Detection of Allergenic Ingredients Using Real-Time PCR: A Case Study on Hazelnut (Corylus avellena) and Soy (Glycine max)

2011 ◽  
Vol 59 (20) ◽  
pp. 10803-10814 ◽  
Author(s):  
Céline Platteau ◽  
Marc De Loose ◽  
Bruno De Meulenaer ◽  
Isabel Taverniers
Keyword(s):  
Glycine Max ◽  
Real Time ◽  
Real Time Pcr

Development of a multiplex real-time PCR method for early diagnosis of three bacterial diseases in fish: A real-case study in trout aquaculture

Aquaculture ◽  
2018 ◽  
Vol 496 ◽  
pp. 255-261 ◽  
Author(s):  
María-José Chapela ◽  
Martiña Ferreira ◽  
Celia Varela ◽  
Luz Arregui ◽  
Alejandro Garrido-Maestu
Keyword(s):  
Early Diagnosis ◽  
Real Time ◽  
Real Time Pcr ◽  
Real Case ◽  
Bacterial Diseases ◽  
Pcr Method

scholarly journals Detection of soybean by real-time PCR in the samples subjected to deep technological processing

2019 ◽  
Vol 4 (4) ◽  
pp. 23-27
Author(s):  
K. A. Kurbakov ◽  
E. A. Konorov ◽  
V. N. Zhulinkova ◽  
M. Yu. Minaev
Keyword(s):  
Glycine Max ◽  
Real Time ◽  
Real Time Pcr ◽  
High Sensitivity ◽  
Food Product ◽  
Single Copy ◽  
Probe System ◽  
Canned Foods ◽  
Technological Processing ◽  
The Difference

During deep technological processing, DNA of food product components (specifically, in canned foods) is subjected to strong degradation, which makes the PCR-based food components identification more difficult. In this work, a primer-probe system is proposed, which was selected for the multi-copy region of long terminal repeat (LTR) of soybean (Glycine max). We confirmed its high sensitivity and specificity for soybean detection by real-time PCR. Using the selected system, we successfully analyzed the samples of meat-and-plant canned foods and other food products subjected to deep technological processing — tofu, preserved tofu, soy sauces, confectionary products containing soy lecithin. To compare with these samples, real-time PCR was carried out using the primer-probe system selected for the single-copy le1 gene. In terms of sensitivity, the use of the primer-probe system specific to the single-copy region was significantly inferior to the primer-probe system specific to the LTR region. The difference in the rate of degradation of these genomic DNA regions of Glycine max was found.

scholarly journals АНАЛИЗ ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНОЙ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ СОИ КАК ОСНОВА ДЛЯ РАЗРАБОТКИ ГЕНЕТИЧЕСКИХ МАРКЕРОВ СКОРОСПЕЛОСТИ

2021 ◽  
Vol 13 (1) ◽  
pp. 35-57
Author(s):  
Alexander I. Katyshev ◽  
Natalia B. Katysheva ◽  
Irina V. Fedoseeva ◽  
Anatoly V. Pomortsev ◽  
Nikolay V. Dorofeev
Keyword(s):  
Glycine Max ◽  
Real Time ◽  
Real Time Pcr ◽  
Detection System ◽  
Pcr Detection ◽  
Mads Box ◽  
Rna Purification ◽  
Glycine Max L

Обоснование. Одной из наиболее ценных в хозяйственном отношении сельскохозяйственных культур является соя (Glycine max (L.) Merr.). Интерес к этой культуре у аграриев связан с тем, что соя широко используется как продовольственная, кормовая и техническая культура. Соя является короткодневным растением, чувствительным к интенсивности освещения и продолжительности дня. В связи с этим сорта сои занимают ограниченный ареал возделывания и имеют высокую продуктивность в узком диапазоне агроклиматических условий. Поскольку для условий Иркутской области на сегодняшний день нет рекомендованных сортов сои к возделыванию, представляется важным разработать маркеры скороспелых сортов и сортообразцов сои, способных давать стабильный урожай в условиях длинного светового режима и сниженной суммы активных температур. Цель. Целью данной работы был сравнительный анализ уровней экспрессии генов – потенциальных молекулярных маркеров скороспелости сои в различающихся по скороспелости сортах и сортообразцах сои. В исследование были взяты представляющие на наш взгляд наиболее перспективные с этой точки зрения гены на основе полученных нами ранее данных, а также на основе литературных данных. Материалы и методы. Растения сои сортообразцов №15, 3169/14 и сортов Алтом и Вилана для экспериментов выращивались в контролируемых условиях станции искусственного климата «Фитотрон» на базе СИФИБР СО РАН. Растения выращивались индивидуально в вегетационных сосудах при температурном режиме: день/ночь – 22/16°С; фотопериод – день/ночь - 16,5/7,5 часов; освещенность – 500 µmol*m-2*s-1; влажность – 60%. Для выделения РНК отбирали не развитые до конца вторые тройчатые листья  растений сои. РНК с помощью реактивов из набора GeneJET Plant RNA Purification Mini Kit (ThermoScientific, Литва), согласно инструкции производителя. Синтез первой цепи кДНК осуществляли с использованием набора реак-тивов ThermoScientific (Литва), согласно рекомендациям фирмы производителя. ПЦР-РВ проводили на приборе CFX96™ Real-Time PCR Detection System (Bio-Rad, США), используя набор реактивов qPCR mix-HS SYBR (Евроген, Россия), согласно инструкции производителя. Анализ данных ПЦР-РВ проводили с помощью программного обеспечения SFX Manager (Bio-Rad, Германия). Все эксперименты проводились  в двух аналитических и трех биологических повторностях. В качестве референсного гена использовали ген, кодирующий актин – Act11. Результаты. С помощью метода ПЦР в реальном времени показано, что из числа исследованных нами генов повышенные уровни экспрессии в скороспелых сортообразцах сои по сравнению с таковыми на стадии V2 – начала развития второго тройчатого листа  сои – в позднеспелых сортах наблюдаются преимущественно для генов, кодирующих транскрипционные факторы, преимущественно, содержащие MADS-box. Из этой группы генов в качестве потенциальных маркеров скороспелости сои  наиболее перспективными представляются  гены, кодирующие ортологи SEP3 арабидопсиса. Отдельно стоит отметить наблюдаемую в нашей работе повышенную в тысячи раз экспрессию гена с неизвестной функцией – ортолога MEE18 арабидопсиса в более скороспелых генотипах сои. Такая гиперэкспрессия этого гена должна определять фенотипические различия между сортами и сортообразцами сои, возможно, и скороспелость растений. Помимо показанной более высокой экспрессии в скороспелых сортообразцах сои хорошо известных регуляторных генов, вовлеченных в реализацию перехода растений от вегетативной к генеративной фазе развития, отдельный интерес представляет выявленная нами повышенное содержание транскрипта гена, возможное участие которого в созревании растений сои пока не показано – гена секойсоларицирезинол дегидрогеназы. Все вышеперечисленные гены являются потенциальными кандидатами в молекулярные маркеры селекции скороспелых сортов и сортообразцов сои, выращиваемых в условиях длинного светового дня Иркутской области. Заключение. Таким образом, в результате проведенных исследований выявлены гены сои, экспрессия которых достоверно повышена в более скороспелых сортах и сортообразцах сои на стадии V2 развития растений, предшествующей стадии бутонизации, Очевидно, что те гены, функция которых по литературным данным связана с регуляцией процессов цветения, являются перспективными молекулярными маркерами скороспелости растений сои.

Feldvalidierung einer real-time PCR zum Nachweis von Mycoplasma hyopneumoniae in Nasentupfermaterial von lebenden Schweinen

2005 ◽  
Vol 147 (9) ◽  
pp. 373-379 ◽  
Author(s):  
F. Zeeh ◽  
P. Kuhnert ◽  
R. Miserez ◽  
M. G. Doherr ◽  
W. Zimmermann
Keyword(s):  
Real Time ◽  
Real Time Pcr ◽  
Mycoplasma Hyopneumoniae
Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document