scholarly journals Accurately extracting the signature of intermolecular interactions present in the NCI plot of the reduced density gradient versus electron density

2017 ◽  
Vol 19 (27) ◽  
pp. 17928-17936 ◽  
Author(s):  
Corentin Lefebvre ◽  
Gaëtan Rubez ◽  
Hassan Khartabil ◽  
Jean-Charles Boisson ◽  
Julia Contreras-García ◽  
...  
Keyword(s):  
Density Gradient ◽  
Electron Density ◽  
Intermolecular Interactions ◽  
Electron Densities ◽  
New Model ◽  
Reduced Density Gradient ◽  
Reduced Density

A new model for reference electron densities, really getting rid of interactions.

scholarly journals Μελέτη της επίδρασης των ligands στη σταθερότητα, διαμόρφωση και διατροπική ανταπόκριση μεταλλικών clusters των μετάλλων νομισμάτων (Cu, Ag, Au) με υπολογιστικές κβαντοχημικές μεθόδους

2013 ◽  
Author(s):  
Ιωάννης Δεπάστας
Keyword(s):  
Density Gradient ◽  
Reduced Density Gradient ◽  
Reduced Density

Σκοπός της διατριβής ήταν η μελέτη των ουδέτερων από άποψη φορτίου ετεροπυρηνικών clusters των μετάλλων των νομισμάτων, με γενικό τύπο Α3Β3 (όπου Α, Β = Cu, Ag ή Αu), καθώς και των επίπεδων και τρισδιάστατων clusters αυτών, που σταθεροποιούνται με την προσθήκη διάφορων ligands. Προσδιορίζονται όλες οι πιθανές δομές αυτών των clusters και μελετάται εκτενώς η σταθερότητα, η διαμόρφωση, η δεσμικότητα, καθώς και τα φάσματα απορρόφησής τους. Αρχικά, στο θεωρητικό μέρος δίνονται οι βασικές αρχές της κβαντικής θεωρίας μαζί με όλες τις απαραίτητες πληροφορίες, καθώς και το απαιτούμενο υπόβαθρο για την κατανόηση των αποτελεσμάτων που παρουσιάζονται στο πειραματικό μέρος της εργασίας. Στη συνέχεια, στο πειραματικό μέρος, γίνεται η επεξεργασία των αποτελεσμάτων, δηλαδή μία μελέτη όλων των γεωμετρικών δομών, όπως αυτές υπολογίστηκαν στο επίπεδο της DFT και συγκρίνεται η σταθερότητα των clusters με βάση την ενέργεια σύνδεσης και την ενέργεια μίξης που παρουσιάζουν. Όλα τα clusters των μετάλλων των νομισμάτων που μελετήθηκαν, αποτελούν ενεργειακά σταθερά μόρια με θετικές ενέργειες μίξης και σύνδεσης και ευνοούνται θερμοδυναμικά απέναντι στα ελεύθερα άτομα Au, Ag και Cu. Υπάρχει επίσης μία σαφής μεταφορά φορτίου, κυρίως στα clusters χρυσού-χαλκού και χρυσού-αργύρου, που ενισχύει την ύπαρξη ηλεκτροστατικού χαρακτήρα στο δεσμό μεταξύ των μετάλλων. Εξετάστηκαν επίσης, τα πιθανά μονοπάτια ανάπτυξης (Growth Format) για όλα τα ουδέτερα clusters που μελετήθηκαν και εξήχθησαν χρήσιμα συμπεράσματα για τους πιθανούς τρόπους παρασκευής τους. Ο αρωματικός χαρακτήρας των εσωτερικών τριμελών δακτυλίων, όλων των υπό μελέτη ενώσεων, διαπιστώθηκε με τη χρήση αρκετών καθιερωμένων δομικών, ενεργειακών και μαγνητικών (NICS-scan-profiles) κριτηρίων. H μελέτη των δισδιάστατων απεικονίσεων της ELF, αποδεικνύει την ύπαρξη ισχυρού απεντοπισμού ηλεκτρονιακής πυκνότητας που με τη σειρά του καταδεικνύει την ύπαρξη αρωματικότητας. Επίσης με την τρισδιάστατη απεικόνιση της ισοεπιφάνειας (isosurface) της RDG (Reduced Density Gradient), υποδεικνύεται η ύπαρξη μη δεσμικής αλληλεπικάλυψης στο εσωτερικό των τριμελών δακτυλίων, η οποία οφείλεται κυρίως στις στερεοχημικές απωθήσεις (steric repulsions). Οι δίσκοι που σχηματίζονται στην απεικόνιση της RDG, στη περιοχή ανάμεσα κυρίως στα περιφερειακά άτομα των μετάλλων των νομισμάτων, καταδεικνύουν τις ασθενείς αλληλεπιδράσεις (metallophilicity) μεταξύ των ατόμων. Τέλος από την φασματοσκοπική μελέτη IR και UV-Vis εξάγονται χρήσιμα στοιχεία για την οιαδήποτε προσπάθεια ταυτοποίησης των εν λόγω ενώσεων.

Interaction and Electron Density Properties of MKr42+ (M=Cu, Ag and Au): ab initio Calculation

2011 ◽  
Vol 64 (3) ◽  
pp. 339 ◽  
Author(s):  
Li Xinying ◽  
Cao Xue
Keyword(s):  
Electron Density ◽  
Quantum Chemical ◽  
Ab Initio Calculation ◽  
Gradient Analysis ◽  
Natural Bond Orbital ◽  
Theoretical Level ◽  
Covalent Contribution ◽  
Reduced Density Gradient ◽  
Reduced Density

Quantum chemical calculations of the structures and stabilities of the MKr42+ series at the CCSD(T) theoretical level have been performed. The role of the interaction was investigated using the natural bond orbital (NBO), Laplacian, electron density deformation, electron localization function and reduced density gradient analysis. The results show that a covalent contribution occurs in the Kr-M2+ bonding.

Characterizing local metallic bonding variation induced by external perturbation

2020 ◽  
Vol 22 (4) ◽  
pp. 2372-2378 ◽  
Author(s):  
Hongwei Wang ◽  
Jon Fuller ◽  
Peng Chen ◽  
Sergey I. Morozov ◽  
Qi An
Keyword(s):  
Density Gradient ◽  
External Perturbation ◽  
Hole Injection ◽  
Electron Hole ◽  
Fcc Metals ◽  
Reduced Density Gradient ◽  
Metallic Bonding ◽  
Reduced Density

The reduced density gradient analyses on metallic bonding indicate that FCC metals can become more flexible/stronger with the electron/hole injection.

scholarly journals Halogen Interactions in Halogenated Oxindoles: Crystallographic and Computational Investigations of Intermolecular Interactions

Molecules ◽  
2021 ◽  
Vol 26 (18) ◽  
pp. 5487
Author(s):  
Rodrigo A. Lemos Silva ◽  
Demetrio A. da Silva Filho ◽  
Megan E. Moberg ◽  
Ted M. Pappenfus ◽  
Daron E. Janzen
Keyword(s):  
Interaction Energy ◽  
Intermolecular Interactions ◽  
Density Functional ◽  
Basis Set ◽  
Interaction Energies ◽  
Functional Theory ◽  
Basis Set Superposition Error ◽  
Reduced Density Gradient ◽  
Moller Plesset ◽  
Reduced Density

X-ray structural determinations and computational studies were used to investigate halogen interactions in two halogenated oxindoles. Comparative analyses of the interaction energy and the interaction properties were carried out for Br···Br, C-H···Br, C-H···O and N-H···O interactions. Employing Møller–Plesset second-order perturbation theory (MP2) and density functional theory (DFT), the basis set superposition error (BSSE) corrected interaction energy (Eint(BSSE)) was determined using a supramolecular approach. The Eint(BSSE) results were compared with interaction energies obtained by Quantum Theory of Atoms in Molecules (QTAIM)-based methods. Reduced Density Gradient (RDG), QTAIM and Natural bond orbital (NBO) calculations provided insight into possible pathways for the intermolecular interactions examined. Comparative analysis employing the electron density at the bond critical points (BCP) and molecular electrostatic potential (MEP) showed that the interaction energies and the relative orientations of the monomers in the dimers may in part be understood in light of charge redistribution in these two compounds.

The reduced density gradient in atoms

2012 ◽  
Vol 112 (22) ◽  
pp. 3594-3598 ◽  
Author(s):  
Jorge M. del Campo ◽  
José L. Gázquez ◽  
Rodrigo J. Alvarez-Mendez ◽  
Alberto Vela
Keyword(s):  
Density Gradient ◽  
Reduced Density Gradient ◽  
Reduced Density
Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document