Circular plasmid DNAs from mitochondria of Sorghum bicolor

1985 ◽  
Vol 5 (5) ◽  
pp. 303-311 ◽  
Author(s):  
Christine D. Chase ◽  
Daryl R. Pring
Keyword(s):  
Sorghum Bicolor ◽  
Plasmid Dnas ◽  
Circular Plasmid

scholarly journals Intra-Molecular Homologous Recombination of Scarless Plasmid

2020 ◽  
Vol 21 (5) ◽  
pp. 1697
Author(s):  
Yaping Liang ◽  
Yu Zhang ◽  
Liangwei Liu
Keyword(s):  
Homologous Recombination ◽  
Efficient Method ◽  
Dna Amplification ◽  
Accurate Method ◽  
Accuracy Rate ◽  
Plasmid Construction ◽  
Plasmid Dnas ◽  
Circular Plasmid

Although many methods have been reported, plasmid construction compromises transformant efficiency (number of transformants per ng of DNAs) with plasmid accuracy (rate of scarless plasmids). An efficient method is two-step PCR serving DNA amplification. An accurate method is ExnaseII cloning serving homology recombination (HR). We combine DNA amplification and HR to develop an intra-molecular HR by amplifying plasmid DNAs to contain homology 5′- and 3′-terminus and recombining the plasmid DNAs in vitro. An example was to construct plasmid pET20b-AdD. The generality was checked by constructing plasmid pET21a-AdD and pET22b-AdD in parallel. The DNAs having 30-bp homology arms were optimal for intra-molecular HR, and transformation of which created 14.2 transformants/ng and 90% scarless plasmids, more than the two-step PCR and the ExnaseII cloning. Transformant efficiency correlated with the component of nicked circular plasmid DNAs of HR products, indicating nick modification in vivo leads to scar plasmids.

scholarly journals Densitometric quantification of DNA topoisomers in ethidium bromide-stained agarose gels and chemiluminescence-detected X ray films.

2000 ◽  
Vol 47 (3) ◽  
pp. 835-839 ◽  
Author(s):  
Z Topcu
Keyword(s):  
Ethidium Bromide ◽  
Band Intensity ◽  
Uv Exposure ◽  
Circular Dna ◽  
X Ray ◽  
Agarose Gels ◽  
Southern Blots ◽  
Plasmid Dnas ◽  
Circular Plasmid ◽  
The Relationship

This study investigates the contribution of deformational strain imposed by topological interconversions of DNA in ethidium bromide-binding on agarose gels. Closed-circular plasmid DNAs were nicked using UV exposure and the DNA bands were quantified by densitometry. The results show that the closed circular DNA binds the same amount of the dye as its nicked counterpart. The relationship between the band intensity on X-ray films of chemiluminescence-detected Southern blots and DNA concentration was shown to be linear.

Characterization and expression of dehydrins in water-stressed Sorghum bicolor

1997 ◽  
Vol 99 (1) ◽  
pp. 144-152 ◽  
Author(s):  
Andrew J. Wood ◽  
Peter B. Goldsbrough
Keyword(s):  
Sorghum Bicolor

Consórcio palma-sorgo sob lâminas de irrigação: balanço de água no solo e coeficientes da cultura

Agrometeoros ◽  
2020 ◽  
Vol 27 (2) ◽  
Author(s):  
Cleber Pereira Alves ◽  
Thieres George Freire Silva ◽  
Hygor Kristoph Muniz Nunes Alves ◽  
Alexandre Maniçoba da Rosa Ferraz Jardim ◽  
Luciana Sandra Bastos de Souza ◽  
...  
Keyword(s):  
Sorghum Bicolor ◽  
Sorghum Bicolor L

Objetivou-se neste estudo quantificar a evapotranspiração real (ETr) e máxima da cultura (ETc) e os coeficientes da cultura (Kc) do consórcio palma-sorgo. O experimento foi conduzido no município de Serra Talhada, PE. O delineamento usado foi em blocos ao acaso, envolvendo cinco lâminas de irrigação (0, 25, 50, 75 e 100% da evapotranspiração de referência - ETo), sob sistema de cultivo consorciado palma-sorgo. O clone de palma forrageira utilizado foi a Orelha de Elefante Mexicana (Opuntia stricta (Haw.) Haw.) e o cultivar de sorgo, Sorghum bicolor (L.) Moench, a SF 15. O sorgo foi conduzido durante dois ciclos (planta e rebrota) compreendidos em um ciclo anual da palma. A quantificação da ETr e da ETc foi realizada através do resíduo do balanço de água no solo (BAS) a cada 14 dias, com a mensuração dos componentes hidrodinâmicos. As determinações da ETc e do Kc foram realizadas com base na lâmina de 75% da ETo. Os componentes do BAS foram submetidos à análise de regressão, sendo testados modelos polinomiais. Com exceção da variação do armazenamento de água no solo, os demais componentes hidrodinâmicos do solo cultivado sob sistema consorciado palma-sorgo respondem linearmente ao aumento de lâminas de irrigação. A evapotranspiração média diária do consórcio palma-sorgo é igual a 3,0 mm dia-1, independentemente da lâmina de irrigação. Os coeficientes do consórcio palma-sorgo são iguais a 0,40, 0,68, 0,90 e 0,52 durante as fases I, II, III e IV de emissão de cladódios.

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