scholarly journals Analysis of genetic diversity in Portuguese Ceratonia siliqua L. cultivars using RAPD and AFLP markers

2008 ◽  
Vol 118 (3) ◽  
pp. 189-199 ◽  
Author(s):  
P. Barracosa ◽  
M.B. Lima ◽  
A. Cravador
Keyword(s):  
Genetic Diversity ◽  
Aflp Markers ◽  
Ceratonia Siliqua ◽  
Ceratonia Siliqua L

scholarly journals Diversity analysis of Moroccan carob (Ceratonia siliqua L.) accessions using phenotypic traits and RAPD markers

2007 ◽  
Vol 32 ◽  
pp. 79-90 ◽  
Author(s):  
Ibrahim Konaté ◽  
Abdelkarim Filali-Maltouf ◽  
El Bekkay Berraho
Keyword(s):  
Genetic Diversity ◽  
Rapd Markers ◽  
Phenotypic Traits ◽  
Diversity Analysis ◽  
Ceratonia Siliqua ◽  
Diversité Génétique ◽  
Arbitrary Primers ◽  
The North ◽  
The Mediterranean ◽  
Ceratonia Siliqua L

SUMMARY. Diversity analysis of moroccan carob (Ceratonia siliqua L.) accessions using phenotypic traits and RAPD markers. The carob (Ceratonia siliqua L.) is a perennial leguminous (Caesalpinioideae) that grows as an evergreen shrub or tree. It’s an important component of the Mediterranean vegetation and its adaptation in marginal soils of the Mediterranean regions is important environmentally and economically. Phenotypic and genetic diversity among 10 Ceratonia siliqua accessions coming from different areas of Morocco were studied with morphometric and RAPD approaches. The analysis of discriminative fruit characters showed highly significant differences among these accessions, the closely related ones have a similarity level less than 65%. No molecular studies have been carried out so far on Ceratonia siliqua. To provide markers useful for molecular diversity study of the carob tree, genomic DNA extraction and amplification conditions were finalized and 67 arbitrary primers were screened. 52 of them showed clearly reproducible banding patterns. The analysis of RAPD profiles revealed a high degree of genetic diversity within these carob accessions and enabled each of them to be uniquely fingerprinted. Overall, in our study we note that morphological relationship between carob accessions is deeply different to their molecular relationship. Concerning the distribution of the accessions according to their geographical origin, clustering based on RAPD data revealed a rough distribution of theses accessions. Indeed, Sidi Bou Ottman, Demnate and Essaouira accessions coming from the south of Morocco seem to be linked in the PCA plot. However, two geographically distant accessions, Aïn Sfa and Ouazzane coming from the north (about 700 Km) were clustered with Essaouira and Demanate - Sidi Bou Ottman, respectively.Key words. Carob, Ceratonia siliqua L., genetic variability, morphometry, RAPD.RÉSUMÉ. Analyse de la diversite des accessions du caroubier marocain (Ceratonia siliqua L.) utilisant des traits phenotypiques et des marqueurs RAPD. Le caroubier (Ceratonia siliqua L.) est une légumineuse pérenne (Caesalpinioideae), à feuillage persistant et pouvant croître entant qu’arbrisseau ou arbre. C’est un composant important de la végétation méditerranéenne et son adaptation aux sols marginaux des régions méditerranéennes est d’une grande importance écologique et économique. La diversité phénotypique et génétique au sein de 10 accessions de caroubier provenant de différentes régions du Maroc a été étudiée par des approches morphométriques et moléculaires (RAPD). L’analyse des caractères morphologiques discriminants du fruit a montré des différences hautement significatives au sein des accessions, puisque les apparentées d’entre elles n’ont approximativement que 65% de similarité. Jusqu’à nos jours, aucune étude moléculaire n’a été entreprise sur Ceratonia siliqua. Pour mettre à disposition des marqueurs utiles pour l’étude de la diversité moléculaire du caroubier, l’extraction de l’ADN génomique et les conditions de l’amplification ont été mises au point et 67 amorces arbitraires ont été criblées. 52 d’entre elles ont montré clairement des profils de bandes reproductibles. L’analyse des profils RAPD a révélé une diversité génétique de haut niveau entre les accessions de caroubier ce qui a permis à chacune d’elles d’être distinguée génétiquement de façon singulière. De manière générale, nous avons noté que la relation morphologique entre les accessions du caroubier est profondément différente de leur relation moléculaire. Concernant la distribution des accessions selon leur origine géographique, le regroupement basé sur les données de la RAPD a révélé une distribution grossière. En effet, les provenances de Sidi Bou Ottman, Demnate et Essaouira, originaires du sud de Maroc, semblent être liés par l’analyse des composantes principales (PCA). Cependant, deux accessions géographiquement distantes, Aïn Sfa et Ouazzane, originaires du Nord (approximativement 700 Kms) ont été liées avec Essaouira et Demanate - Sidi Bou Ottman, respectivement.Mots clés. Caroubier, Ceratonia siliqua L., diversité génétique, morphométrie, RAPD.

Genetic Diversity in Tunisian Ceratonia siliqua L. (Caesalpinioideae) Natural Populations

2006 ◽  
Vol 53 (7) ◽  
pp. 1501-1511 ◽  
Author(s):  
Afif Makrem ◽  
Ben Fadhel Najeh ◽  
Khoudja Mohamed Laarbi ◽  
Boussaïd Mohamed
Keyword(s):  
Genetic Diversity ◽  
Natural Populations ◽  
Ceratonia Siliqua ◽  
Ceratonia Siliqua L

Genetic diversity revealed by EST-SSR markers in carob tree (Ceratonia siliqua L.)

2014 ◽  
Vol 55 ◽  
pp. 205-211 ◽  
Author(s):  
Stefano La Malfa ◽  
Sergio Currò ◽  
Adrian Bugeja Douglas ◽  
Massimiliano Brugaletta ◽  
Marco Caruso ◽  
...  
Keyword(s):  
Genetic Diversity ◽  
Ssr Markers ◽  
Ceratonia Siliqua ◽  
Carob Tree ◽  
Ceratonia Siliqua L

Genetic Diversity of 118 Sugarcane Germplasm Using AFLP Markers

2014 ◽  
Vol 40 (10) ◽  
pp. 1877
Author(s):  
Feng-Gang ZAN ◽  
Cai-Wen WU ◽  
Xue-Kuan CHEN ◽  
Pei-Fang ZHAO ◽  
Jun ZHAO ◽  
...  
Keyword(s):  
Genetic Diversity ◽  
Aflp Markers ◽  
Sugarcane Germplasm

Responsiveness of Carob (Ceratonia siliqua L.) Plants to Arbuscular Mycorrhizal Symbiosis Under Different Phosphate Fertilization Levels

2019 ◽  
Vol 38 (4) ◽  
pp. 1243-1254 ◽  
Author(s):  
Abdellatif Essahibi ◽  
Laila Benhiba ◽  
Mohamed Oussouf Fouad ◽  
Mohamed Ait Babram ◽  
Cherki Ghoulam ◽  
...  
Keyword(s):  
Arbuscular Mycorrhizal ◽  
Arbuscular Mycorrhizal Symbiosis ◽  
Mycorrhizal Symbiosis ◽  
Ceratonia Siliqua ◽  
Phosphate Fertilization ◽  
Ceratonia Siliqua L
Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document