Environmental change and copper uptake by Bacillus subtilis subsp. niger and by Pseudomonas fluorescens

1981 ◽  
Vol 3 (3) ◽  
pp. 137-142 ◽  
Author(s):  
M. G. C. Baldry ◽  
A. C. R. Dean
2016 ◽  
Vol 4 (4) ◽  
Author(s):  
Daniel R. Reuß ◽  
Andrea Thürmer ◽  
Rolf Daniel ◽  
Wim J. Quax ◽  
Jörg Stülke

Bacillus subtilis ∆6 is a genome-reduced strain that was cured from six prophages and AT-rich islands. This strain is of great interest for biotechnological applications. Here, we announce the full-genome sequence of this strain. Interestingly, the conjugative element ICE Bs 1 has most likely undergone self-excision in B. subtilis ∆6.


2009 ◽  
Vol 74 (5) ◽  
pp. 543-548 ◽  
Author(s):  
A. S. Shashkov ◽  
N. V. Potekhina ◽  
S. N. Senchenkova ◽  
E. B. Kudryashova

2020 ◽  
Vol 16 (1) ◽  
pp. 37-48
Author(s):  
Ratna Sari Dewi ◽  
Giyanto Giyanto ◽  
Meity Suradji Sinaga ◽  
Dadang Dadang ◽  
Bambang Nuryanto

Saat ini teknologi pengendalian hayati penyakit utama padi terus berkembang. Dalam pengembangan teknologi pengendalian hayati, mekanisme penghambatan patogen dalam perkembangan penyakit pada suatu populasi tumbuhan dalam area tertentu menjadi hal yang penting. Penelitian bertujuan mendapatkan bakteri agens hayati potensial dalam pengendalian penyakit penting padi di antaranya yang disebabkan Pyricularia oryzae, Xanthomnas oryzae pv. oryzae, Rhizoctonia solani, Burkholderia glumae, dan Drechlera oryzae, berdasarkan mekanisme antagonisme, kemampuan menginduksi ketahanan dan mendukung kebugaran tanaman, serta kompatibilitas antaragens hayati. Ralstonia pickettii TT47, Pseudomonas fluorescens P12, Chromobacterium sp. T51118, Bacillus subtilis 451 dan 154, serta Streptomyces sp. T51105 dibuktikan memiliki mekanisme antibiosis dengan menghasilkan metabolit sekunder dan senyawa volatil. Berdasarkan uji produksi enzim kitinolitik Chromobacterium sp. dan Streptomyces sp. memiliki mekanisme lisis. Aktivitas antibiotik R. pickettii dan P. fluorescens tergolong kuat terhadap P. oryzae dengan penekanan secara berurutan sebesar 79.68% dan 77.59% pada uji biakan ganda. Penekanan pertumbuhan miselium P. oryzae dan R. solani pada uji volatil mencapai 100% oleh Chromobacterium sp. Semua agens hayati umumnya mampu menginduksi ketahanan dan mendukung kebugaran tanaman. Uji kompatibilitas menunjukan R. pickettii, P. fluorescens, dan Chromobacterium sp. bersifat kompatibel. Dari hasil penelitian diperoleh tiga bakteri agens hayati dengan kategori unggul, yaitu P. fluorescens P12, R. pickettii TT47, dan Chromobacterium sp. T51118. Ketiganya mampu menekan pertumbuhan patogen, menginduksi ketahanan dan mendukung kebugaran tanaman, memiliki patogen sasaran yang lebih beragam, serta bersifat kompatibel.


Author(s):  
Umeh Odera Richard ◽  
E. I. Chukwura ◽  
Ibo Eziafakaego Mercy

A fish pond with recommended water quality will produce healthy fishes. Fish ponds with poor water quality will cause fish mortality and outbreak of diseases to fish consumers. Physicochemical analysis was done using standard analytical methods, the total bacterial count was determined by dilution and membrane filtration techniques. Parasitological analysis was done using the centrifugation method. A total of fifteen well waters were sampled during wet season. Results showed that the temperature ranged from 27°C to 29°C, pH, 6.21 to 8.15; dissolved oxygen, 4.28 mg/l to 5.78 mg/l, electrical conductivity, 166.36 µs/cm to 394.00 µs/cm; total dissolved solids, 41 mg/l to 121 mg/l; total suspended solids, 1.00 mg/l to 19.40 mg/l; total solids, 42.00 mg/l to 140.4 mg/l; turbidity values, 7.01 NTU to 10.36 NTU; nitrate, 3.10 mg/l to 28.00 mg/l; total alkalinity, 36 mg/l to 91 mg/l; phosphate, 1.26 mg/l to 13.11 mg/l; sulphate, 0.39 mg/l to 4.37 mg/l; total chloride, 7.08 mg/l to 14.19 mg/l; carbonates, 1.33 mg/l to 2.35 mg/l; bicarbonates, 34.59 mg/l to 89.38 mg/l; total hardness, 25.31 mg/l to 53.04 mg/l; calcium hardness, 23.94 mg/l to 51.96 mg/l; magnesium hardness, 1.08 mg/l to 4.20 mg/l; total acidity, 2 mg/l to 22 mg/l; potassium, 0.04 mg/l to 2.23 mg/l; cadmium, 0.00 mg/l to 0.04 mg/l; lead, 0.01 mg/l - 0.16 mg/l; chromium, 0.00 mg/l - 0.03 mg/l; mercury was not detected, copper, 0.00 mg/l - 0.04 mg/l; arsenic, 0.00 mg/l - 0.02 mg/l; zinc, 0.00 mg/l to 0.02 mg/l; iron, 0.01 mg/l - 1.19 mg/l. The total bacterial counts ranged from 3.60-4.12 log cfu/ml; total coliforms, 14-46 cfu/100ml, Vibrio cholerae, 0-11 cfu/100ml; Vibrio parahaemolyticus, 0-15 cfu/100ml; faecal coliform, 1-9 cfu/100 ml; Acinetobacter calcoaceticus, 0-8 cfu/100 ml; Bacillus subtilis, 0-9 cfu/ml; Staphylococcus aureus, 0-5 cfu/ml; Pseudomonas aeruginosa, 0-12 cfu/100 ml; Pseudomonas fluorescens, 0-12 cfu/100 ml and Clostridium perfringens were not detected in any of the samples. Twelve bacterial species namely Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter calcoaceticus, Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Vibrio cholerae, Pseudomonas fluorescens, Pseudomonas aeruginosa, Proteus mirabilis, Vibrio parahaemolyticus, Bacillus subtilis, Shigella flexineri and Salmonella typhi were isolated and identified using standard analytical and molecular procedures. Parasites identified were Ichthyobodo species, Diplostomum species, Myxobolus species, Chilodonella species, Bothriocephalus species, Ambiphrya species and Leech species. Salmonella typhi had the highest frequency of isolation (20.63%) while Acinetobacter calcoaceticus and Staphylococcus aureus had the lowest frequency of isolation (2.83%). Ichthyobodo species had the highest frequency of isolation (21.43%) while Leech species had the lowest frequency of isolation (5.71%). Some of the physicochemical, bacteriological and parasitological parameters had values above World Health Organization admissible limits and therefore proper sanitary practices and water treatments must be employed to prevent epidemic among fish consumers.


2016 ◽  
Vol 23 (3) ◽  
pp. 244
Author(s):  
Hanudin Hanudin ◽  
Abdjad Asih Nawangsih ◽  
Budi Marwoto ◽  
Boedi Tjahjono

<p>Penyakit busuk lunak (PBL) yang disebabkan oleh Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum atau Pseudomonas viridiflava merupakan kendala utama dalam budidaya anggrek. Serangan patogen tersebut sangat merugikan petani, mengingat biaya investasi produksi anggrek tergolong tinggi. Oleh karena itu patogen tersebut harus dikendalikan menggunakan metode pengendalian yang ramah lingkungan, yaitu dengan mengaplikasikan biobakterisida berbahan aktif rizobakteri, seperti Bacillus subtilis dan Pseudomonas fluorescens. Tujuan penelitian ini ialah (1) mendapatkan komposisi bahan aktif dan bahan pembawa biobakterisida yang efektif mengendalikan penyakit busuk lunak pada anggrek Phalaenopsis, (2) mengetahui perubahan reaksi kimia formula biobakterisida dan pertumbuhan populasi bahan aktif (rizobakteri B. subtilis dan P. fluorescens) pada kondisi sebelum dan setelah difermentasikan, dan (3) mengetahui kompatibilitas antara B. subtilis, P. fluorescens, dan bahan pembawa biobakterisida. Percobaan dilaksanakan mulai Bulan Mei sampai dengan Desember 2009 di Laboratorium Bakteriologi Departemen Proteksi Tanaman, Institut Pertanian Bogor, dan Laboratorium Bakteriologi serta Rumah Kaca, Balai Penelitian Tanaman Hias, di Segunung, Cianjur, Jawa Barat. Ruang lingkup penelitian meliputi pembuatan propagul rizobakteri sebagai bahan aktif biobakterisida, pembuatan formula biobakterisida, uji viabilitas bahan aktif, dan uji kemangkusan biobakterisida pada tanaman anggrek di rumah kaca. Hasil penelitian menunjukkan bahwa (1) perlakuan gabungan antara B. subtilis B12 dan P. fluorescens Pf10 yang difermentasikan dalam media ekstrak kotoran cacing (kascing) dan molase, merupakan perlakuan yang konsisten dapat menekan PBL pada anggrek Phalaenopsis dengan persentase penekanan sebesar 80%, (2) reaksi kimia formula biopestisida pada kondisi sebelum dan setelah fermentasi diindikasikan dengan perubahan pH basal medium yang sebelum fermentasi menunjukkan pH 3,75 dan berubah menjadi pH 3,50 setelah difermentasikan. Pertumbuhan populasi mikrob antagonis setelah fermentasi meningkat secara signifikan bila dibandingkan pada kondisi sebelum difermentasikan, dan (3) isolat bahan aktif (B. subtilis dan P. fluorescens) bersifat kompatibel dengan bahan pembawanya (ekstrak kascing dan molase).</p>


2020 ◽  
Vol 13 (2) ◽  
Author(s):  
Karen Tatiana Chávez Arteaga ◽  
Jefferson Javier Guato Molina ◽  
Jorge Luis Rodríguez Acosta ◽  
Ángel Virgilio Cedeño Moreira ◽  
Ricardo Fernando Romero Meza ◽  
...  

El empleo de bio-controladores en la agricultura beneficia los aspectos fisiológicos en plantas, a diferencia de la constante aplicación de pesticidas en el cultivo del banano ha ocasionado la pérdida de la sensibilidad en M. fijiensis, reduciendo la microbiota del suelo. El objetivo se enfocó en caracterizar el potencial antagónico de las PGPR en inhibición de germinación de ascósporas y desarrollo micelial de M. fijiensis. Se realizaron cultivos monospóricos de M. fijiensis e identificado por PCR. Se evaluaron los extractos celulares de Pseudomonas putida PB3-6, Klebsiella variicola BO3-4, Enterobacter asburiae BA4-19, Serratia marcescens PM3-8, Enterobacter asburiae PM3-14, Pseudomonas protegens CHA0, Pseudomonas fluorescens WCS417, Pseudomonas veronii R4 y Bacillus subtilis ATCC 5540 para sus evaluaciones antagonistas: a) Inhibición del tubo germinativo de las ascósporas al 2% y b) Desarrollo micelial al (2 y 10 %). La PCR empleado en la identificación de M. fijiensis se confirma el producto de amplificación de 1018 pb. El factor antagónico de los extractos celulares al 2 % de PM3-14 y CHA0 inhibe sobre el 80 % al desarrollo de los tubos germinativos. La inhibición al desarrollo micelial del extracto celular al 2 %, de CHA0 logró una efectividad del 54 % y las cepas (PM3-8, PM3-14 y BA4-19) con (32, 26 y 26 %). Al 10 % del extracto de la cepa PM3-8 inhibe el desarrollo micelial con niveles de turbidez de 0,47 (OD600nm). El empleo de estos bio-controladores en la agricultura ofrecerá una alternativa para beneficiar en la reducción del uso de agroquímicos


Fermentation ◽  
2019 ◽  
Vol 5 (4) ◽  
pp. 92 ◽  
Author(s):  
Shouyong Ju ◽  
Zhilin Cao ◽  
Christina Wong ◽  
Yangyang Liu ◽  
Mohamed F. Foda ◽  
...  

Nattokinase is a serine protease in the subtilisin family which is produced by Bacillus subtilis subsp. natto and exhibits vigorous fibrinolytic activity that has been suggested to be able to prevent and treat thromboembolic diseases. In this study, WTC016, a spore-forming and rod-shaped bacterium with fibrinolytic activity was successfully isolated from soil, which was identified as Bacillus subtilis subsp. natto based on morphological and physiological tests, and phylogenetic analysis of 16S rRNA and gyrA. According to the growth curve of WTC016, the nattokinase production reached the highest amount in the stationary phase. To optimize the liquid fermentation condition for nattokinase yield of WTC016, further optimal tests of four factors, including the temperature, pH, inoculum size, and loading volume, followed by orthogonal test of all these factors, was performed. The optimal fermentation conditions were determined as 30 °C, 7.0 pH, 2% inoculum size, and 60 mL of loading volume in 250 mL conical flask, which indicates the highest nattokinase production of 3284 ± 58 IU/mL while fermented for 26 h. This work laid the foundation for producing nattokinase using Bacillus subtilis subsp. natto WTC016.


Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document