic Activity ◽  
Pharmacological Properties ◽  
Pyrimidine Derivatives ◽  
Different Types

Pyrimidines, sulphonamides and carboxamides have shown a large number of pharmacological properties against different types of diseases including helminthiasis. Seventeen new pyrimidine derivatives bearing sulphonamide and carboxamide were synthesized and investigated for their in vitro anthelmintic properties. Substituted benzenesulphonyl chlorides 15a?c were treated with various amino acids (16a?h) to obtain benzenesulphonamide derivatives 17a?l. Compounds 17a?f were subsequently treated with benzoyl chloride to obtain the N-benzoylated derivatives 19a?f. Further reactions of compounds 19a?f and 17g?l with 4- or 2-aminopyrimidine (20) using boric acid as a catalyst gave the required sulphonamide carboxamide derivatives 21a?q in excellent yields. The compounds were isolated in their analytical grade and characterized using FTIR, 1H-NMR, 13C-NMR and HRMS. The in vitro anthelmintic studies showed that all the synthesized compounds possessed anthelmintic property. Compounds 21a?c, e, g, m and p showed mean paralyzing times of 15, 19, 14, 18, 19, 19 and 18 min, respectively, at 100 mg mL-1 compared to 10 min for albendazole. Compounds 21a?c, g and m had mean death times of 18, 24, 16, 20 and 25 min, respectively, at 100 mg mL-1 compared to 13 min for albendazole.

scholarly journals GLYCOSIDES ISOLATED FROM THE AERIAL PARTS OF Premna integrifolia L. GROWING IN THAI BINH

2019 ◽  
Vol 57 (4) ◽  
pp. 420 ◽  
Author(s):  
Truong Thi Thu Hien ◽  
Ngo Thi Tuyet Mai ◽  
Bach Thi Tam ◽  
Nguyen Thi Thu Hien ◽  
Le Canh Viet Cuong ◽  
...  
Keyword(s):  
1H Nmr ◽  
13C Nmr ◽  
Previous Literature ◽  
First Report ◽  
Esi Ms ◽  
Chemical Structures ◽  
Aerial Parts

From the aerial parts of Premna integrifolia L., three glycosides acteoside (1), premnaodoroside A (2), and premnaodoroside B (3) were isolated. Their chemical structures were elucidated by means of ESI-MS, 1H-NMR, 13C-NMR, HSQC, HMBC spectra and in comparison with the previous literature. To our best knowledge, this is the first report of 1 and 3 from P. integrifolia.

Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document