scholarly journals Regularized partial least squares with an application to NMR spectroscopy

2012 ◽  
Vol 6 (4) ◽  
pp. 302-314 ◽  
Author(s):  
Genevera I. Allen ◽  
Christine Peterson ◽  
Marina Vannucci ◽  
Mirjana Maletić-Savatić
PeerJ ◽  
2019 ◽  
Vol 7 ◽  
pp. e8151 ◽  
Author(s):  
Yan-Yan Liu ◽  
Zhong-Xian Yang ◽  
Li-Min Ma ◽  
Xu-Qing Wen ◽  
Huan-Lin Ji ◽  
...  

Background Esophageal squamous cell carcinoma (ESCC) is one of the most prevalent types of upper gastrointestinal malignancies. Here, we used 1H nuclear magnetic resonance spectroscopy (1H-NMR) to identify potential serum biomarkers in patients with early stage ESCC. Methods Sixty-five serum samples from early stage ESCC patients (n = 25) and healthy controls (n = 40) were analysed using 1H-NMR spectroscopy. We distinguished between different metabolites through principal component analysis, partial least squares-discriminant analysis, and orthogonal partial least squares-discriminant analysis (OPLS-DA) using SIMCA-P+ version 14.0 software. Receiver operating characteristic (ROC) analysis was conducted to verify potential biomarkers. Results Using OPLS-DA, 31 altered serum metabolites were successfully identified between the groups. Based on the area under the ROC curve (AUROC), and the biomarker panel with AUROC of 0.969, six serum metabolites (α-glucose, choline, glutamine, glutamate, valine, and dihydrothymine) were selected as potential biomarkers for early stage ESCC. Dihydrothymine particularly was selected as a new feasible biomarker associated with tumor occurrence. Conclusions 1H-NMR spectroscopy may be a useful tumour detection approach in identifying useful metabolic ESCC biomarkers for early diagnosis and in the exploration of the molecular pathogenesis of ESCC.


2020 ◽  
Vol 34 (5) ◽  
Author(s):  
Ana L. Leal ◽  
Ricardo M. Albuquerque ◽  
Artur M.S. Silva ◽  
Jorge C. Ribeiro ◽  
Fernando G. Martins

2005 ◽  
Author(s):  
Richard Mraz ◽  
Nancy J. Lobaugh ◽  
Genevieve Quintin ◽  
Konstantine K. Kakzanis ◽  
Simon J. Graham

Controlling ◽  
2020 ◽  
Vol 32 (3) ◽  
pp. 45-50
Author(s):  
Marc Janka

Gemeinhin gilt die Annahme, dass das Controlling für viele deutsche Unternehmen auch oder besonders in der Produktentwicklung von großer Bedeutung ist und vor allem unter Umfeldunsicherheit ein wesentlicher Erfolgsfaktor sein kann. Der vorliegende Beitrag zeigt unter Anwendung einer für die Controlling-Forschung neuartigen Methode zur Schätzung von Mischverteilungen mittels partieller Regressionen (englisch finite mixture partial least squares [FIMIX-PLS]), ob diese Annahme für alle Unternehmen gleichermaßen gilt.


Author(s):  
Joseph F. Hair ◽  
Sven Hauff ◽  
G. Tomas M. Hult ◽  
Nicole F. Richter ◽  
Christian M. Ringle ◽  
...  

2012 ◽  
Vol 61 (2) ◽  
pp. 277-290 ◽  
Author(s):  
Ádám Csorba ◽  
Vince Láng ◽  
László Fenyvesi ◽  
Erika Michéli

Napjainkban egyre nagyobb igény mutatkozik olyan technológiák és módszerek kidolgozására és alkalmazására, melyek lehetővé teszik a gyors, költséghatékony és környezetbarát talajadat-felvételezést és kiértékelést. Ezeknek az igényeknek felel meg a reflektancia spektroszkópia, mely az elektromágneses spektrum látható (VIS) és közeli infravörös (NIR) tartományában (350–2500 nm) végzett reflektancia-mérésekre épül. Figyelembe véve, hogy a talajokról felvett reflektancia spektrum információban nagyon gazdag, és a vizsgált tartományban számos talajalkotó rendelkezik karakterisztikus spektrális „ujjlenyomattal”, egyetlen görbéből lehetővé válik nagyszámú, kulcsfontosságú talajparaméter egyidejű meghatározása. Dolgozatunkban, a reflektancia spektroszkópia alapjaira helyezett, a talajok ösz-szetételének meghatározását célzó módszertani fejlesztés első lépéseit mutatjuk be. Munkánk során talajok szervesszén- és CaCO3-tartalmának megbecslését lehetővé tévő többváltozós matematikai-statisztikai módszerekre (részleges legkisebb négyzetek módszere, partial least squares regression – PLSR) épülő prediktív modellek létrehozását és tesztelését végeztük el. A létrehozott modellek tesztelése során megállapítottuk, hogy az eljárás mindkét talajparaméter esetében magas R2értéket [R2(szerves szén) = 0,815; R2(CaCO3) = 0,907] adott. A becslés pontosságát jelző közepes négyzetes eltérés (root mean squared error – RMSE) érték mindkét paraméter esetében közepesnek mondható [RMSE (szerves szén) = 0,467; RMSE (CaCO3) = 3,508], mely a reflektancia mérési előírások standardizálásával jelentősen javítható. Vizsgálataink alapján arra a következtetésre jutottunk, hogy a reflektancia spektroszkópia és a többváltozós kemometriai eljárások együttes alkalmazásával, gyors és költséghatékony adatfelvételezési és -értékelési módszerhez juthatunk.


Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document