scholarly journals mazF, a novel counter-selectable marker for unmarked chromosomal manipulation in Bacillus subtilis

2006 ◽  
Vol 34 (9) ◽  
pp. e71-e71 ◽  
Author(s):  
X.-Z. Zhang ◽  
X. Yan ◽  
Z.-L. Cui ◽  
Q. Hong ◽  
S.-P. Li
1998 ◽  
Vol 180 (13) ◽  
pp. 3405-3409 ◽  
Author(s):  
Silvia Fernández ◽  
Alexei Sorokin ◽  
Juan C. Alonso

ABSTRACT Bacillus subtilis recombination-deficient mutants were constructed by inserting a selectable marker (cat gene) into the yppB and ypbC coding regions. TheyppB:cat and ypbC:catnull alleles rendered cells sensitive to DNA-damaging agents, impaired plasmid transformation (25- and 100-fold), and moderately affected chromosomal transformation when present in an otherwise Rec+ B. subtilis strain. The yppBgene complemented the defect of the recG40 strain.yppB and ypbC and their respective null alleles were termed “recU” and “recU1” (recU:cat) and “recS” and “recS1” (recS:cat), respectively. The recU and recS mutations were introduced into rec-deficient strains representative of the α (recF), β (addA5 addB72), γ (recH342), and ɛ (recG40) epistatic groups. The recU mutation did not modify the sensitivity ofrecH cells to DNA-damaging agents, but it did affect inter- and intramolecular recombination in recH cells. TherecS mutation did not modify the sensitivity ofaddAB cells to DNA-damaging agents, and it marginally affected recF, recH, and recUcells. The recS mutation markedly reduced (about 250-fold) intermolecular recombination in recH cells, and there were reductions of 10- to 20-fold in recF, addAB, and recU cells. Intramolecular recombination was blocked inrecS recF, recS addAB, and recS recU cells. RecU and RecS have no functional counterparts inEscherichia coli. Altogether, these data indicate that therecU and recS proteins are required for DNA repair and intramolecular recombination and that the recF(α epistatic group), addAB (β), recH (γ),recU (ɛ), and recS genes provide overlapping activities that compensate for the effects of single mutation. We tentatively placed recS within a new group, termed “ζ.”


2015 ◽  
Vol 171 ◽  
pp. 90-96 ◽  
Author(s):  
Natalia V. Geraskina ◽  
Ivan A. Butov ◽  
Yurgis A.V. Yomantas ◽  
Nataliya V. Stoynova

Author(s):  
Dwight Anderson ◽  
Charlene Peterson ◽  
Gursaran Notani ◽  
Bernard Reilly

The protein product of cistron 3 of Bacillus subtilis bacteriophage Ø29 is essential for viral DNA synthesis and is covalently bound to the 5’-termini of the Ø29 DNA. When the DNA-protein complex is cleaved with a restriction endonuclease, the protein is bound to the two terminal fragments. The 28,000 dalton protein can be visualized by electron microscopy as a small dot and often is seen only when two ends are in apposition as in multimers or in glutaraldehyde-fixed aggregates. We sought to improve the visibility of these small proteins by use of antibody labeling.


Planta Medica ◽  
2008 ◽  
Vol 74 (09) ◽  
Author(s):  
N Padilla-Montaño ◽  
IL Bazzocchi ◽  
L Moujir

2018 ◽  
Vol 22 (02) ◽  
pp. 82-89
Author(s):  
Friedrich von Rheinbaben ◽  
Oliver Riebe ◽  
Johanna Köhnlein ◽  
Sebastian Werner

ZusammenfassungZentrales Bauteil des Genius® 90 Therapie Systems ist der sogenannte Genius-Tank, dem die frische Dialyseflüssigkeit entnommen und in den die verbrauchte Lösung nach der Dialyse zurückgeführt wird. Daher kommt der sicheren Aufbereitung des Systems eine besondere Bedeutung zu. Hierfür wird ein Aufbereitungsverfahren unter Verwendung von UV-Licht in Kombination mit einem chemischen Desinfektionsmittel angewendet. Ziel der hier beschriebenen Untersuchung war es, die Wirkungsbreite und Wirkungstiefe dieses Aufbereitungsverfahrens unter praxisnahen Phase-3-Bedingungen zu ermitteln. Dazu wurde das Gerät mit Mikroorganismen und Viren künstlich kontaminiert und die Wirkung der einzelnen Verfahrensschritte ermittelt. Im Gegensatz zu der üblichen Vorgehensweise praxisnaher Untersuchungen machen Aufbereitungsverfahren medizinischer Geräte unter Phase-3-Kriterien meist eine neuartige Arbeitsweise erforderlich – im Falle der hier vorgestellten Untersuchung sogar die Konstruktion eines speziellen Geräts zur Platzierung von Keimträgen im Genius-Tank. Im Ergebnis konnte gezeigt werden, dass bereits UV-Licht allein sowie in Kombination mit einem chemischen Desinfektionsmittel unter praxisnahen Bedingungen eine sichere Wirksamkeit gegen Bakterien (Pseudomonas aeruginosa) und bakterielle Sporen (Bacillus subtilis), Schimmelpilze (Aspergillus brasiliensis) und Viren (Murines Parvovirus) besitzt.


Planta Medica ◽  
2007 ◽  
Vol 73 (09) ◽  
Author(s):  
L Moujir ◽  
L de León ◽  
IL Bazzocchi

2020 ◽  
Vol 21 (1) ◽  
pp. 14-19
Author(s):  
Praptiningsih Gamawati Adinurani ◽  
Sri Rahayu ◽  
Nurul Fima Zahroh

Mikroba Bacillus subtilis merupakan agen pengendali hayati mempunyai kelebihan sebagai Plant Growth Promoting Rhizobacteria (PGPR) yaitu dapat berfungsi sebagai biofertilizer, biostimulan, biodekomposer dan bioprotektan. Tujuan penelitian mengetahui potensi B. subtilis dalam merombak bahan organik sebagai usaha meningkatkan ketersediaan bahan organik tanah yang semakin menurun. Penelitian menggunakan Rancangan Petak Terbagi dengan berbagai  bahan organik sebagai petak utama (B0 = tanpa bahan organik, B1 = kotoran ayam,  B2 = kotoran kambing, B3 = kotoran sapi) dan aplikasi B.subtilis sebagai anak petak (A0 = 0 cc/L, A1 = 5cc/L, A2 = 10 cc/L, Pengamatan meliputi variabel tinggi tanaman, indeks luas daun, jumlah buah per tanaman, berat buah per tanaman, dan bahan organik tanah. Data pengamatan  dianalisis ragam  menggunakan  Statistical Product and Service Solutions (SPSS) versi 25 dan dilanjutkan dengan uji Duncan untuk mengetahui signifikansi perbedaan antar perlakuan. Hasil penelitian menunjukkan tidak terdapat interaksi antara bahan organik kotoran ternak dan konsentrasi B. subtilis terhadap semua variabel pengamatan. Potensi B. subtilis sangat baik dalam mendekomposisi bahan organik yang ditunjukkan dengan peningkatan bahan organik, dan hasil terbaik pada kotoran  sapi (B3) dan konsentrasi B. subtilis 15 mL/L masing-masing sebesar 46.47 % dan 34.76 %. Variabel pertumbuhan tidak berbeda nyata kecuali tinggi tanaman dengan pertambahan tinggi paling banyak pada pemberian kotoran kambing sebesar 170.69 %.


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