A Single Nucleotide Polymorphism (SNP839) in theadh1Reference Gene Affects the Quantitation of Genetically Modified Maize (Zea mays L.)

2008 ◽  
Vol 56 (19) ◽  
pp. 8825-8831 ◽  
Author(s):  
Wim Broothaerts ◽  
Philippe Corbisier ◽  
Heinz Schimmel ◽  
Stefanie Trapmann ◽  
Sandra Vincent ◽  
...  
2009 ◽  
Vol 24 (2) ◽  
pp. 165-176 ◽  
Author(s):  
Elizabeth Jones ◽  
Wen-Chy Chu ◽  
Mulu Ayele ◽  
Julie Ho ◽  
Ed Bruggeman ◽  
...  

2021 ◽  
Vol 7 (2) ◽  
pp. 218-235
Author(s):  
David O. González-Diéguez ◽  
Carlos Orozco

El complejo mancha de asfalto (CMA) en maíz (Zea mays L.), causado por los hongos Phyllachora maydis Maubl. y Monographella maydis Müller & Samuels, es una enfermedad de importancia económica en Guatemala, causando pérdida en el rendimiento entre 30 a 50%, inclusive del 100% si las condiciones son favorables. El objetivo de esta investigación fue identificar marcadores de un solo nucleótido o SNP (Single Nucleotide Polymorphism, por sus siglas en inglés) y genes candidatos asociados a la tolerancia genética al CMA. Para ello se analizaron 463 poblaciones nativas y 329,692 SNP, y se compararon dos modelos genómicos, single marker y BayesB, para la identificación de regiones asociadas a la tolerancia genética al CMA. Se identificaron 40 marcadores SNP asociados significativamente a la tolerancia genética al CMA con ambos modelos. La proporción de variación fenotípica total explicada (PVE) por los 40 SNPs fue de 56%, atribuida a efectos genéticos aditivos. Múltiples genes de resistencia fueron identificados en las regiones señaladas por los marcadores SNP, siendo sus principales funciones receptores y transductores de señal, factores de transcripción que regulan positivamente la expresión de genes de resistencia y genes de la familia kinasa, por lo que potencialmente están involucrados en el mecanismo de defensa al CMA.


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