Pseudouridine residues in the 5′-terminus of uridine-rich nuclear RNA I (U1 RNA)

1981 ◽  
Vol 98 (4) ◽  
pp. 1076-1083 ◽  
Author(s):  
Ramachandra Reddy ◽  
Dale Henning ◽  
Harris Busch
Keyword(s):  
Nuclear Rna ◽  
Rna I

Translation Control by Adenovirus Virus-Associated RNA I

1993 ◽  
pp. 203-225 ◽  
Author(s):  
Bayar Thimmapaya ◽  
Ghanashyam D. Ghadge ◽  
Prithi Rajan ◽  
Sathyamangalam Swaminathan
Keyword(s):  
Translation Control ◽  
Rna I

scholarly journals UNCROSS: Filtering of high-frequency cross-talk in 16S amplicon reads

2016 ◽  
Author(s):  
Robert C. Edgar
Keyword(s):  
Ribosomal Rna ◽  
Cross Talk ◽  
High Frequency ◽  
Biological Diversity ◽  
Illumina Miseq ◽  
Amplicon Sequencing ◽  
Illumina Gaiix ◽  
Microbial Metagenomics ◽  
Tumor Sequencing ◽  
Rna I

AbstractNext-generation amplicon sequencing is widely used for surveying biological diversity in applications such as microbial metagenomics, immune system repertoire analysis and targeted tumor sequencing of cancer-associated genes. In such studies, assignment of reads to incorrect samples (cross-talk) is a well-documented problem that is rarely considered in practice. By considering unexpected OTUs in artificial (mock) samples, I estimate that cross-talk occurred for ~2% of the reads in one Illumina GAIIx run and eleven Illumina MiSeq runs targeting 16S ribosomal RNA. I also describe UNCROSS, an algorithm for detecting and filtering cross-talk in OTU tables.

DNA a pochodzenie życia. Informacja, specyfikacja i wyjaśnienie

2021 ◽  
pp. 133-215
Author(s):  
Stephen C. Meyer
Keyword(s):  
Rna I

Niniejszy esej jest oceną rywalizujących wyjaśnień pochodzenia informacji koniecznej do zbudowania pierwszej komórki żywej. Dokonanie tej oceny wymagało będzie określenia, co biologowie rozumieją przez termin informacja w zastosowaniu do makrocząsteczek biologicznych. Jak wielu badaczy zauważyło, „informacja” może oznaczać kilka teoretycznie odmiennych pojęć. W niniejszym eseju postaram się usunąć tę wieloznaczność i dokładnie określę, jakiego rodzaju informacji badacze pochodzenia życia muszą wyjaśnić „powstanie”. Najpierw należy scharakteryzować informację zawartą w DNA, RNA i białkach jako eksplanandum (fakt wymagający wyjaśnienia), a następnie ocenić skuteczność rywalizujących klas wyjaśnień pochodzenia informacji biologicznej (czyli rywalizujących eksplanansów). W części I postaram się wykazać, że biologowie molekularni stosowali termin informacja konsekwentnie w odniesieniu do łącznych właściwości złożoności i funkcjonalnej specyficzności lub specyfikacji. W części II ocenię rywalizujące rodzaje wyjaśnień pochodzenia wyspecyfikowanej informacji biologicznej, koniecznej do wytworzenia pierwszego układu żywego. Część II obejmie także krytykę adekwatności przyczynowej teorii ewolucji chemicznej, opartych na „przypadku”, „konieczności” i na mieszance tych dwu. W konkludującej części III zawrę sugestię, że zjawisko informacji rozumianej jako wyspecyfikowana złożoność wymaga radykalnie odmiennego ujęcia eksplanacyjnego. Będę w szczególności argumentował, że nasza aktualna wiedza na temat sił przyczynowych nasuwa hipotezę inteligentnego projektu jako lepsze, bardziej adekwatne przyczynowo wyjaśnienie powstania wyspecyfikowanej złożoności (zdefiniowanej tak informacji), występującej w dużych molekułach biologicznych, takich jak DNA, RNA i białka.

Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document